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Génétique de grippe aviaire (H5N1)

La grippe aviaire ou la grippe aviaire a apparu la première fois comme tension mortelle qui a détruit deux volées de poulet en Ecosse. Cette tension, qui est A/chicken/Scotland/59 appelé a depuis subi plusieurs mutations génétiques pour devenir le virus de la grippe hautement pathogène de H5N1 connu aujourd'hui. Avec chaque mutation, le virus est devenu de plus en plus dominant et pathogène, entraînant plus de maladie sévère et un numéro croissant des morts.

La tension dominante de H5N1 à partir de 2004 évoluée entre 1999 et 2002 pour devenir le génotype de Z et désigné également sous le nom de la lignée asiatique HPAI A (H5N1). Cette tension peut être encore divisée en deux clades. Clade 1 se compose de l'être humain de H5N1 et les isolats d'oiseau qui viennent du Cambodge, le Vietnam et la Thaïlande ainsi que l'oiseau isole dans la Malaisie et le Laos. Les virus du clade 2 sont ceux qui ont été trouvés dans les isolats des populations d'oiseau le Japon, la Chine, l'Indonésie et Corée du Sud, qui se sont alors écartés en Europe, Moyen-Orient et l'Afrique.

Les infections de H5N1 qui se sont produites en 2005 et 2006 chez l'homme ont été généralement provoqués par des virus du clade 2. Dans le clade 2 sont six subclades qui ont été recensés utilisant l'analyse génétique. Trois de ces derniers ont une répartition géographique distincte et entraînent des infections humaines. Subclade 1 est trouvé en Indonésie, alors que le subclade 2 est trouvé en Europe, le Moyen-Orient et l'Afrique et le subclade 3 est trouvée en Chine.

Seulement cinq autres génomes de l'Europe entre 2004 et 2006 sont contenus dans Genbank, aucun dont sont la forme de génomes le Moyen-Orient ou l'Afrique du nord. Une étude sur le subclade 2 a effectué a en 2007 montré 36 isolats neufs, qui a étendu les caractéristiques de séquence procurables pour le H5N1.

Terminologie

Comment les différents isolats sont recensés peut être décrit utilisant la tension A/chicken/Nakorn-Patom/Thailand/CU-K2/04 (H5N1) comme exemple.

Ceci peut être décomposé en ce qui suit :

  • A se rapporte à la substance de la grippe (pourraient être A, B ou C)
  • Le poulet est l'animal que l'isolat est trouvé dedans
  • Nakorn-Patom/Thaïlande est la place où le virus est isolé
  • CU-K2 est le numéro de laboratoire employé pour discerner la tension de l'autre grippe d'isolement par même lieu et année.
  • 04 représente l'année de l'isolement (2004)
  • H5 se rapporte au cinquième de plusieurs types connus de hemaglutinin
  • N1 vient dès le début de plusieurs types connus de neuraminidase

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Last Updated: Feb 26, 2019

Dr. Ananya Mandal

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Dr. Ananya Mandal

Dr. Ananya Mandal is a doctor by profession, lecturer by vocation and a medical writer by passion. She specialized in Clinical Pharmacology after her bachelor's (MBBS). For her, health communication is not just writing complicated reviews for professionals but making medical knowledge understandable and available to the general public as well.

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