Méthode Nouvelle pour l'analyse complète de protéome

Les Chercheurs à l'Institut de Burnham pour la Recherche Médicale (Burnham) ont déchiffré un grand pourcentage du complément de protéine totale (protéome) en levure de fission de pombe de Schizosaccharomycètes (pombe de S.).

Laurence Brill, Khatereh Motamedchaboki, Ph.D. et Loup de Personne au régime de principal enquêteur, Ph.D., ont développé la méthode nouvelle, employée pour recenser 4.600 protéines dans l'organisme, utilisant un choix de techniques sophistiquées. La recherche a été publiée en ligne le 9 mars dans les Méthodes de tourillon.

La « Analyse du protéome d'un organisme nous indique que tellement analyse plus que simple de Séquence d'ADN, » a indiqué M. Wolf. La « analyse de Protéome nous donne un instantané de quelles protéines sont exprimées en cellule à n'importe quel moment donné. Ceci peut nous indiquer que l'expression de la protéine change en réponse à certains stimulus et dans les conditions de la maladie, qui peuvent aider à recenser des biomarqueurs neufs pour les maladies. Nous nous appliquons maintenant la méthodologie au profilage de protéine des cellules souche humaines en collaboration avec le directeur du programme de la cellule souche de Burnham, Evan Snyder. »

La méthode développée par des scientifiques de Burnham a comporté la digestion des protéines dans de plus petits peptides, puis la séparation des peptides basés sur la charge électrostatique utilisant la chromatographie anionique intense d'échange. Les peptides ont été encore séparés par le poids moléculaire utilisant la chromatographie liquide à haute pression. Chacun des différents peptides a été trouvé et recensé utilisant l'analyse de spectrométrie de masse et de base de données. L'analyse de l'ADN du génome de levure prévoit 5027 protéines. L'équipe a recensé 4.600 protéines, qui n'est pas bien le protéome entier. Les autres 400 sont seulement exprimés condition de accouplement de s pendant de S. pombe '.

Le pombe de S. est employé souvent comme un organisme modèle pour étudier la réaction et le réglage des dégâts d'ADN, la division cellulaire, les réponses au stress et d'autres aspects de biologie cellulaire.

http://www.burnham.org/