H5N1 變形新的研究跟蹤傳播在作為病毒的專業震央最近被識別的埃及

Published on February 10, 2014 at 1:08 AM · No Comments

從其第一個確定在亞洲,高度致病性鳥流行性感冒 H5N1 在科學界導致重大的預警。 當病毒的主要目標是時鳥十百萬已經中斷了於它它能够傳染哺乳動物,包括人,導致病魔和死亡率的一種驚恐費率。

在一個新的研究中,刻痕的馬修,亞利桑那州立大學 Biodesign 學院的,跟蹤一位研究員一個 H5N1 變形的傳播在作為病毒的主要震央最近被識別的埃及國家(地區)。 在最近出現於日記帳 BMC 染色體組的結果, H5N1 傳播裝入使用叫作 phylogeography 的技術的刻痕跟蹤。

作者希望此種類的研究將極大提高由公共衛生官員的工作成績識別病毒爆發,限制他們的傳播,協調接種工作成績,減少死亡率和更好通知公共風險。

「埃及表示 H5N1 的震央,并且有有新興的新的變形,因為在 2006年首先被發現了那裡, 「刻痕說。 「我們使用 phylogeography 和流行性感冒染色體順序塑造病毒的擴散和演變」。

Phylogeography 出生在生物地理學外面的域和 phylogenetics 或者分子演變。 通過隨著時間的推移結合病毒順序數據和地理信息,以及評估功能與病毒承運人,研究員相關能更好知道病毒如何在橫向間分佈通過動物和人口。

Phylogeography 已經被設立了作為調查病毒分散的一個強大的技術人力疾病的,包括登革熱、狂犬病、流行性感冒和 HIV。 phylogeographic 方法的最近應用對禽流感承諾的研究的極大改進詳細映射病毒起源和傳播。

在 1997年鳥流感 H5N1 是流行性感冒 A-an 在香港首先識別的核糖核酸病毒的表單。 H5N1 最初的事例未在鳥中高效地表面上傳輸。 然而在 2002年, H5N1 新的孤立出現,導致深刻疾病在鴨子,造成神經學官能不良和死亡。

被傳染的鳥傳送 H5N1 給互相通過鼻分泌物、唾液、排匯物和血液。 其他動物,包括人,可能變得被病毒傳染通過與鳥體液的直接聯繫或通過汙染的表面。

H5N1 人力案件經常起因於接觸用被傳染的家禽,特別地在活鳥市場和農場,認為是病毒的主要水庫。 然而鳥 H5N1,由鳥的遷移種類也運載,進一步分佈 H5N1 對這個世界的其他地區。

在 2004年,研究員發現 H5N1 比原來地假設的,攻擊的水鳥、雞、烏鴉、鴿子和鴨子是更加有力的病原生物,以及哺乳動物,產生高死亡率。 鳥流感現在被認為一個重大的全球健康威脅,当一種國際大流行病的非常實際潛在客戶,導致普遍死亡率。

的確,在收縮 H5N1 的人的死亡率比在大流行病 1918年期間,殺害 50-100 百萬人民全世界的西班牙流行性感冒基因上相似的張力估計是大約 60%,使它致死為被傳染的單個。

目前, H5N1 不是高度能遞送的對從鳥的人并且有一非常低率人對人傳染的傳輸, (在六附近雖則裝入報告了)。 如果很小數量的變化更加容易地使 H5N1 能遞送在人中,一種致命的大流行病的條件符合了。

除變化之外,作為 reassortant 病毒知道的流行性感冒的混雜的表單張力能發生,當一個唯一單個感染特定病毒時的二個版本,并且他們交換基因。 reassortant 的 H5N1 能使禽流感容易地能遞送在人力主機之間。

在新的研究中, H5N1 一個特殊變形,被標記 2.2.1.1,在埃及被觀察了。 在那裡,鳥流感已經殺害了千位鳥并且根據世界衛生組織導致 173 個人力案件, 63 在 2013年 12月 10日是致命的。 這些是 H5N1 的最高的案件編號在亞洲外面。 一旦亞洲 H5N1,專家關聯多數人力傳染在埃及對害病的家禽的暴露,特別地在活鳥市場上。

在他們的嘗試識別病毒的始發地和傳播在埃及,研究員利用了 Scotch 教授創建的一個新的軟件平臺。 叫作 ZooPhy,這個程序啟用對 H5N1 傳播的 phylogeographic 分析。 (用 ZooPhy 做的病毒傳播映射在下面隨附於的錄影可能被看見。)

禽流感病毒 H5N1 採取其從裝飾病毒表面、 hemagglutinin 和神經氨酸苷酶的二种的名字 (HA)峰值 (NA)。 類型 A 或類型 B 附有的使用 hemagglutinin 流感病毒細胞表面感受器官,允許細胞的病毒感染。 神經氨酸苷酶後操作從被傳染的細胞去除這些感受器官,允許最近被綜合的病毒微粒逃脫和傳染其他細胞。

(有 hemagglutinin 的 17 種不同類型,從 H1 到 H17 和神經氨酸苷酶的九種不同類型,從 N1 到在流行性感冒 A 病毒中的 N9。 每病毒有 H 的一種類型 (例如 H5) 和 N 的一種類型 (例如 N1)。)

通過對 226 HA 的分析和 92 個 NA 順序,刻痕和他的同事在埃及使用一個 phylogeographic 途徑跟蹤 H5N1 優勢和傳輸路線。 Phylogeography 是動物對人力 (或人獸傳染病的) 核糖核酸病毒的一個特別卓有成效的途徑,由於短的基因組順序和演變的迅速速度。

組的發現顯示了 H5N1 的 2.2.1.1 病毒表單的地理學上的傳播在埃及的四主要區域間的: 開羅、尼羅河三角洲、運河和較大埃及。 因為起源點 H5N1 傳播的,然而,數學關聯太弱的以至於不能索賠把握,統計分析建議灰 Sharqiyah 北省。 分析也暗示 H5N1 的最嚴格的傳輸路線是從灰 Sharqiyah 對 Al Gharbiyah 和 Al Fayyum 對 Al Qalyubiyah。

大多被識別的傳輸途徑在埃及的密集地被填寫的 Delta 區域出現。 Al Qalybiyah governate 特別是看來是病毒轉移的一普遍的區,雖然到/從此區域的散射依然是不定,要求進一步研究。 框架或許這個研究也注意在一個限制時間的嚴重的病毒分集對一個全國範圍的家禽接種疫苗計劃的一種不可捉摸的回應。

「這有世界其他地方的重大的公共衛生涵義」,刻痕說。 「著重不同的 clades 為了更好瞭解是重要的此病毒如何演變,并且省 propograting 其傳播」。

作者更加進一步開發 ZooPhy 軟件的圖形接口。 工具不要求 phylogeography 或分析複雜生物資料的學科專門化的知識,使它方便為域使用由公共衛生官員。 通過調零在商船航線,遷移病毒傳輸模式和高速公路,衛生局可能保存有限的資金,應用他們他們可以是最有效的地方。

來源: 亞利桑那州立大學

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