Aviso: Esta página é uma tradução automática da página original em inglês. Por favor note uma vez que as traduções são geradas por máquinas, não tradução tudo será perfeita. Este site e suas páginas da Web destinam-se a ler em inglês. Qualquer tradução deste site e suas páginas da Web pode ser imprecisas e imprecisos no todo ou em parte. Esta tradução é fornecida como uma conveniência.

Como o genoma do vírus do SARS compara a outros vírus?

SARS-CoV-2 é um betacoronavirus e é relacionado aos SARS-CoV humanos e ao bastão SARS-como CoVs. O genoma de SARS-CoV-2 revela similaridades às diferenças de SARS-CoVs, mas igualmente chaves que podem explicar o transmissibility aumentado de SARS-CoV-2 comparado aos SARS-CoV.

Estrutura de SARS-CoV-2

Crédito de imagem: Orpheus FX/Shutterstock.com

SARS-CoV-2

O coronavirus da Síndrome Respiratória Aguda Grave (SARS-CoV-2), conhecido anteriormente como 2019-nCoV, é o vírus que causa COVID-19. É uma beta-coronavirus pertença da linhagem b à família dos coronaviridae dos nidovirales do pedido (veja a árvore filogenética de SARS-CoV-2). SARS-CoV-2 é um vírus do ssRNA do positivo-sentido da classe IV de Baltimore e é pensado para ter origens zoonotic.

SARS-CoV e o outro Coronaviruses

Dos tipos diferentes de coronaviruses, alfa e beta-coronaviruses arrancar para contaminar mamíferos, visto que a gama e o delta-coronaviruses tendem a contaminar pássaros. Do todo o aqueles que contaminam seres humanos, lá são actualmente 7 ser humano conhecido CoVs: HCoV-NL63, HCoV-229E (ambos os alphacoronaviruses), e HCoV-OC43, HCoV-HKU1, SARS-CoV, MERS-CoV, e SARS-CoV-2 (beta coronaviruses).

SARS-CoV-2 compartilha da similaridade total a mais alta da seqüência do genoma ao coronavirus RaTG13 do bastão. Contudo, o RBD compartilha de mais similaridade da seqüência com o coronavirus SARS-CoV do pangolin (MP489/Guandong/2019), que ambos ligam a ACE2. Isto sugere a evidência de um evento da recombinação na evolução de SARS-CoV-2 devido ao animal que mistura antes de evoluir para contaminar seres humanos.

Todos os coronaviruses contêm os genomas 26,000-32,000bp com quadros 6-11 de leitura abertos variáveis (ORFs) que codificam proteínas não-estruturais assim como proteínas estruturais: crave a glicoproteína (s), uma proteína de envelope pequena (e), proteína da matriz (M) & proteína do nucleocapsid (N).

SARS-CoV-2 é relacionado a SARS-CoV, o vírus que causa SARS, além do que SARS-como o bastão CoVs (RaTG13/CoVZC45/CoVZCX21), e todo o ligamento ao receptor ACE2 devido a suas seqüências genomic do domínio similar de S. Além disso, uma grande proporção dos genomas SARS-CoV e SARS-CoV-2 é idêntica, contudo, as diferenças notáveis ocorrem nos lugar chaves tais como a ausência da proteína 8a e de uma proteína 8b mais longa em SARS-CoV-2.

Em uma análise, havia 380 substituições do ácido aminado entre os vírus de SARS-CoV-2 e de SARS/SARS-like, situados especificamente em nsp2 & em nsp3. 6 substituições foram encontradas no RBD no lugar 357-528 do ácido aminado, com umas 4 substituições mais adicionais na região de C-término do domínio S1.

Contudo, nenhuma substituição foi encontrada em nsp7, em nps13, em E, em M, e nas proteínas acessórias p6 e 8b. Isto sugere que as substituições de deferimento do domínio de RBD sejam provavelmente atrás da parogenicidade e do transmissibility aumentados entre SARS-CoV-2 e SARS-CoV.

SARS-CoV-2 possui um quadro de leitura aberto intacto 8 sem o supressão do NT 29 que é encontrado em uma maioria de SARS-CoV humanos. Além disso, SARS-CoV-2 contem um laço proteolytically sensível distinto da activação (local polybasic da segmentação do furin) na junção S1-S2 que não é encontrada tipicamente em outros beta coronaviruses humanos da linhagem b.

Contudo, esta é uma característica de diversos outros coronaviruses animais e humanos, tais como HKU1 (linhagem a). Comparado aos SARS-CoV, a adição de tal local da segmentação é pensada para aumentar a fusão da pilha-pilha sem afetar a entrada viral, embora o papel exacto deste local deva ser determinada ainda inteiramente.

MERS-CoV diverge dos SARS-CoV & do SARS-CoV-2 no RBD enquanto MERS-CoV liga a DDP4. Além disso, as proteínas codificadas pp1ab, pp1a, E, M, proteína acessória 7a, e genes de N variam consideravelmente entre os genomas SARS-CoV/CoV-2.

Outros vírus respiratórios principais incluem os virus da gripe, que pertencem à família de Orthomyxoviridae do reino dos orthornavirae. A gripe A e os B contaminam seres humanos, mamíferos & pássaros visto que os tipos C & da influência de D primeiramente animais. Todas as pandemias principais da gripe foram causadas pelo tipo virus da gripe de A.

Os virus da gripe são vírus do RNA do negativo-sentido comparados aos coronaviruses do positivo-sentido. As vacinas sazonais da gripe são projectadas incorporar o tipo sazonal recente tensões da gripe de A, e como tal, ofereça pouco à protecção zero contra coronaviruses.

Com exceção das diferenças genomic vastas entre beta coronaviruses da linhagem b e dactilografe os virus da gripe, a presença de um local eficiente da segmentação em SARS-CoV-2, e o haemagglutinin (HA) em tensões da gripe, pode ser o factor causal que é réplica e transmissão viral rápida e parogenicidade aumentada de ambos os vírus.

Porque esta não é tipicamente uma característica de coronaviruses do bastão e do pangolin (embora nosso conhecimento de todas estas tensões é limitado), pode-se ser que SARS-CoV-2 adquira este da primeira transmissão humano-humana, ou através do contudo de bastão ou de pangolin não identificado SARS-como CoV.

Em resumo, SARS-CoV-2 compartilha de um alto nível da similaridade genomic entre outros beta coronaviruses que incluem SARS-CoV humanos e batSARS-like-CoVs/RaTG13. Enquanto seus genomas são pela maior parte idênticos, as diferenças genomic da chave estão sugerindo uma evolução diferente de SARS-CoV-2, envolvendo muito provavelmente batSARS-como-CoVs.

Compreendendo as diferenças genomic querem ajudam cientistas a desenvolver vacinas altamente eficazes contra SARS-CoV-2, assim como a aprender como os vírus evoluem.

Fontes:

Further Reading

Last Updated: Jul 27, 2020

Osman Shabir

Written by

Osman Shabir

Osman is a Neuroscience PhD Research Student at the University of Sheffield studying the impact of cardiovascular disease and Alzheimer's disease on neurovascular coupling using pre-clinical models and neuroimaging techniques.

Citations

Please use one of the following formats to cite this article in your essay, paper or report:

  • APA

    Shabir, Osman. (2020, July 27). Como o genoma do vírus do SARS compara a outros vírus?. News-Medical. Retrieved on October 29, 2020 from https://www.news-medical.net/health/How-Does-the-SARS-Virus-Genome-Compare-to-Other-Viruses.aspx.

  • MLA

    Shabir, Osman. "Como o genoma do vírus do SARS compara a outros vírus?". News-Medical. 29 October 2020. <https://www.news-medical.net/health/How-Does-the-SARS-Virus-Genome-Compare-to-Other-Viruses.aspx>.

  • Chicago

    Shabir, Osman. "Como o genoma do vírus do SARS compara a outros vírus?". News-Medical. https://www.news-medical.net/health/How-Does-the-SARS-Virus-Genome-Compare-to-Other-Viruses.aspx. (accessed October 29, 2020).

  • Harvard

    Shabir, Osman. 2020. Como o genoma do vírus do SARS compara a outros vírus?. News-Medical, viewed 29 October 2020, https://www.news-medical.net/health/How-Does-the-SARS-Virus-Genome-Compare-to-Other-Viruses.aspx.

Comments

  1. S P S P Portugal says:

    Are we sure that by detecting the sars-cov-2 via rt-pcr we don´t detect the other Coronaviridae family species as well? Can't find direct comparison of sequences on web.

The opinions expressed here are the views of the writer and do not necessarily reflect the views and opinions of News Medical.