De Onderzoekers identificeren enorme genetische diversiteit

Published on June 13, 2014 at 8:29 AM · No Comments

In de uitvoerigste genetische studie van de Mexicaanse bevolking tot op heden, hebben de onderzoekers van UC San Francisco en de Universiteit van Stanford, samen met het Nationale Instituut van Mexico van Geneeskunde Genomic (INMEGEN), enorme genetische diversiteit die geïdentificeerd, die op duizenden jaren van scheiding onder lokale bevolking wijst en licht op een waaier van verwarrende aspecten van Latino gezondheid afwerpt.

De studie, die bijna 1 miljoen genetische varianten onder meer dan 1.000 individuen documenteerde, onthulde genetische verschillen zo uitgebreid zoals de variaties tussen sommige Europeanen en Aziaten, die op bevolking wijzen die voor honderden aan duizenden jaren is geïsoleerd.

Deze verschillen bieden een verklaring voor de grote verscheidenheid van gezondheidsfactoren onder Latinos van Mexicaanse afdaling, met inbegrip van verschillende tarieven van borstkanker en astma, evenals therapeutische reactie aan. De Resultaten van de studie, waarop UCSF en Stanford beide eerste en hogere auteurs deelden, verschijnen in 13 Juni, de online uitgave van 2014 van de dagboekWetenschap.

„Meer Dan duizenden jaren, zijn er geweest een enorme taal en een culturele diversiteit over Mexico, met grote imperiums zoals Aztec en Maya, evenals kleine, geïsoleerde bevolkingsaantallen,“ bovengenoemd Christopher Gignoux, Doctoraat, dat eerste auteur op de studie met Andres Moreno-Estrada, eerst als gediplomeerde student bij UCSF en nu als post-doctorale kameraad in Stanford was. „Niet alleen konden wij deze diversiteit over het land meten, maar wij identificeerden enorme genetische diversiteit, met echte ziekteimplicaties worden gebaseerd die op waar, precies, uw voorvaderen van in Mexico.“ zijn

Voor decennia, hebben de artsen een waaier van verklaarde diagnoses op patiënten gebaseerd of etnische erfenis, met inbegrip van basislijnmetingen voor longinhoud waargenomen, die worden gebruikt om te beoordelen of longen van patiënten door ziekte of milieufactoren worden beschadigd. In die context, kunnen de categorieën zoals Latino of Afrikaans-Amerikaans, zowel van welke op mensen van diverse combinaties van genetisch voorgeslacht wijzen, zijn gevaarlijk misleidend en allebei veroorzaken een verkeerde diagnose stelt en onjuiste behandeling.

Terwijl er talrijke ziekte/genstudies sinds het Menselijke Project van het Genoom zijn geweest, hebben zij zich hoofdzakelijk geconcentreerd op Europese en Europees-Amerikaanse bevolking, zeiden de onderzoekers. Dientengevolge, is er zeer weinig kennis van de genetische basis voor gezondheidsverschillen onder diverse bevolking.

„In longziekte zoals astma of emfyseem, weten wij dat het welk voorgeslacht u bij specifieke plaatsen op uw genen hebt,“ bovengenoemde Esteban Gonzalez Burchard, M.D., MIJL/UUR, professor van Biotechniek en Therapeutische Wetenschappen, en van Geneeskunde, in de scholen UCSF van Apotheek en Geneeskunde van belang is. Burchard is mede-hogere auteur van het document met Carlos Bustamante, Doctoraat, een professor van genetica in Stanford. „In deze studie, realiseerden wij dat voor ziekteclassificatie het van belang is ook welk type van Inheems Amerikaans voorgeslacht u hebt. In termen van genetica, is het het verschil tussen een buurt en een nauwkeurig straatadres.“

De onderzoekers concentreerden zich op Mexico als één van de grootste bronnen van pre-Columbian diversiteit, met een lange geschiedenis van complexe beschavingen die variërende bijdragen tot the present day bevolking hebben gehad. In samenwerking Werkend over de instellingen, wierf het team 40 deskundigen aan, die zich van tweetalige antropologen aan statistische genetici, computerbiologen en werkers uit de gezondheidszorg, evenals onderzoekers van veelvoudige instellingen in Mexico en anderen in Engeland, Frankrijk, Puerto Rico en Spanje uitstrekken.

De studie omvatte de meeste geografische gebieden in Mexico en vertegenwoordigde 511 mensen van 20 inheemse en 11 mesties (etnisch gemengde) bevolking. Hun informatie werd vergeleken bij genetische en long-meting gegevens van twee vorige studies, waaronder ruwweg 250 Mexicaanse en Mexicaans-Amerikaanse kinderen in de Genetica van Astma in studie Latino van Amerikanen (FEEST), de grootste genetische studie van Latino kinderen in de Verenigde Staten, die Burchard leidt.

Onder de resultaten was de ontdekking van drie verschillende genetische clusters op verschillend gebied van Mexico, evenals duidelijke resten van oude imperiums die schijnbaar verre geografische streken kruisen. In het bijzonder, zijn de mensen Seri langs de noordelijke vastelandskust van de Golf van Californië en Mayan mensen die als Lacandon, dichtbij de Guatemalaanse grens worden bekend, zo genetisch verschillend van elkaar aangezien Europeanen van Chinees zijn.

„Wij werden verrast door het feit dat deze samenstelling ook in mensen met gemengde voorgeslachten van kosmopolitische gebieden,“ bovengenoemde mede-eerste auteur Andres Moreno-Estrada, M.D., Doctoraat, een het onderzoekvennoot van het levenswetenschappen in Stanford werd weerspiegeld. „Verborgen onder de Europese en Afrikaanse voorgeslachtblokken, lijkt de inheemse genetische kaart op een geografische kaart van Mexico.“

De studie openbaarde ook een dramatisch verschil in longinhoud tussen mestiesindividuen met westelijk inheems Mexicaans voorgeslacht en die met oostelijk voorgeslacht, aan de graad dat in een longtest van twee even gezonde mensen van de zelfde leeftijd, iemand van het westen kon schijnen een decennium te zijn jonger dan een tegenhanger van Yucatan. Burchard zei dit klinisch significant was en belangrijke implicaties kon hebben in het diagnostiseren van longziekte.

Beduidend, vond de studie dat deze genetische oorsprong rechtstreeks met longfunctie in moderne Mexican-Americans correleerde. Dientengevolge, legt het onderzoek de grondslag voor zowel verder onderzoek als voor het ontwikkelen van nauwkeurige diagnostiek en misschien zelfs therapeutiek, die op deze genetische variaties wordt gebaseerd. Het leidt ook tot een potentieel belangrijk hulpmiddel voor volksgezondheidsbeleid, vooral in Mexico, in het toewijzen van middelen voor zowel onderzoek als zorg.

„Dit kan volksgezondheid en openbaar beleid gestalte geven,“ bovengenoemde Burchard. „Als u een groep jonge geitjes test die voor astma of andere gezondheidsvoorschriften in gevaar is, wilt u het op een gebied doen waar de frequentie van het ziektegen het hoogst is. Wij hebben nu een kaart van Mexico die onderzoekers zal helpen die klinische en volksgezondheidsbesluiten nemen.“

Burchard, een pulmonologist het van wie werk zich op het effect van genetisch voorgeslacht op het risico van kinderen van astma en reactie op astmamedicijnen concentreert heeft, de Mexicaanse bevolking sinds 2003, zowel als medische context voor Mexican-Americans als als kans willen bestuderen om Inheemse Amerikaanse genetica te begrijpen. Om dit te doen, bereikte hij Bustamante, die het Centrum van Stanford voor Computer, Evolutieve en Menselijke Genomica leidt.

„Wij werden in het bijzonder gemotiveerd door het feit dat de overgrote meerderheid van genetische studies zich op bevolking van Europese afdaling,“ bovengenoemde Bustamante heeft geconcentreerd. „Wij denken er veel kansen om de biologie te begrijpen zijn, evenals verschillen in ziekteresultaat in verschillende delen van de wereld te begrijpen, door de genetica van complexe ziekte bij verschillende bevolking te bestuderen.“

Tijdens de voorbije paar jaar, zijn de onderzoekers begonnen te begrijpen dat de genetische variatie een zeer eigenaardige structuur heeft, bovengenoemde Bustamante. Sommige gemeenschappelijke genetische varianten bereiken merkbare frequenties (b.v., 30-50 percenten) in veel van de bevolking van de wereld. De Meesten hiervan schijnen om in de menselijke genpool op het tijdstip van grote menselijke diasporas, met inbegrip van de migraties uit Afrika bestaan te hebben. Nochtans, zei Bustamante een „reusachtige vlaag“ van andere veranderingen zich sedertdien heeft voorgedaan aangezien de menselijke bevolking aan de komst en de goedkeuring van landbouw toe te schrijven groeide. Deze zijn veel zeldzamer, voorkomend in ongeveer 1 - aan 2 percent van de bevolking, en om verondersteld te zijn allebei recenter en relevant voor gezondheid en ziekte. Deze zeldzame varianten maken omhoog het grootste deel van genetische wijzigingen die wij in menselijke bevolking hebben gezien.

Veel van deze genetische verschillen reeds zijn gekend om een directe invloed op ons risico voor bepaalde ziekten, zoals het gen BRCA in borstkanker, of onze capaciteit te hebben om medicijnen te metaboliseren. Maar alvorens wij nauwkeurigere therapie kunnen ontwikkelen of hen aan de juiste patiënten voorschrijven, hebben wij veel meer kennis nodig van wat die varianten over diverse bevolking zijn, en hoe zij gezondheid beïnvloeden.

„Dit drijft de bal onderaan het gebied naar precisiegeneeskunde,“ bovengenoemde Burchard. „Wij kunnen iedereen samen niet alleen samendoen en hen Europese Amerikanen of Mexicaanse Amerikanen roepen. Er zijn geweest heel wat weerstand tegen het bestuderen van raciaal gemengde bevolking, omdat zij als te complex zijn beschouwd. Wij denken dat aanbiedingen een echt wetenschappelijk voordeel.“

De Volledige resultaten en een volledige lijst van auteurs kunnen in het document worden gevonden, dat in Sciencemag.org online lijkt. Een representatieve grafiek die van een divers genoom, van gevarieerde erfenis over de genen van één individu een weerspiegeling vormen, kan op de website van het Laboratorium worden gevonden Burchard.

Bron: UCSF

Read in | English | Español | Français | Deutsch | Português | Italiano | 日本語 | 한국어 | 简体中文 | 繁體中文 | Nederlands | Русский | Svenska | Polski