개인화된 암 약을 위한 새로운 소프트웨어 키

기술을 연속 높 처리량 DNA는 혁명으로 임상의가 어떻게에 있는 암을 진단하고 취급하는지 이끌어 내고 있습니다. 개별적인 종양의 분자 단면도는 낙관된 개별적인 환자의 처리를 위한 화학요법 프로그램의 디자인에서 사용되기 위하여 시작되고 있습니다. 실제적인 혁명은, 그러나, 싸고에 나오는 기능에 그리고 정확하게 연속 암의 전체 게놈을 와, 개별적인 환자에 있는 질병에 책임있는 특정 돌연변이의 식별을 허용하.

아래쪽 단지 것이 있습니다. 기술을 연속 그들은 과학자에 의해 쉽게 가공되지 않으며 변환되지 않는 데이터의 엄청난 규모를 제공합니다. 그런 이유로 조오지아 기술은 생물학자와 임상의를 위한 쓸모 있는 내용으로 빨리 복잡한 RNA 순서 데이터를 변형시키는 새로운 데이터 분석 산법을 만들었습니다. RNA 시퀀스 분석 파이프라인 (R-SAP)는 생물학 교수의 죤 맥도날드와 Ph.D 학교에 의해 개발되었습니다. 생물정보학 후보자 Vijay Mittal. 파이프라인의 세부사항은 전표 핵산 연구에서 간행됩니다.

"개인화한 약의 꿈의 현실화에 있는 중요한 좁은 통로는 더 이상 과학 기술 없습니다. 그것은 컴퓨터 입니다," 맥도날드를 조오지아 기술의 새로 만든 통합 암 연구 센터의 디렉터 말했습니다. "R-SAP 따릅니다 계층 정확하게 암 견본에 있는 유전자 사본의 각종 종류를 성격을 나타내기 위하여 결정 절차를."는

단백질의 순서를 부호 매기는 인간 게놈에 있는 RNA의 적어도 23,000 피스가 있습니다. 그밖 피스 도움의 수백만은 단백질의 생산을 통제합니다. R-SAP는 빨리 각 유전자의 RNA 표정의 수준을 결정하고 결합 이체, biomarkers 및 공상 RNAs에 관하여 정보를 제공할 수 있습니다. 생물학자와 임상의는 일반적인 세포의 RNA 단면도 또는 "transcriptomes"를 개별적인 암의 그들과 비교하고 그로 인하여 낙관한 개인적인 치료를 개발하는 더 나은 위치에 있는 사용에 준비되어 있 능력 있을 것입니다 이 데이터.

암 약에 개인화한 접근은 발전 유방 및 난소암의 고 위험도를 가진 여자를 확인하기 위하여 이용될 수 있는 BRAC 1 유전자의 이체를 포함하여 약간 "암 biomarkers"를 위한 대폭적인 사용에 이미 있습니다.

"우리의 목표,"는 말했습니다 Mittal를 쉽게 역행 처리 기능에 설치할 수 있는 파이프라인을 디자인하기 위한 것이었습니다. "R-SAP는 입력합니다 다만 90 분을 100백만을 만들 수 있습니다. 다중 CPUs에 프로그램을 동시에 실행하는 것은 그 시간을 더 줄일 수 있습니다."

R-SAP가 맥도날드 실험실 웹사이트에 접근 가능한 열리는 근원 소프트웨어, 자유롭게입니다.

"이것은 과학과 차세대 생물정보학 공구의 근본 특징을 만들기 위하여 컴퓨터 공학을 합병하는 조오지아 기술의 능력의 또 다른 보기 입니다," 맥도날드를 말했습니다. "우리는 R-SAP가 암 생물학의 필드에 있는 과학자 그리고 임상의를 위한 유용하고 사용하기 쉬운 계기."일 것이라는 점을 희망합니다

근원: 조오지아 공과 대학