En ny teknik som framkallas av forskare på Stanford-Universiteten, Skolar av Medicin låter forskare identifiera avkrävaDNAEN ordnar, och lägen begränsar vid reglerande RNAs. Denna information är nödvändig beträffande att förstå hur de för en tid sedan identifierade RNAmolekylarna kontrollerar uttryckt av neighboring och avlägsna gener.
Studien erbjuder en häpnadsväckande skymt in i den invecklade världen av genuttryckt och hur RNA, tänkte en gång för att vara endast en lågt cell- budbärare, låser aktivt vår DNA-baserade genom upp. ”Måste Vi som är van vid, precis att innebära var dessa RNAs agerade baserade på deras biologiskt verkställer,”, sade Howard Chang, MD, PhD, professor av dermatologi. ”Men nu kan vi identifiera exakt var på chromatinen de är bindande. Vi har funnit att dessa platser är fokal-, talrika och ordna-närmare detalj.”,
Det är kritiskt viktigt att Dechiffrera rollen av reglerande RNAs att förstå att många cell- fungerar, inklusive de som är involverade i utveckling, cancer och regeneration.
Chang, som är också en medlem av det Stanford CancerInstitutet, är den höga författare av arbetet, som ska, publiceras Sept. 29 i Molekylär Cell. Han och hans labb identifierade föregående någon av den första bekant reglerande RNAsen, däribland en i 2007 som de kallade HOTAIR. DoktorandCi Chu är den första författare av forskningen.
Femtio år sedan, identifierade forskare först budbärare RNAs, som serven att kopiera de genetiska anvisningarna kodade i DNAEN från nucleusen och att leverera den till cellens detbyggnad maskineriet. Med tiden blev det i en riktning flödet av information från DNA till RNA till protein bekant som biologi ”centraldogm.”, Reglerande RNAs utmaning som aning genom bandet till DNA och att påverka vilka gener är utvalda att bli proteiner.
Existensen av dessa reglerande RNAs som kallades också långa intergenic non-kodifiera RNAs eller lincRNAs, förutsattes först årtionden sedan av forskare som realiserade, att DNA som paketeras in i chromatin (ett rullat ihop komplex av DNA och proteiner) innehåller mer, än två gånger så mycket RNA väger by som DNA. De undrade, om RNAEN som täcker chromatinen reglerar aktivt, när och hur specifika gener vänds 'På/av'. Men tekniska svårigheter har gjort det svårt att identifiera preciserar platser av bandet till nu.
”Till tillfångatagandet som detta föreställer, måste du att fånga den växelverkan mellan lincRNAs, och chromatin i bosatt celler,”, sade Chang. ”Var Det inte alls tydligt hur man gör det.”,
Slutligen planerade Chu en innovativ riff på en van vid allmänninganalys identifierar DNAEN ordnar destinerat vid en klassificera av proteiner som kallades transkription, dela upp i faktorer. För det experiment använder forskareblandningprotein och chromatin och därefter antikroppar till isolaten eller immunoprecipitate, både proteinet av intresserar och dess föredragna bindande plats.
I stället för att använda en antikropp, använde Chu och Chang två eller tre som märktes chemically, ordnar kompletterande nucleotide, eller sonder, till isolaten den reglerande RNAsen, efter de hade destinerat till DNAEN. Emellertid kunde de tillfångatagandet endast omkring 10 procent av den reglerande RNAEN genom att använda denna metod. Slutligen ordnar den Chu hiten på idén av att använda dussintals individuellt märkt nucleotide den röraalltigenom molekylen.