最近ウイルスのための主要な中央点として識別されるエジプトの H5N1 等価異形暗号の新しい調査トラック広がり

Published on February 10, 2014 at 1:08 AM · No Comments

アジアの最初識別以来、非常に病原性のある Avian により科学界でインフルエンザ H5N1 重要なアラームを引き起こしました。 ウイルスの主目標がある間、何百万の鳥 10 はそれそれがもとで既にほ乳類を、人間を含んで感染させることができま停止しま、死亡率の深刻な病気そして驚くべきレートを引き起します。

新しい調査では、アリゾナ州立大学の Biodesign の協会スコットランド、 Matthew トラックの研究者最近ウイルスのための主要な中央点として識別されるエジプトの国の H5N1 等価異形暗号の広がり。 最近ジャーナル BMC ゲノミクスで現われる結果では H5N1 の広がりが phylogeography として知られている技術を使用して包装するスコットランドトラック。

著者はウイルスの発生を識別するためのこの種類の調査がかなり公衆衛生の役人による努力を高めることを望み、彼らの広がりを限定し、ワクチン接種の努力を調整し、死亡率を減らし、そして危険をよりよくパブリックに知らせます。

「エジプト H5N1 のための中央点を表し、それが 2006 年に最初にそこに検出されたので現れたと、 「はスコットランドが言うある新しい等価異形暗号があります。 「私達は使用しましたウイルスの拡散そして改革を模倣するのに phylogeography およびインフルエンザのゲノムシーケンスを」。

Phylogeography は生物地理学のフィールドから生まれましたおよび phylogenetics または分子改革。 ウイルスシーケンスデータおよび地理的な情報を一定時間にわたり結合すること、またウイルスのキャリア、研究者によって関連付けられる機能を評価することによってよりよくウイルスが動物および人口母集団を通って景色を渡ってどのように広がるか理解できます。

Phylogeography はデング熱、狂犬病、インフルエンザおよび HIV を含む人間の病気のためのウイルスの分散を、調査するための強力な技術として既に確立されてしまいました。 かなりウイルスの起源および広がりのきめの細かいマップを改善する鳥インフルエンザの約束の調査への phylogeographic 方法の最近のアプリケーション。

鳥インフルエンザ H5N1 は最初に 1997 年に香港で識別されるインフルエンザの A-an の RNA のウイルスの形式です。 H5N1 の最初の例は鳥間で外見上効率的に送信されませんでした。 しかし 2002 年に、 H5N1 の新しい隔離集団は現われま、激しい病気を、神経学的な機能障害および死に終ってアヒルで引き起します。

感染させた鳥は鼻の分泌、唾液、糞便および血によって互いに H5N1 を送信します。 他の動物は、人間を含んで、 Avian 体液が付いている直接接触または汚染された表面を通ってウイルスに感染されるようになるかもしれません。

H5N1 の人間のケースは頻繁にウイルスのための主要な貯蔵所であると信じられる農場起因します、および生きている鳥の市場の感染させた家禽が付いている接触に、特に。 しかし Avian H5N1 はまた世界の他の部分に更に H5N1 を広げる鳥の移住性種によって、運ばれます。

2004 年に、研究者は H5N1 が最初に仮定された、攻撃の鴨、鶏、カラス、ハトおよびアヒルより有効な病原体である、また高い死亡率をもたらしているほ乳類ことを検出しました。 鳥インフルエンザは今広まった不運を引き起こしていて国際的な流行病の非常に実質の見通しにより重要で全体的な健康の脅威と、して考慮されます。

実際に、 H5N1 を引き締めている人間の死亡率はそれを 1918 年の流行病の間に 50-100 百万人を世界的に殺したスペインのインフルエンザの遺伝的に同じような緊張より感染させた個人のために致命的にさせるおよそ 60% であるために推定されました。

現在、 H5N1 は鳥からの人間に非常に伝染性でし、人から人への伝達の非常に低率があります、 (しかし半ダースのまわりで報告されました包装します)。 もし少数の突然変異が H5N1 を人間間で伝染性より容易にすれば、致命的な流行病のための条件は満たされてしまいます。

突然変異に加えて、 reassortant としてウイルス知られているインフルエンザの混合された形式は単一の個人がある特定のウイルスの 2 つのバージョンに感染し、遺伝子を交換するとき発生する緊張できます。 reassortant H5N1 は鳥インフルエンザを人間のホスト間で容易に伝染性することができます。

新しい調査では、 2.2.1.1 と分類された H5N1 の特定の等価異形暗号はエジプトで観察されました。 そこでは、鳥インフルエンザは既にたくさんの鳥を殺し、世界保健機構に従って 63 が 2013 年 12 月ずっと 10 日である 173 の人間のケースを現在に致命的、引き起こしてしまいました。 これらはアジアの外の H5N1 のための最も高いケース番号です。 アジア H5N1 の場合にはように、専門家は生きている鳥の市場で病気にかかった家禽への露出とエジプトのほとんどの人間の伝染を、特に関連付けます。

エジプトのウイルスの起源そして広がりを識別する彼らの試みでは研究者は教授が Scotch 作成した新しいソフトウェアプラットホームを利用しました。 ZooPhy として知られていて、プログラムは H5N1 広がりの phylogeographic 分析を可能にします。 (ZooPhy と作られるウイルスの広がりのマップは次伴うビデオで見られるかもしれません。)

鳥インフルエンザのウイルス H5N1 はウイルスの表面、 hemagglutinin およびノイラミニダーゼを飾る 2 種類のスパイクからの (HA)名前を取ります (NA)。 セル表面の受容器に接続するべきタイプ A またはタイプ B の使用の hemagglutinin のインフルエンザウイルスセルのウイルス感染を許可します。 ノイラミニダーゼは後で感染させたセルからこれらの受容器を除去するために機能しま他のセルを脱出し、感染させるように最近総合されたウイルスに粒子がします。

(17 のタイプの hemagglutinin が、 H1 へ H17 および N1 からのインフルエンザ A のウイルス間の N9 へ 9 つのタイプのノイラミニダーゼからの、あります。 各ウイルスは 1 つのタイプの H (H5 のような) および 1 のタイプの N が (N1 のような) あります。)

スコットランド 226 HA の分析によっておよび 92 の NA シーケンスおよび彼の同僚 phylogeographic アプローチをエジプトの H5N1 の優位および伝達ルートをトレースするのに使用しました。 Phylogeography は改革の短い genomic シーケンスそして急速なレートによる動物に人間 (か人獣伝染病の) RNA のウイルスのための特に有益なアプローチです。

グループの調査結果はエジプト 4 の主要区域を渡る H5N1 の 2.2.1.1 ウイルス形式の地理的な広がりを明らかにしました: カイロ、ナイルのデルタ、運河および甲革エジプト。 統計分析はしかし H5N1 の広がりのための原点が数学連合確実性を要求するには余りにも弱いので灰 Sharqiyah の北の governorate を提案します。 分析はまた H5N1 のための最も強い伝達ルートが灰 Sharqiyah にから Al Gharbiyah および Al Fayyum Al Qalyubiyah にあったことを意味しました。

識別された感染ルートのほとんどはエジプトの密に位置付けられたデルタ領域で現われました。 Al の Qalybiyah の governate は特にこの領域に出入する分散がはっきりしないけれどもそれ以上の研究を必要とするウイルスの転移のための普及した領域のようです。 調査はまたフレーム多分限られた時間にわたるかなりのウイルスの多様性に全国的な家禽のワクチン接種プログラムへの回避的な応答注意しました。

「これにその他の国々のための重要な公衆衛生の含意があります言います」とスコットランド。 よりよくこのウイルスがどのように展開させた governorates が広がりを」。 propograting、か理解するために 「異なった clades に焦点を合わせることは重要です

著者はそれ以上で ZooPhy のソフトウェアのグラフィカルインターフェイスを開発します。 ツールはフィールド使用のためにそれを公衆衛生の役人によって便利にさせる phylogeography または生物情報学の専門にされた知識を必要としません。 、最も有効でもいいところでウイルス伝達の移行パターンそしてハイウェイ通商航路でゼロになることによって、保健機関はそれらを加える限られたリソースを節約できます。

ソース: アリゾナ州立大学

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