Rozliczać dla opadającego nieprzewidywalna natura RNA, badacze przy uniwersytet michigan i uniwersytet kalifornijski, Irvine rozwijaliśmy nowego sposób szukać dla leków które celują ten znacząco molekułę. Ich praca pojawiać się w Czerwa 26 zagadnieniu natury substanci chemicznej biologia.
Once myśleć być bezwolnym przewoźnikiem genetyczna informacja, RNA teraz rozumie wykonywać liczbę inni zasadniczy rola w komórce, i swój wadliwe działanie może prowadzić choroba. Wszechstronna molekuła także jest istotna retroviruses które żadny DNA, polegają na RNA transport i wykonują genetyczne instrukcje dla everything zamiast wirusowe potrzeby najeżdżać swój gospodarza i porywać samolot. tak jak HIV, Jak coraz więcej łączy choroba odkrywa poszukiwanie dla leków które celują RNA wzmacniają.
Gmeranie dla taki narkotyzuje no jest prostym sprawą, jakkolwiek. Najwięcej today polowań narzędzia projektują znajdować małe molekuły które oprawiają proteinowi cele, ale RNA no jest proteiny, i ono odróżnia się od protein w wiele głównych cechach. "W ten sposób tam jest narastający potrzeba dla przepustowość technologii które mogą utożsamiać mieszanki które oprawiają RNA," powiedzieli Hashim M. al Robert L Kuczkowski chemia Biophysics przy U-M profesor i profesor.
al i coworkers adaptowaliśmy istniejącą obliczeniową technikę dla praktycznie ekranizować biblioteki małe molekuły ustalać ich opraw zdolność. W ten podejściu kształt cel molekuła jest pierwszy ustalającym Radiologiczną krystalografią lub NMR spektroskopią; następnie, badacze biegają komputerowe symulacje obliczać jak well różnorodne małe molekuły---potencjalni leki, na przykład---gnieździ się w i oprawia cel struktura. RNA przedstawia ważnego wyzwanie ten metodologia ponieważ ono no ma właśnie jeden konfiguraci; ja jest opadającym molekułą, i w zależności od zakładać bardzo różny kształty może, ono. który małą molekułę oprawia ono
Ja once myśleć że, że spotkania z lek molekuł właściwie powodować RNA kształtem zmieniają, i ja był niemożliwy przepowiadać jaki kształt adoptował na oprawę dawać mała molekuła RNA. Jakkolwiek, w wczesnym badaniu rzucał wyzwanie, al drużyna ten konwencjonalnego "napadu" pojęcie pokazywać że RNA, samodzielnie, może tanczyć przez różnorodnych kształtów które adoptuje kiedy różni leki ono granica. Drużyna odkrywał i wtedy zatrzaskuje na nim że each lek molekuła "czekanie" po prostu dla RNA przekształcać się w swój uprzywilejowanego kształt.
Badacz poprzednia praca wymagał tworzyć "filmy" RNA ten zdobycz ten taniec kształt zmiany. W ten nowej nauce badacze marznęli i poddawali each one wirtualny przesiewanie indywidualne "ramy" od filmów, each seans RNA w różnym conformation. Badać metodę w "świacie rzeczywistym," najpierw próbowali je na mieszankach już znać oprawiać szczególną RNA molekułę od HIV dzwoniącego DZIEGCIUJĄ.
Pokazywaliśmy to mogliśmy przepowiadać przy pożytecznie poziomem dokładność" al powiedzieliśmy. "praktycznie ekranizować wieloskładnikowych zdjęcia smoła, my jak ściśle oprawiają smoła te różne mieszanki," Ale nie udać się przepowiadać oprawę te leki które znamy możemy oprawiać smołę. "jeżeli używaliśmy konwencjonalną metodę i praktycznie ekranizowaliśmy pojedynczą SMOŁOWCOWĄ strukturę ustalającą Radiologiczną krystalografią lub NMR spektroskopią,"