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¿Qué mutaciones de SARS-CoV-2 están causando la preocupación?

Mientras que los virus se exponen a las presiones ambientales de la selección, se transforman y se desarrollan, generando las variantes que pueden poseer virulencia aumentada.

mutaciones sars-cov-2Haber de imagen: joshimerbin/Shutterstock.com

El índice de la mutación de virus del ssRNA se observa para ser mucho más alto que los organismos que poseen el ssDNA, y muchas veces más que ésos con el dsDNA. No todas las mutaciones aumentan necesariamente virulencia, y en la mayoría de casos puede de hecho ser perjudicial o inconsecuente.

Por lo tanto, los organismos deben encontrar un equilibrio entre un alto régimen de la mutación que permita que se adapten a cambiar condiciones ambientales, e inferior que aminora la incidencia de mutaciones catastróficas. Los pequeños virus de la DNA pueden codificar para su propia reparación de la DNA, y algunos virus del ARN también comparten la capacidad de verificar para y de reparar desvíos de la réplica.

Sin embargo, mientras que los virus de la DNA confían generalmente en la maquinaria de la transcripción de la célula huesped, los virus del ARN codifican para su propia maquinaria de la transcripción, significando que su régimen de la réplica y de la mutación está relacionado más directamente con su propio genoma y está conforme a las mismas presiones evolutivas.

2012) notas de Vignuzzi y de Andino (que el descendiente de los virus del ARN, con los genomas cayendo común en la gama de tallas del kb 7-12 de largo, tiende a soportar uno o dos mutaciones distintas por sitio del nucleótido. El genoma del coronavirus 2 de la neumonía asiática (SARS-CoV-2) es probablemente el kb alrededor 27-31 de largo, aumentando el número total de mutaciones detectadas, sin necesariamente el aumento del régimen de incidencia.

La capacidad de detectar rápidamente nuevas características genéticas permite que los virus emerjan en ordenadores principal nuevos, que eviten inmunidad vacuna-inducida, y que lleguen a ser más virulentos, pero puede también ser una espada de doble filo en términos de perfeccionar aptitud física total del genoma.

¿Qué variantes de SARS-CoV-2 se han encontrado?

Una nueva deformación con un número determinado grande de mutaciones primero fue observada en el Reino Unido en septiembre de 2020, llamó VOC 202012/01 (una variante de la preocupación - diciembre de 2020), y también conocido como cualquier 20B/501Y.V1or B.1.1.7 por la CDC.

Según la CDC, a partir de los 11th de enero de 2021, 72 casos de B.1.1.7 se han encontrado hasta ahora en los Estados Unidos. Encontraron en California o la Florida, probablemente debido a una combinación de un visitation más alto y aumentó a la mayoría de estas variantes régimen de la prueba en estos estados comparados con otros.

SARS-CoV-2 obra recíprocamente con los receptores ACE2 en la carrocería que usa su proteína del pico. Esto consiste en dos subunidades, las primeras cuyo contiene el dominio receptor-obligatorio. El linaje B.1.1.7 tiene una mutación en el dominio receptor-obligatorio, específicamente con un aminoácido de la asparragina que es reemplazado por tirosina en la posición 501, así la mutación se llama N501Y.

Además, la deformación muestra a menudo una supresión de los aminoácidos 69 y 70, también considerada para presentarse espontáneamente en otras deformaciones, causando un cambio conformacional de la proteína del pico. En la posición 681, una mutación de un aminoácido de la prolina a la histidina también se ha encontrado para presentarse espontáneamente en varias deformaciones y es prominente en B.1.1.7, al igual que una mutación para abrir el marco de lectura 8, la función cuyo no se entiende todavía completo. Un ciertas pruebas sugieren que esta deformación sea más transmisible, aunque no aparece inducir síntomas más severos o aminorar eficacia vaccínea.

Otra deformación, B.1.351 (también conocido como 20C/501Y.V2), también comparte la mutación de N501Y, aunque no expresa específicamente la supresión de las posiciones 69 y 70. Esta variante primero fue descubierta en Suráfrica, octubre de 2020, y se ha encontrado en varios otros países desde entonces, incluyendo Zambia, donde estaba la deformación predominante en diciembre de 2020.

Como B.1.1.7, las mutaciones de B.1.351 no se han encontrado para afectar severidad de la enfermedad. Semejantemente, la mutación de P681H considerada a menudo en B.1.1.7 se ha observado en una deformación que originaba en Nigeria, B.1.1.207, aunque ninguno de las otras 22 mutaciones únicas a B.1.1.7 se observa.

Otra deformación de la nota fue descrita recientemente en Japón por el instituto nacional de enfermedades infecciosas, pensamiento para haber llegado en el país del Brasil en los 6th de enero. Se llama B.1.1.248, y soporta 12 mutaciones en la proteína del pico, incluyendo el N501Y previamente mencionado y una cantina del ácido glutámico con lisina en la posición 484 (E484K).

Esta misma mutación también fue denunciada en una pieza distinta del mismo linaje variable que B.1.1.248 en el mismo día en el Brasil, demostrando la variabilidad incluso dentro solamente de linajes recientemente determinados. La mutación de E484K había sido denunciada previamente en un diverso linaje que originaba en el Brasil ya desde el verano de 2020 (B.1.1.28).

La espontaneidad evidente del revelado de algunas de las mutaciones dominantes que se han discutido aquí, N501Y y E484K, sugiere que el virus podría experimentar presiones convergentes de la selección en el mundo entero, con las formas más transmisibles superando a sus primos.

¿Qué regiones del genoma SARS-CoV-2 transforman la mayoría?

Un meta-estudio grande realizado por Koyama, Platt y Parida (2020) recolectados sobre 10.000 genomas SARS-CoV-2 por todo el mundo y comparados les para descubrir las mutaciones mas comunes, determinando casi 6.000 variantes distintas.

El segmento más divergente del genoma era ORF1ab, que es con mucho el más grande pues ocupa alrededor de un tercero del genoma. ORF1ab se transcribe en un complejo del multiprotein que se hienda eventual en varias proteínas nonstructural que estén implicadas en la transcripción. Algunas de estas proteínas son el objetivo del remdesivir antivirus de las drogas y el favipiravir, que pueden ser una tema de inquietud con respecto al revelado de una deformación contra la cual estas drogas no tengan ningún efecto.

La segunda región diversa del genoma SARS-CoV-2 está alrededor de la proteína del pico, que debe seguir conservada en gran parte para obrar recíprocamente con ACE2. Algunas mutaciones, tales como D364Y, se han denunciado para aumentar la estabilidad estructural de la proteína del pico, aumentando su afinidad para el receptor. Sin embargo, la mayoría son probables aminorar la virulencia del virus hasta tal punto que muere el linaje rápidamente lejos.

Referencias

Further Reading

Last Updated: Jan 21, 2021

Michael Greenwood

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Michael Greenwood

Michael graduated from Manchester Metropolitan University with a B.Sc. in Chemistry in 2014, where he majored in organic, inorganic, physical and analytical chemistry. He is currently completing a Ph.D. on the design and production of gold nanoparticles able to act as multimodal anticancer agents, being both drug delivery platforms and radiation dose enhancers.

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