מחשבים המשמשים ליצירת מודלים חזוי של מחלות אנושיות

שימוש מוגבר של מחשבים כדי ליצור מודלים חזוי של מחלות אנושיות צפוי בעקבות הסדנה מאורגנת על ידי קרן המדע האירופית (ESF) , אשר קרא למאמץ משותף בין מומחים בתחום.

מחקר מחלת האדם מייצר כמות עצומה של נתונים ממקורות שונים כגון במודלים של בעלי חיים, גבוה סריקות גנטיות התפוקה של הרקמה האנושית, בניסויים במבחנה במעבדה. נתונים זה פועל ברמות שונות, כולל קשקשים גנים, מולקולות, תאים, רקמות ואיברים שלמים, המגלמת כמות עצומה של תובנה חשובה שעשויה הנוכחית דוגמנות גישות המחשב לעיתים קרובות אינם מצליחים לנצל כראוי.

עם זאת, התקדמות משמעותית מודלים של מחלות ספציפיות מעטים, כמו טרשת נפוצה (MS), נעשו. מטרתה העיקרית של הסדנה היה ESF ובכך להכליל עבודה כזו וליצור גוף קוהרנטי יותר של מומחיות על פני השדה שלם של המחלה ניתוח חישובית, על פי אלברט Compte, שיתוף convenor הסדנה ESF, מבסיסי חישובית הפיזיולוגי של מעבדה רשתות קליפת המוח על Institut d'Investigacions Biomèdiques אוגוסט Pi Sunyer (IDIBAPS) בברצלונה. "סדנה כמו זה היה מועיל לראות איך ההתקדמות בתחומי מחקר אחרים יכולים לשמש יותר בדרך כלל עבור מודלים המחלה", אמר Compte. "עד כה, דוגמנות גישות חדשות כבר מוגבלת למחלה מסוימת או רמה מסוימת של התיאור".

המודל יכול להיות מוגבל רק ברמה המולקולרית או את רמת הסלולר למשל. הסדנה ESF הדגיש את היתרונות שניתן לקבל שילוב נתונים ברמות שונות. זה יכול לספק מודלים מפורטים יותר גמישה, עם כוח גדול יותר כדי לזהות את הגורמים למחלות לחזות מרפא אפשרי בעתיד.

עם זאת, בעיה אחת פוטנציאל בעת בניית מודלים מתוחכמים ההפעלה המחלה ברמות שונות היא כי הם יכולים להיות מורכב מדי, עם היעדר נתונים מספיקים לניתוח כל תועלת. זה יכול להיפתר על ידי בחירת מודל פשוט שמתאים רק על נתונים ניסיוניים, כי אכן קיים. נציגים בסדנה שמע איך במקרה של טרשת נפוצה, מבחר של המודל יכול להיות מכוון את הנתונים, כדי להפוך את השימוש הטוב ביותר את תוצאות הניסוי בפועל שהושגו במחקר מסוים, כפי שהוסבר על ידי Jesper טנגר, עוד שיתוף convenor של ESF הסדנה, מן טרשת עורקים יחידת המחקר במכון קרולינסקה המרכז לרפואה מולקולרית (CMM) בשטוקהולם, שבדיה.