Os conferentes da Bioinformática recrutam undergrads para abordar o desafio da anotação do ADN

Na introdução desta semana da Biologia de PLoS, uma equipe dos conferentes da Universidade de Marselha conduzidos por Pascal Hingamp, descreve o Annotathon - uma aproximação inovativa do ensino da bioinformática que apele aos estudantes da biologia do universitário.

Com um interesse crescente no metagenomics - a descodificação não apenas de um único genoma, mas de um ecossistema microbiano inteiro - a quantidade de dados produzidos é mais do que um biólogo pode prosseguir com. Devido a isto, a Bioinformática - o uso de técnicas de computador processar dados biológicos - está tornando-se mais popular. O sistema de ensino de Annotathon aponta treinar uma rede dos bioinformaticians do aprendiz, que podem assistente no oceano dos dados que são gerados numa base diária.

Este método pede que os estudantes escolham aleatòria e para analisar fragmentos metagenomic desconhecidos do ADN de uma pesquisa real arranje em seqüência a armazenagem. A missão do estudante, usando o Internet utiliza ferramentas somente, é figurar para fora de que organismo o ADN vem, e que função biológica pôde ter. E também o ganho da confiança e da proficiência na bioinformática, os estudantes experimentam o processo autêntico da pesquisa de pesar os argumentos, de estabelecer a confiança da previsão, hipóteses de construção, e de manter o discurso rigoroso.

Deixar o trajecto bem pisado de exercícios enlatados está debilitando para instrutores, mas o resultado de ensino é valor bom o esforço. “Eu fiz ambos com meus estudantes: re-analisando a proteína do prião todos os anos, e mergulhando para estas partes totalmente imprevisíveis de ADN,” diz Hingamp que desenvolveu o software de Annotathon. “É trabalho duro, mas as mentiras reais do divertimento no lado desconhecido. O excitamento está travando.” Os Estudantes, plenamente conscientes de suas explorações na borda do conhecimento, e sem a rede de segurança, vivem até o desafio e produzem o trabalho de alta qualidade. De facto, sua saída prova bom bastante ser alimentado de novo bases de dados públicas no diário usado por pesquisadores.

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