Ensimmäistä kertaa, seuraavan sukupolven DNA sekvensointi teknologia on kytketty päälle lavantauti - tauti joka tappaa 600000 ihmistä vuosittain. Tulosten avulla voidaan parantaa diagnoosin, seuranta taudin leviämisestä ja voisi auttaa suunnittelemaan uusia strategioita rokotuksen.
Tutkimus asettaa uudet standardit analysoida kehitystä ja leviämistä sairauksia aiheuttavia bakteeri: se on ensimmäinen tutkimus useita näytteitä kaikista bakteeri taudinaiheuttajan tällä tarkkuudella. Se paljastaa aiemmin piilossa geneettinen allekirjoitukset kehitys yksittäisten suvusta Salmonella Typhi.
Tiimi kehitti menetelmiä, joita käytetään tyypin taudinpurkauksia, ja tutkijat voivat tunnistaa yksittäiset organismit, jotka leviävät väestöön: Google Earth, puhkeamista voidaan helposti visualisoida. Tiimi toivoo, että nämä karttatiedot voidaan kohdistaa rokotuskampanjat paremmin kanssa tarkoituksenaan poistaa lavantautiin.
Toisin kuin useimmat liittyvät Salmonella lajeja, ja toisin kuin monet muut bakteerit, Typhi löytyy vain ihmisillä ja genomien kaikki bakteerit ovat pinnallisesti hyvin samankaltaisia, vaikeuttaa yrittää seurata infektioita tai kirjoittaa yleisempiä variantteja. Yksityiskohtaisesti uuden tutkimuksen muuttaa tutkijoiden valmiuksiin puuttua Typhi.
"Moderni genomin menetelmiä voidaan kehittää vastauksia sairauksia, jotka ovat vaivanneet ihmisten monta vuotta", kertoo professori Gordon Dougan lähtien Wellcome Trust Sanger-instituutin ja vanhempi kirjailija tutkimuksessa. "Genomit ovat perintö organismin olemassaolon, osoittaa polkuja se on tehnyt ja reitti se on. Analyysin mukaan olemme ehkä löytäneet Typhi n Akilleen kantapää: sopeutumisessa yksinomaan ihmisen elämäntapa, se on itsetyytyväisyyteen, sen genomia ollaan geneettinen rappeutuminen ja se on menossa ylös evoluution umpikujaan ihmisillä.
"Uskomme, että yhdenmukaistetut rokotusohjelmat yhdistettynä epidemiologisissa tutkimuksissa, joilla pyritään jäljittämään ja hoitoon harjoittajille, voitaisiin käyttää hävittää lavantauti kuin tauti."
On 17 miljoonaa tapausta lavantautiin vuosittain - vaikka WHO varoittaa, että tämä on "hyvin konservatiivinen" arvio. Nuoret ovat suurimmassa vaarassa: Indonesian, yhdeksän kymmenestä tapauksissa esiintyy 3-19-vuotiaista.
"Avain selviytymiseen Salmonella Typhi on sen kyky valehdella vaiettu harjoittajat, jotka eivät osoita oireita, mutta voitava edelleen tartuttaa muita", sanoo Kathryn Holt, PhD opiskelija Wellcome Trust Sanger-instituutin ja ensimmäinen kirjoittaja tutkimuksessa. "Uusi työkalut auttavat meitä jäljittämisessä lähde lavantauti puhkeamisen, mahdollisesti jopa tartunnan harjoittajille, joiden avulla kyseiset henkilöt voivat hoitaa sen leviäminen voidaan estää taudin.
"Käyttämällä geenien biologia Tämän tutkimuksen, voimme nyt tyyppi Typhi, tunnistaa kanta, joka aiheuttaa infektio, tunnistaa harjoittajien ja suora rokotusohjelmia tehokkaimmin. Se on huomattava askel eteenpäin."