Cette semaine de publication de point de repère d'un « plan » du renivellement bactérien des êtres humains en bonne santé a les racines profondes dans une place inattendue : l'océan.
Des communautés Microbiennes sur lesquelles vivez et au corps humain, connu collectivement comme microbiome, sont pensées pour avoir un rôle critique dans la santé des personnes et la maladie. Il y a Cinq ans, les Instituts de la Santé Nationaux ont lancé le Projet ambitieux de Microbiome d'Être Humain (HMP) pour définir les bornes de la variation bactérienne trouvées dans 242 êtres humains sains.
« Afin de comprendre ce que malade est, il est utile de définir le microbiome sain d'abord, » dit le scientifique Susan M. Huse, auteur important de MBL d'un des états de HMP publiés cette semaine.
Les scientifiques du projet 200 de 80 institutions, y compris Huse et Mitchell Sogin du MBL, ont fait face à la tâche effrayante de sembler raisonnable de plus de 5.000 échantillons d'ADN humain et bactérien et 3,5 terabases des données génomiques.
La solution ? Le HMP a adopté plusieurs, l'ordonnancement génétique de pointe et les méthodes d'analyse, on dont ont été initialement développés par le MBL pour le Dénombrement International des Microbes-un Marins massifs, le projet de dix ans qui a fourni les premiers stocks de la diversité microbienne dans les océans du monde.
Et, peut-être comme on pouvait s'y attendre, le HMP a découvert que les distributions microbiennes au corps humain ne sont pas aussi différentes de ceux dans des écosystèmes d'océan.
Si dans l'intestin humain, bouche, ou vagin, l'Océan Pacifique Ou la Mer de Sargasso, les communautés microbiennes contiennent quelques types bactériens hautement abondants plus on, beaucoup plus de types de faible-abondance (la soi-disant « biosphère rare, » un phénomène d'abord découvert dans des échantillons d'océan par Sogin et ses collègues de MBL).
« Plus nous examinons plus attentivement, plus bactérienne la diversité que nous trouvons, » Huse dit. « Nous ne pouvons pas même nommer tous ces genres de bactéries que nous découvrons dans les habitats humains et environnementaux. Elle est comme l'essai de nommer toutes les étoiles. » Les chercheurs de HMP ont conclu que des 10.000 substances bactériennes environ occupent le microbiome humain.
Le HMP a également confirmé cela dans les gens, comme dans l'océan, qui les bactéries sont abondantes et qui sont rares varient du site à site. Le Bacteroide commun de bactérie, par exemple, peut comporter presque 100% des microbes dans un intestin de la personne, pourtant soit à peine présent dans d'une autre personne.
« Ce Qui ces est le moyen, il n'y a pas simplement une voie d'être sain, » dit Huse. « Il ne doit pas y a un ou deux « juste juste » communautés d'intestin, mais plutôt un domaine « juste de bonnes » communautés. »
Une Autre recherche de clés du HMP est que presque chacun transporte des agent-microbes connus pour entraîner la maladie. Dans les personnes en bonne santé, cependant, les agents pathogènes n'entraînent aucune maladie ; ils coexistent simplement avec le reste des microbes rares et abondants dans le microbiome de la personne. Les Chercheurs maintenant doivent figurer à l'extérieur pourquoi quelques agents pathogènes tournent mortel et dans quelles conditions, révisant vraisemblablement des concepts actuels de la façon dont les micros-organismes entraînent la maladie.