Écart Neuf de pistes d'étude de variante de H5N1 en Egypte récent recensée en tant qu'épicentre principal pour le virus

Published on February 10, 2014 at 1:08 AM · No Comments

Depuis sa première identification en Asie, influenza-H5N1-has aviaire hautement pathogène a entraîné l'alerte significative à la communauté scientifique. Tandis Que l'objectif primaire des virus est les oiseau-dix de millions sont déjà morts du service informatique-service informatique est capable d'infecter des mammifères, y compris des êtres humains, entraînant la maladie grave et des tarifs effrayants de la mortalité.

Dans une étude neuve, Matthew Écossais, un chercheur à l'Institut de Biodesign de l'Université De L'Etat D'Arizona, pistes l'écart d'une variante de H5N1 dans le pays de l'Egypte-un récent recensé comme épicentre important pour le virus. Dans les résultats apparaissant récent dans la Génomique du tourillon BMC, pistes Écossaises que l'écart du H5N1 enferme utilisant une technique connue sous le nom de phylogeography.

Les auteurs espèrent que les études de ce genre augmenteront de manière significative des efforts par les agents de la Santé publics pour recenser des manifestations virales, limitent leur écart, combinent des efforts de vaccination, réduisent la mortalité et avisent mieux le public des risques.

La « Egypte représente un épicentre pour le H5N1 et il y a des variantes neuves qui ont puisqu'on l'a la première fois découvert là en 2006, « Écossais apparu disent. « Nous avions l'habitude des séquences de génome de phylogeography et de grippe pour modéliser la diffusion et l'évolution du virus. »

Phylogeography était né hors des zones de la biogéographie et le phylogenetics ou le développement de molécules. En combinant des données et l'information géographique virales de séquence au fil du temps, ainsi qu'en évaluant des caractéristiques techniques associées avec les porteurs viraux, chercheurs peut mieux comprendre comment les virus écartent en travers d'un horizontal par les populations animales et humaines.

Phylogeography a été déjà déterminé comme technique puissante pour vérifier la dispersion virale pour les maladies humaines, y compris la fièvre dengue, la rage, la grippe et le VIH. Application Récente des méthodes phylogeographic à l'étude des promesses de grippe aviaire d'améliorer de manière significative le mappage à grain fin de l'origine virale et de l'écart.

Le H5N1 de Grippe aviaire est une forme du virus d'ARN d'A-an de grippe d'abord recensé dans Hong Kong en 1997. Les cas initiaux du H5N1 apparemment n'ont pas été transmis efficacement parmi des oiseaux. En 2002 cependant, les isolats neufs du H5N1 sont apparus, entraînant la maladie aiguë dans les canards, ayant pour résultat le dysfonctionnement et la mort neurologiques.

Les oiseaux Infectés transmettent le H5N1 à un un un autre par les sécrétions nasales, la salive, les fèces et le sang. D'Autres animaux, y compris des êtres humains, peuvent devenir infectés avec le virus par le contact direct avec les fluides corporels aviaires ou par les surfaces contaminées.

Les cas Humains du H5N1 résultent souvent du contact avec la volaille infectée, en particulier dans les marchés et les fermes sous tension d'oiseau, on pense que qui sont les réservoirs importants pour le virus. Le H5N1 Aviaire cependant, est également transporté par la substance migratrice des oiseaux, qui écartent davantage le H5N1 à d'autres parties du monde.

En 2004, les chercheurs ont découvert que le H5N1 est un agent pathogène plus efficace que les oiseaux aquatiques, les poulets, les corneilles, les pigeons et les canards initialement assumés et de attaques, ainsi que des mammifères, fournissant un taux de mortalité élevé. La Grippe aviaire est maintenant considérée un danger pour la santé global significatif, avec l'espérance très réelle d'une pandémie internationale, entraînant la fatalité répandue.

En Effet, on a estimé que le taux de mortalité chez l'homme contractant le H5N1 est environ 60 pour cent, le rendant plus mortel pour des personnes infectées que la tension génétiquement assimilée Espagnole de grippe-un qui a tué 50-100 millions de personnes mondiaux pendant la pandémie de 1918.

Actuel, le H5N1 n'est pas hautement transmissible aux êtres humains des oiseaux et a très un à bas taux de la transmission de homme à homme, (cependant autour d'une demi-douzaine enferme ont été enregistrés). Si un nombre restreint de mutations rendent le H5N1 plus facilement transmissible parmi des êtres humains, les conditions pour une pandémie mortelle auront été remplies.

En plus des mutations, les formes mélangées de la grippe virus-sues en tant que reassortant tension-peuvent se produire quand une personne unique est infectée avec deux versions d'un virus donné et elles permutent des gènes. Un H5N1 reassortant a pu rendre la grippe aviaire promptement transmissible entre les hôtes humains.

Dans l'étude neuve, on a observé une variante particulière de H5N1, étiquetée 2.2.1.1, en Egypte. Là, la grippe aviaire a déjà détruit des milliers d'oiseaux et a entraîné 173 cas humains, dont 63 ont été mortels à partir du 10 décembre 2013, selon l'Organisation Mondiale de la Santé. Ce sont les numéros de cas les plus élevés pour le H5N1 en dehors de l'Asie. Comme dans le cas du H5N1 Asiatique, les experts associent la plupart des infections humaines en Egypte à l'exposition à la volaille malade, en particulier aux marchés sous tension d'oiseau.

Dans leurs tentatives de recenser l'origine et l'écart du virus en Egypte, les chercheurs se sont servis d'une plate-forme logiciel neuve produite par Professeur Scotch. Connu comme ZooPhy, le programme active l'analyse phylogeographic de l'écart de H5N1. (Des Plans de l'écart viral effectués avec ZooPhy peuvent être vus dans le vidéo de accompagnement ci-dessous.)

Le H5N1 de virus de grippe aviaire prend son nom de deux genres d'épis ornant la surface, le hemagglutinin et (HA) la neuraminidase viraux (NA). Virus de la grippe du Type A ou du Type hemagglutinin d'utilisation de B à fixer aux récepteurs de surface de cellules, permettant le viral infection de la cellule. La Neuraminidase agit plus tard de retirer ces récepteurs des cellules infectées, permettant les virus neuf synthétisés à des particules d'échapper et infecter à d'autres cellules.

(Il y a 17 types différents de hemagglutinin, de H1 à H17 et de neuf types différents de neuraminidase, de N1 à N9 parmi des virus de la grippe A. Chaque virus a un type de H (tel que H5) et un type de N (tel que N1).)

Par l'analyse de 226 HA et 92 séquences de NA, Écossaise et ses collègues a employé un élan phylogeographic pour tracer les artères de prépondérance et de boîte de vitesses du H5N1 en Egypte. Phylogeography est un élan particulièrement fructueux pour les Virus ARN animal-à-humains (ou zoonotiques), dus aux séquences génomique courtes et aux vitesses rapides de l'évolution.

Les découvertes du groupe ont indiqué une répartition géographique de la forme virale de 2.2.1.1 du H5N1 en travers des régions primaires de l'Egypte quatre : Le Caire, le Delta du Nil, Canal et Supérieur Egypte. L'Analyse statistique suggère le governorate du nord du Frêne Sharqiyah car le point d'origine pour l'écart du H5N1, cependant, l'association mathématique est trop faible pour prétendre la certitude. L'Analyse a également impliqué que les artères de boîte de vitesses les plus intenses pour le H5N1 étaient de Frêne Sharqiyah à Al Gharbiyah et à Al Fayyum à Al Qalyubiyah.

La Plupart des voies de la transmission recensées sont apparues dans la région en masse peuplée de Triangle de l'Egypte. Le governate de Qalybiyah d'Al semble en particulier être une zone populaire pour le passage viral, bien que la dispersion à et de cette région demeure incertaine, exigeant davantage de recherche. L'étude également a noté la diversité virale considérable au-dessus d'un temps limité cadre-peut-être une réaction évasive à un programme de vaccination national de volaille.

« Ceci a des implications significatives de santé publique pour le reste du monde, » Écossais dit. « Il est important de se concentrer sur les clades variables afin de comprendre mieux comment ce virus a évolué et que les governorates propograting son écart. »

Les auteurs sont autres développant la surface adjacente graphique du logiciel de ZooPhy. L'outil n'exige aucune connaissance spécialisée de phylogeography ou de bio-informatique, la rendant pratique pour l'usage de zone par les agents de la Santé publics. Par la mise à zéro dedans sur les artères commerciales, les configurations de transfert et les omnibus de la transmission du virus, autorités de la santé peuvent économiser les moyens limités, les appliquant où elles peuvent être les plus pertinentes.

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