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Plasma Proteomics

Muchas enfermedades crónicas o de la forma de vida ocurren sin los factores de riesgo tradicionales uces de los, impidiendo la posibilidad de la intervención preventiva. El uso de biomarkers proteomic por lo tanto es necesitado urgente para complementar y para aumentar la información disponible por la estratificación convencional del riesgo.

Los análisis de sangre son el tipo más común de pruebas biológicas usadas en el prueba de la práctica clínica y de laboratorio. Se basan sobre los cambios en el número de diversas proteínas en la sangre. Sin embargo, hacer esto a gran escala simultáneamente vigilando todas las proteínas de sangre (es decir, el proteome de la sangre) pone en evidencia la imagen real de la expresión de la proteína en salud y enfermedad.

El proteomics del plasma es un término que describe el análisis de la alto-producción de los biomarkers del plasma usando los instrumentos muy potentes, sensibles y específicos. Hasta cerca de 2002, la tecnología más avanzada para el análisis de la proteína del plasma era la 2.a aproximación de la PAGINACIÓN, con la cual cerca de 289 proteínas fueron aisladas a lo más. Más de 10 000 se conocen hoy, en gran parte el resultado de usar la cromatografía avance para separar los componentes de las mezclas crudas del péptido en dimensiones múltiples, conjuntamente con análisis espectrométrico (MS) en masa. Esto permite que los millares de muestras sean analizados en una manera de la alto-producción.

Haber de imagen: Sergei Drozd/Shutterstock
Haber de imagen: Sergei Drozd/Shutterstock

Métodos usados en el plasma Proteomics

La albúmina de suero, las globulinas, y los factores del complemento componen sobre el 99% del total de proteome del plasma, haciéndolo entre el sub-proteomes más complicado y más diverso del organismo humano.

Los métodos nuevos de preparación de la muestra también se han desarrollado para ayudar a descubrir incluso esas proteínas que están presentes en extremadamente - las concentraciones inferiores en plasma. Éstos incluyen la purificación de la afinidad para obtener una proteína y una inmunoquímica específicas para eliminar las proteínas en altas concentraciones. Por otra parte, las herramientas de alta velocidad del ms y el lanzamiento de las plataformas del LC para los flujos duraderos del nanoscale han permitido a flujos de trabajo robustos en proteomics profundizar el análisis.

Ventajas

Una de las principales ventajas del proteomics del plasma es la disponibilidad conveniente de la sangre en la circulación periférica, permitiendo obtener muestras de una manera directa. La sangre es también el ambiente que baña todos los tejidos y células y lleva las substancias sintetizadas, secretadas, degradadas o absorbentes en los diversos sitios. Es por esta razón que los biomarkers de circulación se han estudiado más a menudo que marcadores sitio-específicos de la sangre.

Entregas

Sin embargo, una entrega con esta práctica es que los cambios en biomarkers de circulación podrían reflejar enfermedad o el trastorno de cualquier sistema del órgano bastante que una condición específica, a menos que el marcador sea sí mismo específico por ejemplo la troponina T que se libera solamente de miocitos cardiacos dañados.

Otro problema es la índice creciente de la señal ruido, disminuyendo su valor profético y por lo tanto su utilidad clínica. Esto se puede dirigir solamente usando procedimientos interventional para recoger muestras de sangre de un buque que emerge del órgano del interés, que no es posible en la mayoría de los casos.

Sin embargo, la preocupación más grande es la amplia gama de la concentración de las diversas proteínas en plasma sobre 12 órdenes de magnitud, del micromolar al nivel femtomolar.

Otro obstáculo es que no sólo está allí los millares de proteínas pero éstos se saben para ocurrir en muchas formas que siguen la modificación poste-de translación. Las proteínas del plasma también cambian con los diversos estados y escenarios metabólicos y fisiológicos. Hay también diferencias gruesas en el tipo y el número de proteínas cuantificadas expresadas en plasma, dependiendo del tipo de muestra, viz, plasma comparado con tejidos o células. Para vencer esto, varias aproximaciones analíticas muy sofisticadas se están poniendo en el uso, centrándose en la domesticación de la complejidad de las proteínas del plasma y de su rango dinámico.

La variación biológica es otro tema que se dirigirá. Entre clases, esto se hace típicamente usando las muestras reunidas de individuos sanos y enfermos. El analytics de Proteomics rinde la cuantificación imparcial de las proteínas en el individuo medio, sano o enfermo. Sin embargo, esto no ofrece ninguna solución al problema de la variación biológica individual para las proteínas individuales. La albúmina, por ejemplo, muestra variabilidad muy inferior entre individuos. Por otra parte, otras proteínas del plasma tienen un alcance muy grande de la variabilidad entre los individuos de modo que incluso las diferencias grandes en su concentración entre diversa gente no puedan ser de ninguna importancia clínica. Esto es desenmascarada solamente por la prueba en grande de muchas muestras individuales para la expresión cuantitativa de la proteína, que se hace raramente y solamente en números limitados, si entonces. La aproximación reunida es probable faltar muchos biomarkers potencialmente útiles ignorando las diferencias pequeñas pero informativas entre los grupos porque no ascienden a las variaciones del doblez.

Usos

El proteomics del plasma puede ayudar importante a predecir las enfermedades del inicio de y tratar, metabólicas y otras crónicas de una manera personalizada, y determinar efectos nocivos de drogas. La evolución de los biomarkers nuevos para las condiciones de la enfermedad requiere la identificación de biomarkers potenciales por estudios del caja-mando, o actualmente por estudios longitudinales. Esto entonces es verificada por análisis apuntado de un mayor número de muestras del plasma. Finalmente, los marcadores del candidato son probados en cohortes grandes de temas para evaluar su sensibilidad, especificidad, y utilidad por la validación clínica.

Fuentes

[Lectura adicional: Proteomics]

Last Updated: Oct 8, 2018

Dr. Liji Thomas

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Dr. Liji Thomas

Dr. Liji Thomas is an OB-GYN, who graduated from the Government Medical College, University of Calicut, Kerala, in 2001. Liji practiced as a full-time consultant in obstetrics/gynecology in a private hospital for a few years following her graduation. She has counseled hundreds of patients facing issues from pregnancy-related problems and infertility, and has been in charge of over 2,000 deliveries, striving always to achieve a normal delivery rather than operative.

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