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生物情報学の講演者によっては DNA の注釈の挑戦に取り組むために大学生が入隊します

Published on November 24, 2008 at 9:33 PM · No Comments

今週の PLoS の生物学の問題ではパスカル Hingamp によって導かれるマルセーユ大学講演者のチームは Annotathon - 大学生の生物学学生に訴える革新的な生物情報学の教授アプローチ -- を記述します。

metagenomics の増加する興味 - ちょうど単一のゲノムの、しかし全体の微生物生態系の解読によって - 作り出されるデータの量は生物学者がに遅れずについていくことができるより多くです。 このような理由で、生物情報学 - 生物的データを処理するコンピュータ技術の使用 - は普及するようになっています。 Annotathon の教授システムは毎日生成されるデータの海洋の補佐官できる徒弟 bioinformaticians のネットワークをトレインすることを向けます。

この方法は学生に任意に実質の研究シーケンス備畜品からの未知の metagenomic DNA のフラグメントを選び、分析するように頼みます。 インターネットを使用して学生の代表団は、どの有機体からから把握することです DNA が来、どんな生物的機能があるかもしれませんか、ただ用具を使います。 生物情報学の信任そして実力を得ることと同様、学生はアーギュメントの重量を量る、予言の信頼性、構築の仮説を確立し、厳密な会話を維持する確実な研究プロセスを経験します。

缶詰にされた練習のよく踏まれた経路を残すことは教官のために狼狽していますが、教授の結果は努力の価値が充分あります。 「私は私の学生との両方をしました: プリオン蛋白質を年々再分析し、 DNA のこれらの全く予測不可能な部分のために潜ります」、 Annotathon のソフトウェアを開発した Hingamp を言います。 「それは未知の側面のハードワーク、しかし実質の楽しみのうそであり。 興奮はです伝染性」。 知識の、そして安全策無しの端で彼らの調査を十分に把握している学生は挑戦に沿い、良質作業を作り出します。 実際は、出力は研究者によって公共のデータベースによって使用される日刊新聞に反映されるには十分によい証明します。

http://www.plos.org/