I løpet av det siste tiåret, har microRNAs dukket litt overraskende som sentrale aktører i måten genene er regulert. Disse korte utdrag av RNA gjøre sitt arbeid ved å samhandle med messenger RNA, som fungerer som blåkopier for protein skaperverket.
Men fordi hver mikroRNA kan målrette hundrevis av messenger RNA-og det har ikke vært klart hvor effektivt det mål hver av disse messenger RNA-forskere ikke har kunnet vurdere den ultimate effekten av microRNAs på protein produksjon.
Nå, i den første store studien av sitt slag, forskere ved Whitehead Institute og Harvard Medical School har sett mer omfattende på protein produksjon av gener målrettet av bestemte microRNAs. Resultatene er rapportert i 30 juli 2008 online utgave av Nature.
"Dette er første gang en storstilt datasett har blitt brukt til å observere effekten av microRNAs på produksjon av tusenvis av proteiner", sier Whitehead Medlem og Howard Hughes Medical Institute Investigator David Bartel, som er co-senior forfatter på studien. "Tidligere teknologi mulig for oss å bare se på hvordan microRNAs påvirke messenger RNAS. Det har gitt oss viktig informasjon om deres engasjement i den første fasen av protein oversettelse, men ikke deres ultimate effekt på genuttrykk."
Studien bekrefter at microRNAs typisk finjustere protein produksjon, gir mye mindre undertrykkende effekt enn det som har vært sett på noen transkripsjonsfaktorer, proteiner som også kan fungere som genet regulatorer. Studien viser også at microRNAs hovedsakelig opererer med nedverdigende target budbringer RNA i stedet for bare å kaste en skiftenøkkel i protein oversettelse.
I tillegg viste forskerne at microRNAs produsere sine størst effekt når de samhandler med en bestemt del av messenger RNA molekyl som ikke koder for proteiner.
Arbeide i samarbeid med laboratoriet på co-senior-forfatter Steven Gygi, førsteamanuensis i cellebiologi ved Harvard Medical School, introduserte Bartel lab individuelle microRNAs inn menneskeceller og deretter brukt kvantitative massespektrometri å måle den resulterende endringer i protein nivåer.
I tillegg arbeider med Whitehead Fellow Fernando Camargo, brukte forskerne en knockout mus modell mangler en enkelt mikroRNA (mikroRNA-223) er kjent for å påvirke produksjon og funksjon av hvite blodlegemer kalt nøytrofile granulocytter. Forskere så målt og sammenlignet protein nivåer av nøytrofile fra normale mus og mus mangler mikroRNA-223.