基因組測序研究揭示了新的遺傳傷寒簽名

首次下​​一代DNA測序技術已經轉向傷寒論 - 一種疾病，每年造成600,000人死亡。的結果將有助於提高診斷，跟踪疾病的傳播，並能夠幫助設計新的疫苗接種戰略。

這項研究分析致病細菌的進化和傳播的一個新標準設置：這是第一項研究中的多個樣品的任何細菌病原體在這個級別的詳細信息。它揭示了傷寒沙門氏菌的個人譜系的演變，以前隱藏的遺傳特徵。

該小組開發了正在使用的類型暴發的方法，使研究人員能夠識別生物個體，在人口中傳播：使用“Google地球”，爆發可以很容易地可視化。該小組希望這些數據映射可用於目標與目的是消滅傷寒疫苗接種運動，更成功。

與最相關的沙門氏菌，而在許多其他細菌相比，傷寒是發現，只有在人類和所有的菌株的基因組是表面上極為相似，妨礙試圖跟踪感染或類型較普遍的變種。新的研究的詳細轉換能力的研究人員解決傷寒。

“現代基因組學方法可用於發展多年來一直困擾人類的疾病的答案，解釋說：”戈登教授豆干從威康信託基金會桑格研究所和研究的資深作者。 “基因組是一個有機體的存在遺留下來的，說明了它所採取的路徑和它是對的路由這一分析表明我們可能已經發現傷寒的致命弱點：。適應專門人類的生活方式，它已成為自滿，它的基因組正經歷著遺傳衰減，它的標題在人類進化的死胡同。

“我們相信，協調一致的疫苗接種方案，結合流行病學研究，旨在追查和處理運營商可以用來作為一種疾病，以消除傷寒。”

傷寒的情況下，每年有1700萬 - 雖然世界衛生組織警告說，這是一個“非常保守”的估計。青少年是最危險的：在印度尼西亞，10例中的9個發生在3 - 19歲。

“傷寒沙門氏菌生存的關鍵在於運營商，沒有出現任何症狀，但仍然能夠傳染給他人處於休眠狀態的能力，說：”凱瑟琳霍爾特，在威康信託基金會桑格研究所和研究的第一作者，博士研究生。 “我們的新的工具將協助我們在追查傷寒爆發的根源，甚至可能受感染的載體，讓那些人來對待，以防止疾病的進一步蔓延。

“使用這項研究的基因組生物學，我們現在可以鍵入傷寒，確定是造成感染的菌株，確定最有效的載體和直接接種方案，這是一個了不起的的一步。”

這項研究是一個在威康信託基金會桑格研究所，大學，科克，在巴黎的巴斯德研究所和牛津大學臨床研究部，越南胡志明市，的研究人員之間的協作。該小組研究了來自十個國家的19株傷寒，使用新的測序方法，這意味著他們可以捕捉到這個倔強的基因組中罕見的遺傳變異信號。他們生產了超過 17億個字母的基因序列，發現少於 2000突變事件的證據，表明至少15000年前出現以來，傷寒很少演變。

他們的分析表明，傷寒沙門菌基因組是腐爛的 - 因為它變得更加密切的盟國，其人類宿主，這是失去的基因是多餘的，在人體生命。更重要的是，基因含有的蛋白質 - 細菌表面上的指示，那些最經常被我們的免疫系統防禦攻擊 - 變化比大多數其他細菌基因相當於少得多，表明傷寒有選擇性的策略，以規避我們的免疫系統的壓力。

“基因組和彌補傷寒表面的蛋白質 - 疫苗的目標 - 令人驚訝的變化不大，說：”教授，病原基因組學負責人朱利安帕克希爾。 “我們已經能夠使用新技術，發展，為人類基因組變異的分析，以確定這種變化：這將是不可能的，一年前我們在這裡已經開發的技術也可以對其他的戰鬥中使用的疾病。致病細菌。“

霍爾特卡拉OK等。 （2008）高通量測序到傷寒沙門氏菌基因組變異和進化提供的見解。 “自然遺傳學”，可在網上提前出版印刷上週日 27日2008年6月
http://dx.doi.org/ 10.1038/ng.195

http://www.wellcome.ac.uk/