Nowi nauka ślada rozprzestrzeniający H5N1 wariant w Egipt ostatnio utożsamiający jak ważnego epicentrum dla wirusa

Published on February 10, 2014 at 1:08 AM · No Comments

Od swój pierwszy identyfikaci w Azja, wysoce patogenny ptasi influenza-H5N1-has powodował znaczącego alarm w społeczności naukowa. Podczas gdy virus początkowy cel jest dziesięć millions już umierali od mnie są sposobni infekowanie ssaki wliczając istot ludzkich, powodować poważną chorobę i przerażającego tempo śmiertelność.

W nowej nauce, Matthew Szkocki, badacz przy Arizona stanu uniwersyteta Biodesign instytutem, tropi rozszerzanie się H5N1 wariant w Egipt kraju ostatnio utożsamiającym jako ważny epicentrum dla wirusa. W rezultatach ostatnio pojawiać się w czasopisma BMC Genomics, Szkoccy ślada rozszerzanie się H5N1 pakuje używać technikę znać jako phylogeography.

Autory mieć nadzieję, ograniczają, zmniejszają śmiertelność i lepiej informują społeczeństwo ryzyko, ich rozciągniętych, równorzędnych szczepienie wysiłki. że studia ten rodzaj znamiennie uwydatniają wysiłki utożsamiać wirusowych wybuchy zdrowie publiczne urzędnikami

Egipt reprezentuje epicentrum dla H5N1 i tam  są nowi warianty które wyłaniali się "Szkockiego mówją. "ponieważ one najpierw odkrywał tam  w 2006, " Używaliśmy phylogeography, grypy genomu sekwencje modelować i. "dyfundowanie i ewolucję wirus"

Phylogeography był urodzony z poly biogeografia, phylogenetics i cząsteczkowa ewolucja. Łączyć przez czas as well as oceniać cechy kojarzyć z wirusowymi przewoźnikami wirusowych sekwencja dane i geographical informację, badacze mogą lepiej rozumieć jak wirusy rozprzestrzeniają przez krajobraz przez zwierzęcia i populacj ludzkich.

Phylogeography już ustanawiał jako potężna technika dla prowadzić dochodzenie wirusowego rozbieganie dla ludzkich chorob wliczając dengi febry, wścieklizn, grypy i HIV. Niedawny zastosowanie phylogeographic metody nauka ptasia grypa obietnicy znamiennie ulepszać drobnoziarnisty kartografować wirusowy początek rozprzestrzeniać i.

Ptasia grypa H5N1 jest formą grypy A-an RNA wirus najpierw utożsamiający w Hong Kong w 1997. Początkowe skrzynki H5N1 najwyraźniej no transmitowali wydajnie wśród ptaków. W 2002 jakkolwiek, nowy odizolowywa H5N1 pojawiać się, powodować ostrą chorobę w kaczkach, wynikający w neurologicznym dysfunkcja i śmierci.

Infekujący ptaki transmitują H5N1 inny jeden przez nosowych sekrecj, śliny, fekaliów i krwi. Inni zwierzęta wliczając istot ludzkich, mogą zostać infekującymi z wirusem przez bezpośredniego kontaktu z ptasimi cielesnymi fluidami lub przez skażonych powierzchni.

Ludzkie skrzynki H5N1 często rezultat od kontaktu z infekującym drobiem w żywych ptasich rynkach i gospodarstwach rolnych które wierzą być ważnymi rezerwuarami dla wirusa., szczególnie, Ptasi H5N1 jakkolwiek, także niesie emigracyjnymi gatunkami ptaki które wspomagają rozciągniętego H5N1 inne części świat.,

W 2004, badacze odkrywali as well as ssaki, poddaje się wysokiego wskaźnika śmiertelności. że H5N1 oryginalnie zakłada jest możnym patogenem niż, atakujący waterfowl, kurczaki, wrony, gołębie i kaczki, Ptasia grypa teraz rozważa znaczący globalny zdrowia zagrożenie z prawdziwą istną perspektywą międzynarodowa pandemia, powoduje rozlewną ofiarę śmiertelną.

Naprawdę wskaźnik śmiertelności w istotach ludzkich skraca H5N1 oszacowywał być wokoło 60 procentami, robi mu śmiercionośny dla infekować jednostek niż Hiszpański grypy genetycznie jednakowy napięcie który zabił 50-100 milionów ludzi na całym świecie podczas pandemii 1918.

Obecnie, H5N1 no jest wysoce przekazywalny istoty ludzkie od ptaków i prawdziwego niskiego tempo człowiek od człowieka przekaz, (though donosili wokoło przyrodnie tuzin skrzynek). Musi mała liczba mutacje odpłaca się H5N1 łatwo przekazywalny wśród istot ludzkich warunki dla śmiertelnej pandemii spotykają.

W dodatku do mutacjami, mieszać formy znać jako reassortant grypa mogą zdarzać się gdy pojedyncza jednostka infekuje z dwa wersjami dawać wirus i wymieniają geny. H5N1 reassortant mógł odpłacać się ptasią grypę bez wahania przekazywalna między ludzkimi gospodarzami.

W nowej nauce, szczególny wariant H5N1, przylepiający etykietkę 2.2.1.1, obserwował w Egipt. Tam, ptasia grypa już powodował 173 ludzkiej skrzynki według światowej organizaci zdrowia i 2013., z czego 63 byli śmiertelny Grudzień 10th jak, Te są wysocy skrzynek liczby dla H5N1 na zewnątrz Azja. Jak w przypadku azjata H5N1 kojarzą najwięcej ludzkich infekcj w Egipt z ujawnieniem chory drób przy żywymi ptasimi rynkami, eksperci, szczególnie.

W ich próbach utożsamiać rozszerzanie się wirus w Egipt i początek, badacze zrobili use Szkocki nowa oprogramowanie platforma tworząca profesorem. Zna jako zooPhy program umożliwia phylogeographic analizę H5N1 rozszerzanie się. (mapy robić z zooPhy wirusowy rozszerzanie się mogą widzieć w towarzyszy wideo below.)

Ptasia grypa wirus H5N1 bierze swój imię od dwa rodzajów kolce ozdabia powierzchnię (HA), hemagglutinin i neuraminidase (NA) wirusowych. Wirusy grypy typ A lub typ b use hemagglutinin dołączać komórki powierzchni receptory, pozwolić wirusową infekcję komórka. Neuraminidase opóźneni akty usuwać te receptory od infekować komórek, pozwolić niedawno syntetyzującym wirusom cząsteczkę uciekać inne komórki i infekować.

(Tam  są 17 różnych typ hemagglutinin, od H1 i dziewięć różnych typ neuraminidase H17, od N1 N9 wśród grypy A wirusów. Each wirus jeden typ H i jeden typ N.) (tak jak H5) (tak jak N1)

Przez analizy 226 brzęczeń, 92 NA sekwenci i jego koledzy, Szkockiej używał phylogeographic podejście tropić preponderance i przekazu trasy H5N1 w Egipt. Phylogeography jest szczególnie owocnym podejściem dla, opłata zwierać genomic sekwencje i błyskawicznych tempa ewolucja. istoty ludzkiej lub zoonotic RNA wirusów ()

Grup znalezienia wyjawiali geograficznego rozszerzanie się 2.2.1.1 wirusowa forma H5N1 przez Egipt cztery początkowych tereny: Kair, Nil delta, kanał i wierzch, Egipt. Statystyczna analiza sugeruje północnego governorate popiół Sharqiyah jako punkt początek dla rozszerzania się H5N1, jakkolwiek matematycznie skojarzenie jest zbyt słaby żądać pewność. Analiza także insynuował że silne przekaz trasy dla H5N1 byli od popiółu Sharqiyah Al Gharbiyah i Al Fayyum Al Qalyubiyah.

Najwięcej utożsamiać trasy przekaz pojawiać się w gęsto ludnościowym delta regionie Egipt. Al Qalybiyah governate szczególnie pojawiać się jest popularnym terenem wymaga dalszy badanie dla wirusowej przemiany. chociaż dyspersja do i z ten regionu zostaje niepewną, Nauka także zauważał pokaźną wirusową różnorodność nad limitowaną czas ramą wykrętna odpowiedź szeroki drobiowy program szczepień.

"To znaczących zdrowie publiczne następstwa dla reszty świata," Szkocki mówi. Ja jest znacząco skupiać się na wariantów clades lepiej rozumieć i governorates propograting swój rozszerzanie się. "po to, aby jak, który ten wirus rozwijał"

Autory są dalszy rozwijać zooPhy oprogramowania graficznego interfejs. Narzędzie wymaga żadny specjalizującą się wiedzę phylogeography lub bioinformatics, robi mię dogodny dla śródpolnego use zdrowie publiczne urzędnikami. Wycelować wewnątrz na handlowych trasach, migracja wzory i autostrady wirusowy przekaz, władze zdrowotny mogą chronić ograniczonych zasoby, stosuje one dokąd mogą być wydajny.

Źródło: Arizona stanu uniwersytet

Read in | English | Español | Français | Deutsch | Português | Italiano | 日本語 | 한국어 | 简体中文 | 繁體中文 | Nederlands | Русский | Svenska | Polski