Propagação Nova das trilhas do estudo da variação H5N1 em Egipto identificado recentemente como o epicentro principal para o vírus

Published on February 10, 2014 at 1:08 AM · No Comments

Desde sua primeira identificação em Ásia, influenza-H5N1-has aviário altamente patogénico causou o alarme significativo na comunidade científica. Quando o alvo preliminar dos vírus for os pássaro-dez de milhões têm morrido já d-ele são capazes de contaminar mamíferos, incluindo seres humanos, causando a doença séria e uma taxa assustador de mortalidade.

Em um estudo novo, Matthew Escocês, um pesquisador no Instituto do Biodesign da Universidade Estadual do Arizona, trilhas a propagação de uma variação H5N1 no país de Egipto-um identificado recentemente como um epicentro principal para o vírus. Nos resultados que aparecem recentemente na Genómica do jornal BMC, trilhas que Escocêsas a propagação de H5N1 encaixota usando uma técnica conhecida como o phylogeography.

Os autores esperam que os estudos deste tipo aumentarão significativamente esforços por responsáveis da Saúde públicos para identificar manifestações virais, limitam sua propagação, coordenam esforços da vacinação, reduzem a mortalidade e informam melhor o público dos riscos.

“Egipto representa um epicentro para H5N1 e há as variações novas que têm desde que se descobriu primeiramente lá em 2006, “Escocês emerso dizem. “Nós usamos seqüências do genoma do phylogeography e da gripe para modelar a difusão e a evolução do vírus.”

Phylogeography era nascido fora dos campos da biogeografia e o phylogenetics ou evolução molecular. Combinando dados virais da seqüência e a informação geográfica ao longo do tempo, assim como avaliando as características associadas com os portadores virais, pesquisadores pode melhor compreender como os vírus espalham através de uma paisagem através das populações animais e humanas.

Phylogeography tem sido estabelecido já como uma técnica poderosa para investigar a dispersão viral para doenças humanas, incluindo a febre de dengue, a raiva, a gripe e o VIH. Aplicação Recente de métodos phylogeographic ao estudo de promessas da gripe das aves de melhorar significativamente o traço de grãos finos da origem viral e da propagação.

A gripe Aviária H5N1 é um formulário do vírus do RNA de A-an da gripe identificado primeiramente em Hong Kong em 1997. Os exemplos iniciais de H5N1 não foram transmitidos aparentemente eficientemente entre pássaros. Em 2002 contudo, os isolados novos de H5N1 apareceram, causando a doença aguda nos pactos, tendo por resultado a deficiência orgânica e a morte neurológicas.

Os pássaros Contaminados transmitem H5N1 a um outro com as secreções nasais, a saliva, a fezes e o sangue. Outros animais, incluindo seres humanos, podem tornar-se contaminados com o vírus através do contacto directo com os líquidos corporais aviários ou através das superfícies contaminadas.

Os casos Humanos de H5N1 resultam frequentemente do contacto com aves domésticas contaminadas, particularmente nos mercados e nas explorações agrícolas vivos do pássaro, que são acreditados para ser reservatórios principais para o vírus. H5N1 Aviário contudo, é levado igualmente pela espécie migratório de pássaros, que espalham mais H5N1 a outras partes do mundo.

Em 2004, os pesquisadores descobriram que H5N1 é um micróbio patogénico mais poderoso do que aves aquáticas, galinhas, corvos, pombos e pactos originalmente supor, de ataques, assim como os mamíferos, rendendo uma taxa de mortalidade alta. A gripe Aviária é considerada agora uma ameaça global significativa da saúde, com a perspectiva muito real de uma pandemia internacional, causando fatalidade difundida.

Certamente, a taxa de mortalidade nos seres humanos que contratam H5N1 foi calculada para ser ao redor 60 por cento, fazendo o mais letal para indivíduos contaminados do que a tensão genetically similar Espanhola da gripe-um que matou 50-100 milhões de pessoas no mundo inteiro durante a pandemia de 1918.

Actualmente, H5N1 não é altamente transmissível aos seres humanos dos pássaros e tem um muito desprezado da transmissão de humano a humano, (embora em torno de uma meia dúzia encaixota foram relatados). Se um pequeno número de mutações tornarem H5N1 mais facilmente transmissível entre seres humanos, as condições para uma pandemia mortal terão sido estadas conformes.

Além do que mutações, os formulários misturados da gripe vírus-sabidos como reassortant tensão-podem ocorrer quando um único indivíduo está contaminado com duas versões de um vírus dado e trocam genes. Um H5N1 reassortant podia tornar a gripe das aves prontamente transmissível entre anfitriões humanos.

No estudo novo, uma variação particular de H5N1, etiquetada 2.2.1.1, foi observada em Egipto. Lá, a gripe aviária tem matado milhares de pássaros e tem causado já 173 casos humanos, de que 63 foram fatais o 10 de dezembro de 2013, de acordo com a Organização Mundial de Saúde. Estes são os números os mais altos do caso para H5N1 fora de Ásia. Como no caso do Asiático H5N1, os peritos associam a maioria de infecções humanas em Egipto com a exposição às aves domésticas doentes, particularmente em mercados vivos do pássaro.

Em suas tentativas de identificar a origem e a propagação do vírus em Egipto, os pesquisadores utilizaram uma plataforma de software nova criada pelo Professor Escocês. Sabido como ZooPhy, o programa permite a análise phylogeographic da propagação H5N1. (Os Mapas da propagação viral feitos com ZooPhy podem ser vistos no vídeo de acompanhamento abaixo.)

O vírus de gripe das aves H5N1 toma seu nome de dois tipos dos pontos que decoram a superfície, o hemagglutinin e (HA) o neuraminidase virais (NA). Virus da gripe do Tipo A ou do Tipo hemagglutinin do uso de B a anexar aos receptors da superfície da pilha, permitindo a infecção viral da pilha. O Neuraminidase actua mais tarde para remover estes receptors das pilhas contaminadas, permitindo que a vírus recentemente sintetizados as partículas escapem e contaminem outras pilhas.

(Há 17 tipos diferentes de hemagglutinin, de H1 a H17 e de nove tipos diferentes de neuraminidase, de N1 a N9 entre vírus da gripe A. Cada vírus tem um tipo de H (tal como H5) e um tipo de N (tal como N1).)

Com a análise de 226 HA e 92 seqüências do NA, Escocêsa e seus colegas usou uma aproximação phylogeographic para seguir as rotas da preponderância e de transmissão de H5N1 em Egipto. Phylogeography é uma aproximação particularmente frutuosa para os vírus do RNA animal-à-humano (ou zoonotic), devido às seqüências genomic curtos e às taxas rápidas de evolução.

Os resultados do grupo revelaram uma propagação geográfica do formulário viral de 2.2.1.1 de H5N1 através das áreas preliminares de Egipto quatro: O Cairo, Delta do Nilo, Canal e Parte Superior Egipto. A análise Estatística sugere o governorate do norte da Cinza Sharqiyah porque o ponto de origem para a propagação de H5N1, contudo, a associação matemática é demasiado fraco reivindicar a certeza. A Análise igualmente implicou que as rotas de transmissão as mais fortes para H5N1 eram da Cinza Sharqiyah ao Al Gharbiyah e ao Al Fayyum ao Al Qalyubiyah.

A Maioria das rotas de transmissão identificadas apareceram na região densa povoada do Delta de Egipto. O governate de Qalybiyah do Al parece em particular ser uma área popular para a transição viral, embora a dispersão a e desta região permanece incerta, exigindo uma pesquisa mais adicional. O estudo igualmente notou a diversidade viral considerável sobre uma estadia limitada quadro-talvez uma resposta evasivo a um programa de vacinação a nível nacional das aves domésticas.

“Isto tem implicações significativas da saúde pública para o resto do mundo,” Escocês diz. “É importante centrar-se sobre clades variantes a fim compreender melhor como este vírus evoluiu e que os governorates propograting sua propagação.”

Os autores são mais adicionais desenvolvendo a relação gráfica do software de ZooPhy. A ferramenta não exige nenhum conhecimento especializado do phylogeography ou da bioinformática, fazendo a conveniente para o uso do campo por responsáveis da Saúde públicos. Zerando dentro nas rotas de comércio, os testes padrões da migração e as estradas da transmissão viral, autoridades de saúde podem conservar os recursos limitados, aplicando os onde podem ser os mais eficazes.

Read in | English | Español | Français | Deutsch | Português | Italiano | 日本語 | 한국어 | 简体中文 | 繁體中文 | Nederlands | Русский | Svenska | Polski