I ricercatori di Johns Hopkins riferiscono la scoperta dei regolatori principali di un gene critico all'essere umano e di tutto lo sviluppo mammifero pescando a strascico, abbastanza incoerente, con le sequenze genetiche anonime facendo uso degli embrioni minuscoli di zebrafish.
In un articolo nell'emissione di Settembre della Genetica di PLoS, essi e un gruppo degli scienziati di governo descrivono gli esperimenti che hanno identificato i bit del DNA “di non codifica„ conosciuto come le sequenze del rinforzatore che non portano una cianografia per una proteina ma invece, in questo caso, regolamentano un gene inerente allo sviluppo molto specializzato.
Quel gene, SOX10, codici per i prodotti essenziali per la fabbricazione della cresta neurale, un gruppo di celle che si formano alla cima di uno spinale cavo--è e poi migra in tutto l'organismo di formare un'ampia varietà di tessuti. Quando il macchinario genetico che gestisce lo sviluppo neurale della cresta va storto, le malattie umane possono risultare; per esempio, Hirschsprung, un disordine inerente allo sviluppo caratterizzato da un'assenza di cellule nervose nell'intestino cui contribuisca a muovere lo spreco attraverso e dall'organismo.
Che gli scienziati hanno identificato le sequenze regolarici mammifere verificandole in zebrafish - creature con le spine dorsali ma separate dagli esseri umani entro diverse centinaia milione anni di evoluzione - preannuncia bene, dicono, come strumento molto più semplice che i modelli standard del mouse per lo studio gli angoli e dei crannies profondi del regolamento umano del gene.
“La strategia di zebrafish è, almeno per questo gene, un sostituto ad alta fedeltà per analizzare le sequenze regolarici mammifere difficili da trovare,„ dice Andy McCallion, Ph.D., un assistente universitario nel pathobiology molecolare e comparativo e membro dell'Istituto di McKusick-Nathans per Medicina Genetica alla Scuola di Medicina di Johns Hopkins University.
“Lo scopo è di leggere l'intero genoma come un libro comprensibile, non appena lettere e parole casuali,„ McCallion dice “Accordato, le sequenze regolarici noncoding colte un po'più simile a James Joyce che Hemingway, ma guadagnare la comprensione è ben più facile in zebrafish trasparenti perché possiamo realmente studiare più prontamente lo sviluppo embrionale nei corti periodi di tempo. Fortunatamente, le sequenze regolarici sono altamente simili dalle specie una al seguente, in modo da otteniamo ad una barriera entrambi i modi.„
Strano sebbene possa sondare, non è i vostri geni che glie l'rendano così tanto poichè è sequenze regolarici che gestiscono i geni che fanno le proteine. Girando i geni in funzione e a riposo in diversi momenti e nelle condizioni in via di trasformazione, questi interruttori generali sono alla base della diversità delle cellule istruendole, malgrado trucco genetico identico, per differenziarsi in tutti i vari generi di celle che compongono un organismo.
Poiché un mouse divide più di 95 per cento dei sui geni con un essere umano, è un modello ovvio in cui studiare i geni mammiferi. Ma McCallion non è stato convinto che i mouse fossero un modo conveniente scoprire i rinforzatori di SOX10, una delle sequenze regolarici innumerevoli che rimangono sotto il radar delle analisi di selezione computerizzate correnti. Così il gruppo ha usato gli zebrafish, un animale abbondante, economico e trasparente che permette l'osservazione in tempo reale facile della cresta neurale in embrioni di sviluppo.