I conferenzieri di Bioinformatica arruolano gli studenti non laureati per affrontare la sfida di annotazione del DNA

Nell'emissione di questa settimana di Biologia di PLoS, un gruppo dei conferenzieri dell'Università di Marsiglia piombo da Pascal Hingamp, descrive il Annotathon - un approccio innovatore di insegnamento di bioinformatica che fa appello a agli studenti di biologia dello studente non laureato.

Con un interesse aumentante in metagenomics - il decodifica non appena di un genoma singolo, ma di intero ecosistema microbico - la quantità di dati redatti è più di un biologo può continuare con. A causa di questo, la Bioinformatica - l'uso delle tecniche di computer elaborare i dati biologici - sta diventando più popolare. Il sistema di insegnamento di Annotathon mira a preparare una rete dei bioinformaticians dell'apprendista, che possono aiutante nell'oceano dei dati che sono generati su base giornaliera.

Questo metodo chiede agli studenti di selezionare ed analizzare a caso le Sequenze di DNA metagenomic sconosciute da una riserva reale di sequenza della ricerca. La missione dello studente, facendo uso di Internet foggia soltanto, è di capire da quale organismo il DNA viene e che funzione biologica potrebbe avere. Così come il guadagno la fiducia e della competenza in bioinformatica, gli studenti avvertono il trattamento autentico della ricerca di pesatura degli argomenti, dell'instaurazione l'affidabilità di previsione, delle ipotesi di costruzione e del mantenimento del discorso rigoroso.

Lasciare il percorso bene percorso degli esercizi inscatolati è terrificante per gli istruttori, ma il risultato d'istruzione è buono degno lo sforzo. “Ho fatto entrambi con i miei studenti: analizzando nuovamente la proteina del prione anno dopo anno e tuffandosi per questi pezzi di DNA completamente imprevedibili,„ dice Hingamp che ha sviluppato il software di Annotathon. “È duro lavoro, ma le bugie reali di divertimento dal lato sconosciuto. L'eccitazione sta catturando.„ Gli Studenti, ben consapevoli delle loro prospezioni al limite di conoscenza e senza rete di sicurezza, vivono fino alla sfida e producono il lavoro di alta qualità. Infatti, il loro output prova abbastanza buon essere retroagito nel quotidiano usato database pubblici dai ricercatori.

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