454生命科学は、ハイスループットシーケンシングのための新しいGS FLX +システムを起動

454ライフサイエンス、ロシュ社（SWX：RO）（SWX：ROG）（ピンクシート：RHHBY）は、本日、立ち上げと新しいGS FLX +システム、余分に長いシーケンスを生成することができる楽器の当面の空室状況にまで読み取ったことを発表しました長さは1,000人。パフォーマンスのこの新しいレベルは、それを最初のハイスループットシーケンシング技術は、精度とサンガーベースの手法に匹敵する長さの読み取りから、拠点数百万を提供すること、ライフサイエンス業界における主要なマイルストーンを提示。リード長さの改善は、全体的な実行​​の経済を助けると、さらに大規模なゲノムプロジェクトのコストを削減し、トータルスループットが50％増に変換されます。

"当社の顧客は、すでに長い間恩恵を受けていると、ベータテストや早期のアクセス中に行わゲノムシークエンシングおよび順序付けさまざまなプロジェクトに読み込みます。我々は、システムの商用リリースを楽しみにしていると需要を満たすためにフルタイムで実行している我々の2つの楽器を持っていること。"

初期のユーザーから熱狂的なフィードバックは、長いゲノム解析と発見で読み出しの値を証明するものです。初期のアクセスのプロジェクトは、de novoシーケンシングとゲノム全体の組み立て、包括的トランスクリプトームプロファイリング、環境試料のメタゲノム特性評価、およびその他を含むさまざまなアプリケーションのための拡張リード長が非常に重要であることを明らかにした。長く、正確な読み取りが大幅に改善されたアセンブリで、その結果、複雑なゲノム内で高度に反復領域を解決するための特に強力であることがわかった。

"我々は我々の研究室でGS FLX +システムの性能に感激し、"Chris Wright氏、イリノイ州アーバナシャンペーン校の大学のハイスループットシーケンシング、ジェノタイピングユニットのアシスタントディレクターは語る。 "当社の顧客は、すでに長い間恩恵を受けていると、ベータテストや早期のアクセス中に行わゲノムシークエンシングおよび順序付けさまざまなプロジェクトに読み込みます。我々は我々の2つの楽器が満たすためにフルタイムで稼動させるシステムの商用リリースにと楽しみにしている需要。"アルバロヘルナンデス、ラボのディレクターは、彼らの仕事のかなりの部分が非モデル生物からのゲノムとトランスクリプトームのde novoシーケンスを含むことを追加しました。 "非常に長いが、それでも短いリードの技術で課題となっている遺伝子とそのスプライシングバリアント、の正確な組み立てを可能にするGS FLX +システムの読み取り"、と彼は説明した。

ペンシルベニア州立大学の研究者らは、余分に長いより絶滅危惧タスマニアデビル、デビル顔面腫瘍疾患（DFTD）として知られている伝染性の癌によって脅かされている生物種内の遺伝的多様性を特徴づけるために読み取りを既に使用している。 全米科学アカデミーの進行で、今週オンライン発表された研究では、、新しいGS FLX +システムの長いリードの組み合わせを使用する、GS FLXチタンペアエンドリードと短い配列にデータを読み込み二32億塩基対のゲノムをアセンブルタスマニアデビル、野生で病気に感染していたいくつかDFTD株に自然の抵抗力を持つもの、および他の。

"このプロジェクトの定義部分は、GS FLX +システムで長いを生成する能力だ、正確にはタスマニアデビルの遺伝子構造の完全な理解を開発するために必要な読み取り、"シュテファンシュスター、生化学および分子の年長の著者および教授は説明するペンシルベニア州立大学の生物学。長い読み取り"からのDNAの長い伸張は""繰り返し要素にまたがると、そのようなユニークな種のゲノムの包括的かつ正確なアセンブリを構築するために重要です。"比較ゲノムの手法は、タスマニアデビルが生き残るために種のための十分な遺伝的多様性を維持するのチャンスを最大にするために捕われの身に保持される必要があるかを予測する理論モデルを開発するために使用されています。このアプローチは、他の絶滅危惧種に延長することができる。

新しいGS FLX +システムは、新しい楽器として、または既存のGS FLXのインストゥルメントへのオンサイトのアップグレードとして提供され、新しいGS FLXチタニウムシークエンシングキットXL +の大きな試薬の量に対応するために再設計された試薬のコンパートメントを備えています。シーケンシングフローのサイクル数の増加は、化学とソフトウェアの最適化とともに、1,000 bpの（700bpのモード）に長さを読み込み可能に。楽器はまた、既存のGS FLXチタニウムシークエンシングキットXLR70と完全な下位互換性があります。

"我々のチームは我々のシステムのパフォーマンスを前方に駆動し、真の長さと精度を読み取るサンガーのように達成するために懸命な努力を重ねてきた、"454ライフサイエンスのクリストファーマクラウド、社長兼最高経営責任者（CEO）は述べています。 "全体として私たちの初期のユーザーと生命科学のコミュニティからの反応は圧倒的に肯定されています。当社は、ユーザーベースの世界的に、このアップグレードをロールアウトし、長い読み込みシーケンスの値を示すよう努力してまいります。"

ソースロシュ