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El árbol filogenético del virus SARS-CoV-2

SARS-CoV-2 es un beta-coronavirus que probablemente palo-se soporta originalmente antes de saltar a los seres humanos para causar el pandémico COVID-19.

Árbol filogenético de SARS-CoV-2

Haber de imagen: https://www.ecohealthalliance.org/

No se piensa a una mayoría de las mutaciones que han ocurrido hasta la fecha tienen solamente efectos suaves sobre el virus, y ninguna haber llevado a una novela o a una deformación más peligrosa actualmente. Esto da la gran esperanza de vacunaciones y de tratamientos acertados. No es inesperado, eso en el futuro, el virus se desarrollará a diversas deformaciones como gripe.

¿Cuál es un árbol filogenético?

Los árboles filogenéticos son representaciones diagramáticas de la evolución entre diversa especie relacionada basada en sus semejanzas genéticas y físicas. En un nivel más amplio, los árboles filogenéticos originan de un antepasado común del `' que da lugar a la multitud de vida incluyendo bacterias, archaea, y Eukaryota.

Los virus son especies biológicas, en el sentido que comprenden de series del ácido nucléico y están conforme a una amplia gama de cambios evolutivos incluyendo mutaciones a sus series. Mientras que los virus no son organismos vivos, la capacidad de las series virales del ácido nucléico de acumular cambios con mutaciones o la recombinación con la otra especie da lugar a linajes virales nuevos.

Árbol filogenético SARS-CoV-2

El coronavirus de la neumonía asiática (SARS-CoV-2) es la causa del pandémico global en curso del coronavirus disease-2019 (COVID-19) que originó hacia mediados de diciembre de 2019 en provincia de Wuhan, Hubei de China. El 11 de marzo de 2020, COVID-19 fue declarado que un pandémico global por la Organización Mundial de la Salud y el virus se había extendido a la mayoría de las naciones.

SARS-CoV-2 es el pertenecer beta-coronavirus del linaje-b a la familia de los coronaviridae. Esta familia pertenece a los nidovirales de la orden, de los pisonivirecetes clasifica, del fílum del pisuviricota, del reino de los orthomavirae, del reino del ribovaria. Como tal, el virus tiene un genoma del ARN (+ssRNA con la única ordenación lineal) con la polimerasa de ARN ARN-relacionada (RdRp) que produce el ARN del ARN.

Los coronaviruses beta del Linaje-b incluyen el virus SARS-CoV que causa el SARS y ambos atan al receptor ACE2. Sin embargo, a diferencia de los SARS-CoV, SARS-CoV-2 contiene un rizo distinto y proteolytically sensible evolutivo de la activación (furin-como sitio de la hendidura) que sea probablemente la razón detrás de su patogenicidad y transmisibilidad crecientes.

El origen de SARS-CoV-2 se considera ser palo-soportado debido a la semejanza genética cercana a los coronaviruses del palo (el 96%). No hay pruebas concretas para sugerir que otro ordenador principal era un depósito para el virus antes de transmisión a los seres humanos, aunque el virus comparta la semejanza del hasta 92% a los coronaviruses del pangolin.

Un ciertas pruebas han sugerido que puede ser que SARS-CoV-2 palo-soportado saltara a los pangolins, de nuevo a los palos (que incorporan una cierta homología del pangolin), y entonces a los seres humanos.

Virus SARS-CoV-2

Haber de imagen: Kateryna Kon/Shutterstock.com

Mutaciones recientes a SARS-CoV-2

El análisis del virus SARS-CoV-2 a través de diversas naciones en diversas horas del pandémico ha revelado que el virus ha experimentado varias mutaciones, algunos que no parecen tener ningún impacto importante en el virus, mientras que otras mutaciones son probablemente más importantes y pueden referir a la divergencia de la deformación - si éste significa el virus ha llegado a ser sin embargo más virulento no está inmediatamente sin obstrucción, y puede incluso llevar al virus que llega a ser más débil que la forma actual.

Es inevitable que como progresa el tiempo, el virus acumulará mutaciones independientes en ubicaciones diferentes. Hasta la fecha, la mayor parte de las mutaciones que han ocurrido son solamente moderado genético diversas con una diferencia del promedio en parejas de 9.6SNPs entre cualquier dos genomas (según un estudio); cuál muestra que el antepasado común es reciente y tiene un índice de la mutación alrededor 6x10-4 de los nucleótidos/genoma/año.

Las mutaciones específicas que han ocurrido en SARS-CoV-2 son en gran parte neutrales, aunque algunos estén permitiendo que el virus adaptara más al ordenador principal humano. Sin embargo, una de las diversiones más fuertes ha ocurrido en el sitio 11083 de Orf1a que codifica Nsp6. Éste es probablemente el sitio ese los resultados en T-células de CD4+/CD8+. Los cambios dentro de esta región pueden explicar las diferencias en inmunorespuestas a SARS-CoV-2.

Un estudio ha clasificado algunas deformaciones suavemente diversas de SARS-CoV-2. Pulse A refiere a la variante china original (dos sub-atados con una mutación en T29095C). El tipo B está también presente en países asiáticos, los E.E.U.U., y Europa. El tipo B diverge del tipo A por 2 mutaciones: T8782C y C28144T - estes último dando por resultado el cambio de la leucina a una serina. El tipo C difiere del tipo B en G26144T (glicocola a la valina) y está el la variante europea mayor, y en gran parte ausente en China.

A pesar de la presencia de deformaciones divergentes suaves que comprendan mutaciones específicas en las situaciones específicas (tipos A.C.) que son geográficamente diferentes, es importante para la tensión, que hay actualmente deformaciones divergentes no distintas de SARS-CoV-2 y cualquier vacuna el alcance de la deformación actual debe trabajar eficazmente.

Debido a la naturaleza zoonótica de SARS-CoV-2, está al lado de imposible predecir la trayectoria de la diversidad filogenética futura del virus, y cómo puede adaptarse y desarrollarse para infectar a seres humanos en maneras diferentes.

Como con los virus de gripe; cuáles tienen varias deformaciones divergentes, SARS-CoV-2 puede también divergir en deformaciones múltiples con índices que difieren de valencia y de transmisibilidad. Ésta sería la preocupación más grande por cualquier revelado vaccíneo, y solamente el tiempo dirá si tales deformaciones divergentes más grandes se convierten.

En resumen, SARS-CoV-2 comparte el alto palo-coronaviruses de la homología y mientras que palo-se soporta tal probablemente. El papel de un depósito del ordenador principal intermedio, probablemente pangolins, debe todavía ser confirmado. Mientras que las mutaciones numerosas han ocurrido dentro de SARS-CoV-2 que daba lugar a variantes geográficas distintas, no se piensa ningunos actualmente haber divergido fuertemente para crear una deformación nueva al virus actual SARS-CoV-2 en la circulación.

Fuentes:

  • Jaimes y otros, 2020. El análisis filogenético y el modelado estructural de la proteína del pico SARS-CoV-2 revela un rizo sensible distinto y de Proteolytically evolutivo de la activación. De Biol de J Mol. 1 de mayo 2020; 432(10): 3309-3325. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32320687/
  • Stafanelli y otros, 2020. Entero-genoma y análisis filogenético de dos deformaciones SARS-CoV-2 aisladas en Italia en enero y febrero de 2020: pistas adicionales en las introducciones múltiples y circulación adicional en Europa. Surveil euro. 2 de abril 2020; 25(13): 2000305. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32265007/
  • Forster y otros, 2020. Análisis de red filogenético de los genomas SARS-CoV-2. Proc Acad nacional Sci los E.E.U.U. 117(17): 9241-9243 https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32269081/
  • Van Dorp y otros, 2020. Aparición de la diversidad genomic y de las mutaciones periódicas en SARS-CoV-2. 83:104351 https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1567134820301829?via%3Dihub de la infección, de la genética y de la evolución

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Last Updated: Jul 20, 2020

Osman Shabir

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Osman Shabir

Osman is a Neuroscience PhD Research Student at the University of Sheffield studying the impact of cardiovascular disease and Alzheimer's disease on neurovascular coupling using pre-clinical models and neuroimaging techniques.

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