Nueva extensión de los carriles del estudio de la variante H5N1 en Egipto determinado recientemente como epicentro importante para el virus

Published on February 10, 2014 at 1:08 AM · No Comments

Desde su primera identificación en Asia, influenza-H5N1-has aviar altamente patógeno causó la alarma importante en la comunidad científica. Mientras Que es el objetivo principal de los virus los pájaro-diez de millones han muerto ya de él-él son capaces de infectar mamíferos, incluyendo seres humanos, causando enfermedad seria y un índice espantoso de mortalidad.

En un nuevo estudio, Matthew Escocés, investigador en el Instituto de Biodesign de la Universidad de Estado de Arizona, carriles la extensión de una variante H5N1 en el país de Egipto-uno determinado recientemente como epicentro importante para el virus. En los resultados que aparecen recientemente en la Genómica del gorrón BMC, carriles Escoceses que la extensión de H5N1 encajona usando una técnica conocida como phylogeography.

Los autores esperan que los estudios de esta clase aumenten importante esfuerzos de los responsables de Sanidad públicos de determinar brotes virales, limitan su extensión, coordinan esfuerzos de la vacunación, reducen mortalidad e informan mejor al público riesgos.

“Egipto representa un epicentro para H5N1 y hay las nuevas variantes que tienen puesto que primero fue descubierto allí en 2006, “Escocés emergida dicen. “Utilizamos series del genoma del phylogeography y de la gripe para modelar la difusión y la evolución del virus.”

Phylogeography nació fuera de los campos de la biogeografía y phylogenetics o evolución molecular. Combinando datos virales de la serie y la información geográfica en un cierto plazo, así como evaluando las características asociadas a los portadores virales, investigadores puede entender mejor cómo los virus se extienden a través de un paisaje a través de las poblaciones animales y humanas.

Phylogeography se ha establecido ya como técnica potente para investigar la dispersión viral para las enfermedades humanas, incluyendo fiebre de dengue, rabia, gripe y el VIH. Aplicación Reciente de métodos phylogeographic al estudio de las promesas de la gripe aviar de mejorar importante la correspondencia de grano fino del origen viral y de la extensión.

La gripe Aviar H5N1 es un formulario del virus del ARN de A-an de la gripe primero determinado en Hong Kong en 1997. Los casos iniciales de H5N1 no fueron transmitidos al parecer eficientemente entre pájaros. En 2002 sin embargo, los nuevos aislantes de H5N1 aparecieron, causando enfermedad aguda en patos, dando por resultado la disfunción y la muerte neurológicas.

Los pájaros Infectados transmiten H5N1 a uno otro con secreciones nasales, saliva, las heces y la sangre. Otros animales, incluyendo seres humanos, pueden infectarse con el virus a través de contacto directo con los líquidos corporales aviares o a través de superficies contaminadas.

Los casos Humanos de H5N1 resultan a menudo de contacto con aves de corral infectadas, determinado en los mercados y las granjas vivos del pájaro, que se creen para ser depósitos importantes para el virus. H5N1 Aviar sin embargo, también es llevado por la especie migratoria de pájaros, que extienden más lejos H5N1 a otras partes del mundo.

En 2004, los investigadores descubrieron que H5N1 es un patógeno más potente que las aves acuáticas, los pollos, los cuervos, las palomas y los patos originalmente presuntos, que atacan, así como los mamíferos, rindiendo una alta tasa de mortalidad. La gripe Aviar ahora se considera una amenaza global importante de la salud, con la perspectiva muy real de un pandémico internacional, causando fatalidad dispersa.

De Hecho, la tasa de mortalidad en los seres humanos que contrataban H5N1 se ha estimado para ser el alrededor 60 por ciento, haciéndolo más mortal para los individuos infectados que la deformación genético similar Española de la gripe-uno que mató 50-100 millones de personas de por todo el mundo durante el pandémico de 1918.

Actualmente, H5N1 no es altamente transmisible a los seres humanos de pájaros y tiene un muy de tarifa reducida de la transmisión entre personas, (alrededor de una media docena encajona sin embargo han estado señalados). Si una pequeña cantidad de mutaciones hacen H5N1 más fácilmente transmisible entre seres humanos, las condiciones para un pandémico mortal habrán sido cumplidas.

Además de mutaciones, los formularios mezclados de la gripe virus-sabidos como reassortant deformación-pueden ocurrir cuando infectan a un único individuo con dos versiones de un virus dado e intercambian genes. Un H5N1 reassortant podía hacer gripe aviar fácilmente transmisible entre los ordenadores principal humanos.

En el nuevo estudio, una variante determinada de H5N1, etiqueta 2.2.1.1, fue observada en Egipto. Allí, la gripe aviar ha matado a millares de pájaros y ha causado ya 173 casos humanos, cuyo 63 han sido fatales el 10 de diciembre de 2013, según la Organización Mundial de la Salud. Éstos son los números más altos del caso para H5N1 fuera de Asia. Como en el caso de H5N1 Asiático, los expertos asocian la mayoría de las infecciones humanas en Egipto a la exposición a las aves de corral enfermas, determinado en los mercados vivos del pájaro.

En sus tentativas de determinar el origen y la extensión del virus en Egipto, los investigadores hicieron uso de una nueva plataforma de programación creada por Profesor Scotch. Conocido como ZooPhy, el programa activa el análisis phylogeographic de la extensión H5N1. (Las Correspondencias de la extensión viral hechas con ZooPhy se pueden ver en el vídeo acompañante abajo.)

El virus de gripe aviar H5N1 toma su nombre a partir de dos clases de picos que adornan la superficie, el hemagglutinin y (HA) la neuraminidasa virales (NA). Virus de Gripe del Tipo A o del Tipo hemagglutinin del uso de B a asociar a los receptores de la superficie de la célula, permitiendo la infección viral de la célula. La Neuraminidasa actúa más adelante para quitar estos receptores de las células infectadas, permitiendo que a virus nuevamente sintetizados las partículas escape e infecten otras células.

(Hay 17 diversos tipos de hemagglutinin, de H1 a H17 y de nueve diversos tipos de neuraminidasa, de N1 a N9 entre virus de la gripe A. Cada virus tiene un tipo de H (tal como H5) y un tipo de N (tal como N1).)

Con el análisis de 226 HAS y 92 series del NA, Escocés y sus colegas utilizó una aproximación phylogeographic para rastrear las rutas de la preponderancia y de transmisión de H5N1 en Egipto. Phylogeography es una aproximación determinado fructuosa para los virus del ARN animal-a-humano (o zoonótico), debido a las series genomic cortas y a los índices rápidos de evolución.

Las conclusión del grupo revelaron una extensión geográfica del formulario viral de 2.2.1.1 de H5N1 a través de las áreas primarias de Egipto cuatro: El Cairo, el Delta del Nilo, Canal y Parte Superior Egipto. El análisis Estadístico sugiere el governorate septentrional de la Ceniza Sharqiyah pues el punto de origen para la extensión de H5N1, sin embargo, la asociación matemática es demasiado débil demandar certeza. El Análisis también implicó que las rutas de transmisión más fuertes para H5N1 eran de Ceniza Sharqiyah al Al Gharbiyah y al Al Fayyum al Al Qalyubiyah.

La mayor parte de las rutas de la transmisión determinadas aparecieron en la región denso poblada del Delta de Egipto. El governate de Qalybiyah del Al particularmente aparece ser un área popular para la transición viral, aunque la dispersión a y desde esta región sigue siendo incierta, requiriendo la investigación adicional. El estudio también observó considerable diversidad viral durante un rato limitado bastidor-quizás una reacción evasiva a un programa de vacunación nacional de las aves de corral.

“Esto tiene implicaciones importantes de la salud pública para el resto del mundo,” Escocés dice. “Es importante centrarse en clades variables para entender mejor cómo este virus se ha desarrollado y que propograting los governorates su extensión.”

Los autores son más futuros desarrollando el interfaz gráfico del software de ZooPhy. La herramienta no requiere ningún conocimiento especializado del phylogeography o de la bioinformática, haciéndolo conveniente para el uso del campo de los responsables de Sanidad públicos. Poniendo a cero hacia adentro en las rutas comerciales, los modelos y las carreteras de la transmisión viral, autoridades sanitarias de la migración pueden conservar los recursos limitados, aplicándolos donde pueden ser los más efectivos.

Fuente: Universidad de Estado de Arizona

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