Рис, сети упования научных работников MD Андерсона детализируя поможет терапиям точн-настройки
Научные Работники на Университете Риса и Центре Карциномы MD Андерсона Техасского Университета успешно профилировали тропа протеина найденные, что были своеобразнейши к пациентам лейкова с определенными вариантами заболевания.
Их исследование включило творение нового вычислительного подхода к определять сложные сети в signaling протеина. Они сообщили их работе этот месяц в журнале Proteomics.
С их новым методом, bioengineer Amina Qutub Риса, врач-клиницист MD Андерсона и научный работник Steven Kornblau и аспирант Риса Вереск Йорк проанализировали больше чем стоимости декады данных. Они определили картины в выражении 203 протеинов изученных в клетках акутовых пациентов миелоидного (AML) лейкова и найденных почти 700 пар протеина (от среди тысяч возможностей) вовлеченных в таких сетях.
Цель терапия точн-настройки для пациентов, Qutub сказало. Если возможно знать тропа signaling протеина определенных типов лейкова, то она сказала, тогда снадобья могут быть найдены, что - или конструировано - пристрелли заболевание путем преграждать те тропа.
«Лейков нет как раз одно заболевание,» сказал Qutub, которое присутствовало на Рисе как старшекурсник и теперь ассистент профессора биоинженерии основанный на Исследовании Биологических наук Риса Сотрудническом. «Оно много, много заболеваний lumped в одну категорию. Вы не можете использовать подход к кувалды для того чтобы обработать его, хотя то чего врачи-клиницисты делали.»
«Головка Phillips отвертка делает большое если вы получаете крест на вашей головке винта, то» Kornblau сказала. «Она не работает очень хорошо если вы получаете шлиц. Компании имеют снадобья которые могли работать gangbusters в малой части пациентов, но если вы изучаете большой компосит, то оно не делает выглядеть как очень активный агент. Идеально, если оно работает в 5 процентах пациентов и вы можете выбрать их вне впереди времени, то вы кладете их на правое снадобье и щадите другие 95 процентов от получать снадобье которое не идет помочь им.»
Оно не необыкновенн для пациентов лейкова пойти в затихание, Qutub сказало, но большая часть терпит рецидив не познее 2 лет. «Мы пробуем к давати в численном выражении что настолько различны о этих пациентах, и ли мы может увеличить их терапию. Единственный путь мы знаем для того чтобы сделать который к давати в численном выражении подпись протеина.»
Протеины ломовые лошади клетки. Создано от светокопий, котор хранят в ДНА, они передают химические сигналы от одного к другим с инструкциями на как раз около каждой работе клетка способна. Но когда их основное кодирвоание взболтанно, они могут как раз как легко причинить клетку к собственн-destruct.
Qutub уподобляло тропа signaling протеина к движению города. «Вы могли принять поезд, управить автомобиль, прогулку или принять велосипед, но окончательно вы получили бы к вашему положению,» она сказала. «В онкологических больных, тропа протеина покажитесь, что следовать картинами. В нормальных клетках, большей частью тропа, и пока вы можете иметь такие же тропа в раковых клетках, они могли также иметь запасные маршруты - и принимать их, к разным степеням.»
Специфическая польза протеинов трасс передать сигналы может быть ключом к определять их тип, поэтому было стоимостью расследуя клад сокровища данных которые были собраны от пациентов MD Андерсона, Qutub сказало.
Проект начал с встречей шанса Qutub и Kornblau на конференции в Колорадо на гипоксии. «Стив сказало, «Вы работаете с математически моделированием гипоксической реакции. Я имею пациента установлено Я думаю что вы могло быть заинтересованы внутри. «Которое как оно начало, и оно приняло нас опускает очень различную дорогу, используя машин-учя алгоритмы и статистически методы которые не была частью моего исследования сердечника а теперь станьте объединенной как к этому проекту, так и к другому исследованию в лаборатории,» Qutub сказало.