Bioinformatiklektoren tragen Nichtgraduierte ein, um DNS-Anmerkungsherausforderung zu bewältigen

Im Punkt dieser Woche von PLoS-Biologie, beschreiben ein Team von den Marseille-Hochschullektoren, die von Pascal Hingamp geführt werden, das Annotathon - einen innovativen Bioinformatikunterrichtsanflug, der Nichtgraduiertbiologiestudenten appelliert.

Mit einem zunehmenden Interesse am metagenomics - die Decodierung nicht gerade eines einzelnen Genoms, aber des gesamten Mikrobenökosystems - die Menge von den vorgelegten Daten ist mehr, als ein Biologe mit aufrechterhalten kann. Deswegen wird Bioinformatik - der Gebrauch von Computertechniken, biologische Daten aufzubereiten - populärer. Das Annotathon-Unterrichtsystem zielt darauf ab, ein Netz von Lehrling bioinformaticians auszubilden, die Berater im Ozean von Daten können, die täglich erzeugt wird.

Diese Methode bittet Studenten, unbekannte metagenomic DNS-Fragmente von einem wirklichen Forschungsreihenfolgenvorrat nach dem Zufall auszuwählen und zu analysieren. Der Auftrag von des Studenten, unter Verwendung des Internets bearbeitet nur, ist, von, welchem Organismus herauszufinden die DNS kommt hätte und welche biologische Funktion sie möglicherweise. Sowie die Gewinnung des Vertrauens und der Leistungsfähigkeit in der Bioinformatik, erfahren Studenten den authentischen Forschungsprozeß des Wiegens der Argumente, des Festlegens von Vorhersagenzuverlässigkeit, von aufbauenden Hypothesen und des Beibehaltens der rigorosen Darlegung.

Das Lassen des gut getretenen Pfades der eingemachten Übungen entkräftet für Lehrer, aber das unterrichtende Ergebnis ist wert die Bemühung wohl. „Ich habe beide mit meinen Studenten getan: das Prionsprotein Jahr für Jahr neu analysieren und für diese total unvorhersehbaren Stücke DNS tauchend,“ sagt Hingamp, der die Annotathon-Software entwickelte. „Es ist harte Arbeit, aber die wirklichen Spaßlügen auf der unbekannten Seite. Die Aufregung ist ansteckend.“ Die Studenten, völlig bewusst ihren Erforschungen am Rand von Kenntnissen und ohne Sicherheitsnetz, werden der Herausforderung gerecht und produzieren Qualitätsarbeit. Tatsächlich prüft ihre Ausgabe gutes genug, in die allgemeine Datenbanken verwendete Tageszeitung von den Forschern rückgewirkt zu werden.

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