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Ordonnancement de prochain rétablissement : Les éléments

Par sortie Roberts, BSC (chéris)

Également su de en tant que débit élevé ordonnançant, l'ordonnancement de prochain rétablissement (NGS) est le terme employé pour décrire plusieurs technologies de ordonnancement modernes qui permettent à des scientifiques d'ordonnancer l'ADN et l'ARN à beaucoup de cadence rapide et meilleur marché qui Sanger ordonnançant, la technique précédemment utilisée. NGS a révolutionné l'étude de la biologie moléculaire et de la génomique.

L'ordonnancement d'acide nucléique est une technique employée pour déterminer la séquence exacte des nucléotides dans une molécule donnée d'ADN ou d'ARN. La première génération ordonnançant ou ordonnancement de Sanger était la technique employée pour remplir le projet génome humain, qui a terminé en 2003.

Une fois que la première séquence de génome humain avait été élucidée, des chercheurs commencés pour exiger les techniques qui leur permettraient de compléter l'ordonnancement plus rapidement et à un coût meilleur marché. Ceci a mené au développement des plates-formes de NGS ; plates-formes qui pourraient fournir massivement l'ordonnancement parallèle et permettre à des millions de fragments d'ADN d'être ordonnancées simultanément. Utilisant cette technologie, les chercheurs peuvent réaliser assez un haut de débit pour ordonnancer un génome entier dans juste un d'un seul jour.

Les plates-formes de NGS réalisent l'ordonnancement dans différentes voies, mais plusieurs des plates-formes les plus utilisées généralement sont basées sur une méthodologie assimilée, qui comporte la préparation de matrice, suivie de l'ordonnancement et de l'analyse de représentation et, en conclusion, de caractéristiques.

Préparation de matrice

La préparation de matrice se rapporte à la construction et à l'amplification d'une bibliothèque d'acide nucléique, qui peut se composer de l'ADN ou de l'ADN élogieux. Pour construire la bibliothèque de ordonnancement, l'échantillon d'acide nucléique est réduit en fragments et les extrémités des fragments d'ADN sont ligaturées avec les molécules d'ADN chimiquement synthétisées dont la séquence de nucléotides est déjà connue. Une fois qu'une bibliothèque a été établie, elle doit être amplifiée avant l'ordonnancement peut être exécutée.

Ordonnancement et représentation

Les éclats dans la bibliothèque fournissent une matrice pour la création d'un fragment d'ADN neuf. Les éclats sont lavés et noyés séquentiellement avec des nucléotides connus. Pendant que les nucléotides deviennent comportés au neuf, brin d'ADN croissant, ils sont enregistrés comme information de séquence.

Analyse de caractéristiques

L'ordonnancement suivant, les caractéristiques neuves de séquence doit s'analyser. La caractéristique doit être prétraitée afin de retirer de mauvaise qualité s'affiche et des séquences d'adaptateur. La caractéristique est alors tracée à un génome de référence et la séquence s'analyse.

L'analyse peut concerner des évaluations variées de bio-informatique telles que le variant génétique appelant pour recenser des polymorphismes uniques de nucléotide (SNPs) ; l'identification des gènes nouveaux, le dépistage des événements de mutation ou enquête sur le degré d'expression de transcription.

Le logiciel exigé pour analyser des caractéristiques de séquence est souvent librement accessible en ligne.

Applications

NGS a un grand nombre d'applications, facilitant de ce fait des progrès techniques rapides en travers de beaucoup d'inducteurs des sciences biologiques. Le génome humain re-est ordonnancé afin de trouver les facteurs génétiques qui contribuent à la maladie. NGS a permis à des chercheurs d'acquérir des connaissances significatives au sujet d'un large éventail d'organismes utilisant l'ordonnancement d'entier-génome.

La technologie est des études d'épidémiologie également utilisée et de santé publique, pour ordonnancer des bactéries et des virus et aider à trouver les facteurs qui peuvent contribuer à la virulence. En outre, dans la recherche d'expression du gène, NGS d'ARN a commencé à remonter l'analyse de puce ADN, permettant à des chercheurs de voir la séquence de l'expression d'ARN. Cet ordonnancement d'ARN peut fournir des informations sur le transcriptome entier d'un échantillon dans une analyse, sans n'importe quelle connaissance précédente de la séquence génétique d'un organisme étant exigée.

Ce sont seulement quelques unes des applications lesquelles NGS peut faciliter des chercheurs et des cliniciens et pendant que la technologie continue à devenir des applications plus très utilisées et plus nouvelles seront inévitablement développés.

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Last Updated: Feb 26, 2019

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