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Protéomique de plasma

Beaucoup de maladies continuelles ou de mode de vie se produisent sans facteurs de risque traditionnels l'uns des, excluant la possibilité d'intervention préventive. L'utilisation des biomarqueurs proteomic pour cette raison est eue un besoin urgent pour compléter et améliorer les informations disponibles par la stratification du risque conventionnelle.

Les prises de sang sont le type le plus courant de tests biologiques utilisés dans la pratique clinique et l'essai en laboratoire. Elles sont basées sur les changements du nombre de protéines variées dans le sang. Cependant, faire ceci à grande échelle en surveillant simultanément toutes les protéines du sang (c'est-à-dire, le protéome de sang) met en évidence l'illustration réelle de l'expression de la protéine dans la santé et la maladie.

La protéomique de plasma est une condition qui décrit l'analyse de haut-débit des biomarqueurs de plasma utilisant les instruments très puissants, sensibles et spécifiques. Jusqu'environ à 2002, la technologie la plus de pointe pour l'analyse de protéine de plasma était la 2D approche de PAGE, avec laquelle environ 289 protéines ont été isolées tout au plus. Aujourd'hui plus de 10 000 sont connus, en grande partie le résultat d'employer la chromatographie avancée pour séparer des composantes des mélanges bruts de peptide dans des cotes multiples, en combination avec l'analyse spectrométrique (MS) de masse. Ceci permet à des milliers d'échantillons de s'analyser en mode de haut-débit.

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Crédit d'image : Sergei Drozd/Shutterstock

Méthodes employées dans la protéomique de plasma

L'albumine sérique, les globulines, et les facteurs de complément composent plus de 99% du total de protéome de plasma, l'effectuant parmi les sous-protéomes les plus compliqués et les plus divers dans l'organisme humain.

Les méthodes nouvelles de préparation des échantillons ont également évolué pour aider à trouver même ces protéines qui sont présentes à extrêmement - des concentrations inférieures dans le plasma. Celles-ci comprennent la purification d'affinité pour obtenir une protéine et une immunochimie spécifiques pour éliminer des protéines dans les fortes concentrations. D'ailleurs, les outils ultra-rapides de milliseconde et le lancement des plates-formes de LC pour des flux durables de nanoscale ont permis à des flux de travail robustes dans les protéomiques d'approfondir l'analyse.

Avantages

Un des avantages en chef des protéomiques de plasma est la disponibilité pratique du sang dans la circulation périphérique, permettant pour obtenir des échantillons d'une façon droite. Le sang est également le support qui baigne tous les tissus et cellules et transporte des substances synthétisées, sécrété, dégradé ou absorbé aux sites variés. C'est pour cette raison que des biomarqueurs de diffusion ont été étudiés plus souvent que des marqueurs sanguins de site-détail.

Éditions

Cependant, une édition avec cette pratique est que les changements des biomarqueurs de diffusion pourraient réfléchir la maladie ou le dérangement de n'importe quel système d'organe plutôt qu'un état spécifique, à moins que la borne soit elle-même spécifique comme la troponine T qui est relâchée seulement des myocytes cardiaques endommagés.

Un autre problème est le plus grand rapport du signal-bruit, diminuant sa valeur prévisionnelle et par conséquent son utilité clinique. Ceci peut seulement être adressé à l'aide des procédures interventionnelles pour prélever des prises de sang d'un récipient apparaissant de l'organe d'intérêt, qui n'est pas faisable dans la plupart des cas.

Cependant, la plus grande préoccupation est la large gamme de concentration des protéines variées dans le plasma plus de 12 ordres de grandeur, du micromolar au niveau femtomolar.

Un autre obstacle est qui sont non seulement là des milliers de protéines mais ceux-ci sont connus pour se produire sous beaucoup de formes suivant la modification goujon-de translation. Les protéines de plasma changent également avec différentes conditions et étapes métaboliques et physiologiques. Il y a également des différences brutes dans le type et le nombre de protéines mesurées exprimées en plasma, selon le type d'échantillon, à savoir, plasma contre des tissus ou des cellules. Pour surmonter ceci, plusieurs approches analytiques très sophistiquées sont mises dans l'utilisation, se concentrant sur apprivoiser la complexité des protéines de plasma et de leur dynamique.

La variation biologique est autre sujet à adresser. Parmi des types, ceci est type fait à l'aide des groupes mis en commun des personnes en bonne santé et malades. L'analytique de protéomique fournit la quantification impartiale des protéines dans la personne moyenne, en bonne santé ou malade. Cependant, ceci n'offre aucune solution au problème de la variation biologique individuelle pour différentes protéines. L'albumine, par exemple, montre la variabilité très inférieure parmi des personnes. D'autre part, d'autres protéines de plasma ont une gamme très étendue de variabilité entre les personnes de sorte que même les grandes différences dans leur concentration parmi les gens différents ne puissent pas n'être d'aucune importance médicale. Ceci est démasqué seulement par le contrôle de grande puissance de beaucoup de différents échantillons pour l'expression de la protéine quantitative, qui est rarement faite et seulement dans des numéros limités, si puis. L'approche mise en commun est susceptible de manquer beaucoup de biomarqueurs potentiellement utiles en ignorant les petites mais instructives différences entre les groupes parce qu'elles ne s'élèvent pas aux variations de pli.

Applications

La protéomique de plasma peut aider de manière significative à prévoir les maladies traiter, métaboliques et autres continuelles de début de et d'une façon personnalisée, et pour recenser des effets inverses des médicaments. L'évolution des biomarqueurs nouveaux pour des états de la maladie exige l'identification des biomarqueurs potentiels par des études cas-témoins, ou actuel par des études longitudinales. Ceci est alors vérifié par analyse visée d'un numéro plus grand des échantillons de plasma. En conclusion, les bornes de candidat sont vérifiées dans de grandes cohortes des sujets pour évaluer leur sensibilité, spécificité, et utilité par validation clinique.

Last Updated: Oct 8, 2018

Dr. Liji Thomas

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Dr. Liji Thomas

Dr. Liji Thomas is an OB-GYN, who graduated from the Government Medical College, University of Calicut, Kerala, in 2001. Liji practiced as a full-time consultant in obstetrics/gynecology in a private hospital for a few years following her graduation. She has counseled hundreds of patients facing issues from pregnancy-related problems and infertility, and has been in charge of over 2,000 deliveries, striving always to achieve a normal delivery rather than operative.

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