Uusi tekniikka, joka etsii verestä pienimmätkin rippeet jaoteltuna proteiinit on paljastanut uutta tietoa siitä, miten solut käynnistää syövän aktivaattoreita kutsutaan proteaasien. Tulokset parantaa tutkijoiden ymmärrystä mekaniikka rintasyövän ja valitse mistä etsiä mahdollisia indikaattoreita varhaisen tauti.
Esiintyvät tällä viikolla PLoS ONE, tutkimus osoittaa, aiemmin tuntemattomia osasyy proteaasin aktivointi, joka auttaa levinnyt syöpä: syöpäsolujen lähes täysin pureskella jopa pieni proteiini kappaletta, jotka normaalisti jarruttaa kahdella proteaasien tunnetaan plasmiinin ja trombiinia. Menetys nämä jarrut - käytettäviä proteaasinestäjiin antiplasmiinin ja antitrombiinipitoisuudet - esiintyy huomattavasti enemmän veressä syöpäpotilaiden verrattuna terveisiin henkilöihin "verta.
Vaikka tutkijat ovat pitkään tienneet, että proteaasien aktivoituvat syöpä, tämä työ johti tutkijat Department of Energy Pacific Northwest National Laboratory näyttää kaksi uutta mahdollisia mekanismeja miten. Tätä työtä tukivat NIH National Center for Research Resources.
Tuleva työ, joka mittaa miten nämä proteiinit toimivat varhaisen ja myöhäisen vaiheen syöpäpotilaat voivat paljastaa hyödyllisiä biomarkkereita diagnoosi.
Menettää se
Syöpä on pitkälti kyse menettävät otteen solun tiukasti säädeltyä elinkaaren. Kasvava hillittömästi, syövät kuluttavat kehon resurssien, kuten energian ja kudoksen. Yksi proteiini, joka menettää määräysvallan rintasyövän ja muiden syöpien, plasmiini, kannustaa jakautuminen kudosta matriisi, joka pitää solut rahapulassa yhdessä. Tämä mahdollistaa syöpäsolujen levinnyt muihin kehon osiin. Kuitenkin tutkijat ovat vielä täysin selvittää molekyylitason tapahtumien ketjua ja sen ulkopuolella solujen johtaa yliaktiivinen plasmiiniksi.
Tässä työssä tutkijat tutkia solu sirpaleita johtolankoja. Koska syöpä retunes solujen omaa ilkeä päättyy, proteiineja normaalisti käytössä saada silputaan. Pois heitetty proteiinit voivat paljastaa kuinka syöpä kukoistaa, syventämällä tietämystä taudin ja oivalluksia miten hyökätä.
Tutkia cellular sirpaleita, joukkue hankki verinäytteet 15 rintasyöpäpotilaiden joka kesti syöpä vaiheet I-III. Ne yhdistettynä kaikki 15 näytettä lisätä kertoimet löytää hyödyllistä tietoa. Ne kerätään myös veren 15 ohjaus terveillä vapaaehtoisilla ja käsitellä näytteet samalla tavalla.
Voit tarkastella vain pienin kokoinen pois heitetty proteiini jäänteitä, tutkijat poistettu verisolut ja kymmenkunta runsain proteiineja verestä. Sitten ne kerätään vain pienimmät proteiini kappaletta, joista monet ovat noin kymmenesosa koko yleisinhimillisiä proteiineja. Tutkijat kutsuivat kokoelma huonontuneen kappaletta plasma degradome.
Käyttämällä proteomiikka menetelmiä EMSL, DOE: n Environmental molekulaaritieteet laboratorion PNNL kampuksella, joukkue tunnistettu proteiini katkelmia syövän ja terve degradomes. Fragmentit välillä näytteet poikkesivat huomattavasti. Esimerkiksi syöpä veren järjestetään katkelmia yli 70 erilaista proteiinia, jotka pilkotaan yli 800 kappaletta. Terve veri vain pidetään 50 erilaista proteiinia leikata paloiksi yli 400 kappaletta. Lisäksi täydentää palasia päällekkäin joidenkin välillä syöpä ja terve, mutta ei täysin.
Broken jarrut
Erilaisia palasia voi tarkoittaa, että syöpä löytyi uusia tapoja leikata vanhoja proteiineja, mutta analyysi osoitti, että tämä ei pidä paikkaansa. Avainmääritelmä Tutkijat havaitsivat oli kuinka usein tiettyjen proteiinien leikattiin yksittäisiä sivustoja - nämä erosivat valtavasti. Lisäksi proteiinien todennäköisimmin Paloiteltu syövän näytteistä näyttivät jakaa tunnettu syöpään liittyvien proteiini perheitä.
"Olimme yllättyneitä, koska odotimme satunnainen muutoksia degradome", sanoo johtaa kirjailija, PNNL biologi Yufeng Shen. "Mutta sen sijaan löysimme klusterin proteiinia muutoksia hyvin spesifisiä biologisia järjestelmiä."