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生物信息学的讲师,争取本科生,以解决DNA注释挑​​战

Published on November 24, 2008 at 9:33 PM · No Comments

马赛大学的讲师帕斯卡尔Hingamp领导小组,在本周的PLoS生物学杂志上,描述了Annotathon -一种创新的生物信息学的教学方法,呼吁本科生物学的学生。

随着越来越大的兴趣在宏基因组学 - 不只是一个单一的基因组的解码,但一个完整的微生物生态系统 - 产生的数据量更比一个生物学家能够跟上。正因为如此,生物信息学 - 计算机技术的使用过程中的生物数据 - 越来越流行。 Annotathon教学体系,旨在培养网络的学徒生物信息学家,谁可以在每天的基础上产生的数据的海洋助手。

这种方法要求学生随机选取和分析未知的宏基因组DNA片段,从一个真正的研究序列储存。学生的使命,只使用互联网工具,是要弄清楚从生物体的DNA来自何方,它可能有什么生物功能。以及获得生物信息学中的信心和能力,学生体验真实的研究过程称重参数,建立预测的可靠性,建立假设,并保持严谨的话语。

离开罐头演习以及走过的道路是不得了的导师,但教学的结果是非常值得的努力。 “我已经做了我的两个学生:重新分析的朊蛋白连年一年,这些完全不可预测的DNA件潜水,说:”Hingamp谁开发的Annotathon软件。 “这是艰苦的工作,但真正的乐趣在于不为人知的一面。兴奋的是醒目。”学生,充分了解他们的探索,在知识的边缘,并没有安全网,生活的挑战,生产高品质的工作。事实上,他们的输出证明不够好,被送入由研究人员日常使用的公共数据库。

http://www.plos.org/