Dosen bioinformatika meminta lulusan sarjana untuk mengatasi tantangan DNA penjelasan

Dalam edisi minggu ini dari PLoS Biology, sebuah tim dari dosen Universitas Marseilles yang dipimpin oleh Pascal Hingamp, menggambarkan Annotathon - sebuah pendekatan pengajaran yang inovatif bioinformatika yang menarik bagi mahasiswa biologi sarjana.

Dengan meningkatnya minat dalam metagenomics - decoding tidak genom hanya satu, tapi seluruh ekosistem mikroba - jumlah data yang dihasilkan lebih dari ahli biologi dapat bersaing dengan. Karena itu, Bioinformatika - penggunaan teknik komputer untuk memproses data biologis - menjadi lebih populer. Sistem pengajaran Annotathon bertujuan untuk melatih jaringan bioinformaticians magang, yang bisa ajudan dalam lautan data yang dihasilkan setiap hari.

Metode ini meminta siswa untuk secara acak memilih dan menganalisis fragmen DNA yang tidak diketahui metagenomic dari persediaan urutan penelitian yang sesungguhnya. Misi siswa, menggunakan alat internet saja, adalah untuk mencari tahu dari mana organisme berasal dari DNA, dan apa fungsi biologis itu mungkin. Serta mendapatkan kepercayaan diri dan kecakapan dalam bioinformatika, siswa mengalami proses penelitian otentik menimbang argumen, prediksi kehandalan membangun, membangun hipotesis, dan mempertahankan wacana ketat.

Meninggalkan jalan yang menginjak-injak latihan kaleng mengerikan bagi instruktur, tapi hasil pengajaran yang bernilai baik usaha. "Saya sudah melakukan baik dengan mahasiswa saya: kembali menganalisis protein prion tahun demi tahun, dan menyelam untuk potongan-potongan DNA sangat susah ditebak," kata Hingamp yang mengembangkan perangkat lunak Annotathon. "Ini kerja keras, tapi menyenangkan sesungguhnya terletak pada sisi yang tidak diketahui Kegembiraan adalah penangkapan.." Siswa, menyadari sepenuhnya eksplorasi mereka di tepi pengetahuan, dan tanpa jaring pengaman, hidup sampai tantangan dan menghasilkan kualitas kerja yang tinggi. Bahkan, output mereka membuktikan cukup baik untuk diberi makan kembali ke database publik yang digunakan sehari-hari oleh peneliti.

http://www.plos.org/