Nowotworów podpisy odkrywający

Nowa systematyczna analiza związek między nowotworowym i rozwojowym transcriptome zapewnia kontur trendy w nowotworu genu wyrażeniu. Badanie, publikujący ostatnio w BioMed centrali otwartego dostępu czasopisma genomu biologii, opisuje jak nowotwory mogą dzielący w trzy grupy odróżniającej rozbieżnymi rozwojowymi podpisami.

Isaac S Kohane od Children szpitala Boston i uniwersyteta harwarda, USA, prowadził drużyny badacze które wykonywali całościowego porównanie geny wyrażający w wczesnych rozwojowych scenach różnorodne ludzkie tkanki i tamto wyrażający w różnych nowotworach wpływa te tkanki. Mówi, "Nasz nauka wyjawia potencjalnie clinically istotne różnicy w genu wyrażeniu różni nowotworów typ i reprezentuje odniesienie strukturę dla interpretaci na mniejszą skalę czynnościowi studia".

Jeden trzy opisującej grupy nowotwory wczesnego rozwojowego fenotyp i wyraża geny które są osobliwie komórki macierzyste. Od rozwojowej perspektywy, ten grupa przedstawia bardzo homogeneously. Sekunda miewa skłonność być jednakowa opóźniony rozwój i charakteryzuje podżegającym podpisem, heterogeniczna grupa. Tercja jest małym grupą nowotwory które przedstawiają jako przemiana fenotyp między te dwa ekstremami i wystawia oba właściwości.

Według Kohane, "Ten segregacja bolaki w trzy grupy z odrębnymi wyrażeniowymi wzorami zaskakuje. Wyraźnie rozwojowa trajektoria zapewnia znacząco tło dla chwytać na dużą skalę różnicy w genu wyrażeniu przez różnorodnych warunki".

Nauka rezultaty prowadzą w kierunku lepszy zrozumienia ludzka choroba od "macrobiological" podejścia analizować przepustowość dane. Według autorów, "Przesuwać nasz ostrość od pojedynczych setów geny lub procesów biologia agregaty na rozkazie całkowity transcriptome jest prawdopodobny być pożytecznie w ustanawiać wysoce krzepko cząsteczkowe korelacje między pozornie niepowiązanymi choroba fenotypami".

http://genomebiology.com/2008/9/7/R108