Aan het licht gebrachte de handtekeningen van Kanker

Een nieuwe systematische analyse van het verband tussen neoplastic en ontwikkelingstranscriptome verstrekt een overzicht van tendensen in de uitdrukking van het kankergen. Het onderzoek, onlangs in van het de toegangsdagboek van Biomed de Centrale open Biologie van het Genoom wordt gepubliceerd, beschrijft hoe kanker in drie groepen kunnen worden verdeeld voornaam door ongelijksoortige ontwikkelingshandtekeningen die.

Isaac S Kohane van het Ziekenhuis Boston van Kinderen en de Universiteit van Harvard, de V.S., leidde een team van onderzoekers die een uitvoerige die vergelijking van genen uitvoerden in vroege ontwikkelingsstadia van diverse menselijke weefsels en die wordt uitgedrukt uitgedrukt in verschillende kanker die deze weefsels beïnvloeden. Hij zegt, „Onze studie openbaart potentieel klinisch relevante verschillen in de genuitdrukking van verschillende kankertypes en vertegenwoordigt een verwijzingskader voor interpretatie van kleinschaliger functionele studies“.

Één van drie beschreef groepen kanker heeft een vroeg ontwikkelingsfenotype en uitdrukt genen die van stamcellen kenmerkend zijn. Vanuit een ontwikkelingsperspectief, zeer homogeen voor stelt deze groep. Een seconde, neigt meer heterogeene groep meer gelijkaardig aan recente ontwikkeling te zijn en door een ontstekingshandtekening gekenmerkt. Het derde is een kleine groep kanker dat heden als overgangsfenotype tussen deze twee uitersten en toont beide kenmerken.

Volgens Kohane, „Deze scheiding van tumors in drie groepen met verschillende uitdrukkingspatronen is verrassend. Duidelijk, verstrekt de ontwikkelingsbaan een zinvolle achtergrond voor het vangen van verschillen op grote schaal in genuitdrukking over diverse voorwaarden“.

De resultaten van de studie zullen naar een beter inzicht in menselijke ziekte van een „macrobiological“ benadering van het analyseren van hoog-productiegegevens leiden. Volgens de auteurs, „Verplaatsen van onze nadruk van enige reeksen genen of processen naar de biologie van complexen op de orde van volledige transcriptome zal waarschijnlijk nuttig zijn in het vestigen van hoogst robuuste moleculaire correlaties tussen schijnbaar niet verwante ziektefenotypes“.

http://genomebiology.com/2008/9/7/R108