Les Chercheurs découvrent le mécanisme qui coupe les protéines de réglementation de transport de cellules

Published on December 20, 2012 at 12:20 AM · No Comments

Les Chercheurs au FROTTEMENT et du MPI Dortmund ont découvert le mécanisme qui coupe les protéines de réglementation de transport de cellules. Ils pouvaient résoudre en détail comment la protéine centrale Rab de contact vers le bas-est réglée avec deux « doigts de protéine » par ses associés d'interaction. Les données structurelles et dynamiques sont enregistrées par les chercheurs aboutis par le Prof. M. Klaus Gerwert (Présidence de la Biophysique, du FROTTEMENT) et le Prof. M. Roger S. Goody (Max Planck Institute pour la Physiologie Moléculaire, Dortmund, Allemagne) dans l'Édition Précoce En Ligne du tourillon PNAS. « À La Différence De dans la protéine Ras, qui de croissance des cellules est réglée avec seulement un « doigt », nous avons étonnant trouvé un mécanisme de contact-hors circuit de deux-doigt dans Rab. Ceci projette une lumière complet neuve sur le fonctionnement de certaines enzymes, le petit GTPases, auquel Rab appartient », Klaus que Gerwert explique.

Commutez les protéines associées avec les maladies variées

À La Différence des protéines de Ras qui règlent la croissance des cellules, fonctionnements de transport variés de contrôle de Rab GTPases (aussi protéines appelées de Rab) entre différentes zones d'une cellule. Si le système de transport est perturbé, les maladies telles que l'obésité peuvent se produire. Les protéines de Rab fonctionnent comme contact, juste comme les protéines de Ras. Dans la condition de "ON", la molécule de grande énergie GTP est liée, dans la condition de "OFF", le PIB plus à énergie réduite. Le clivage du GTP au PIB est catalysé par les protéines ainsi-nommées de RabGAP. Ce faisant, le GTP est coupé en PIB et phosphate. L'équipe de recherche a observé la réaction fondamentale dans le temps et l'espace pour la première fois à la définition atomique plus élevée possible.

D'abord un instantané, puis un film entier

Utilisant l'analyse de structure de Rayon X, les chercheurs ont déterminé la première fois la structure spatiale du composé de protéine. Les données ont affiché un doigt de l'arginine acide aminée, et un majeur de glutamine. Le doigt d'arginine a été déjà connu de Ras. Le doigt de glutamine est neuf et étonnant. RabGAP pénètre dans la poche GTP-grippante de Rab avec les deux doigts et accélère le clivage de GTP plus de cinq ordres de grandeur. Les biophysiciens ont observé ce procédé dynamique en temps réel utilisant la spectroscopie de FTIR. « Contrairement à l'analyse de structure de Rayon X, spectroscopie de FTIR nous donne non seulement un instantané de la réaction, mais un film entier », indique M. Carsten K-tting de PALLADIUM. Le résultat : les deux doigts catalytiques pénètrent simultanément dans la poche GTP-grippante et la laissent avec du phosphate fendu du GTP.

Mécanisme Médicalement intéressant

Dans leur expérience, les chercheurs ont examiné la protéine Rab1b et le RabGAP TBC1D20. Les Autres protéines et RabGAPs de Rab sont assimilés à ces deux préposés du service. « Ainsi, nous supposons qu'elles agissent l'un sur l'autre également par l'intermédiaire d'un mécanisme de deux-doigt », Konstantin que Gavriljuk spécule. La capacité du système de deux-doigt à aussi commutent les protéines hors circuit subies une mutation de Rab, c.-à-d. GTPases muté, pourrait également être médicalement très intéressant. Il serait concevable pour développer les petites molécules qui imitent le mécanisme de deux-doigt, et coupe ainsi l'autre mutant GTPases, tel que Ras, qui émet les signes incontrôlés d'accroissement et est concerné ainsi dans la formation tumorale.

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