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Che cosa è un virus del RNA Unico Incagliato Positivo-Senso (+ssRNA)?

I virus possono essere differenziati hanno basato su come memorizzano le loro informazioni genomiche, quali da DNA o RNA a doppia elica. i virus del RNA unico incagliati Positivo-senso (+ssRNA) sono un tale modo ed è un aspetto chiave del ciclo contagioso del virus. Due esempi importanti dei virus di +ssRNA sono rispettivamente coronavirus 2 (SARS-CoV-2) di sindrome respiratorio acuto severo e Hepatovirus A, che causano il coronavirus e l'epatite virale A.

RNACredito di immagine: nobeastsofierce/Shutterstock.com

Replica dei virus di +ssRNA

La replica dei genoma di +ssRNA si presenta nel citoplasma della cellula ospite e spesso si presenta con il montaggio del nucleocapsid in cui il materiale genetico è imballato. Tuttavia, ci sono alcune eccezioni a questo, quale l'enterovirus. Ciò differisce dalla replica del DNA a doppia elica e dei virus a RNA, in cui i capsids vuoti sono fatti in primo luogo e più successivamente sono riempiti dal genoma.

Lo stretto rapporto fra la replica del genoma virale e la formazione del nucleocapsid significa che quel RNA genomica e la proteina del capsid sia altamente specifico per a vicenda. Malgrado questo, i virus di +ssRNA sono una diversa categoria di virus e la replica del RNA e la specificità d'imballaggio possono differire fra i virus strettamente connessi.

In molti casi, la replica dei virus di +ssRNA si presenta spontaneamente, senza trifosfato di adenosina e così nessun costo energetico. Gli esperimenti in vitro egualmente hanno indicato che l'installazione virale di +ssRNA dipende dalle interazioni fra le proteine e fra le proteine ed il RNA. I genoma sono i modelli per la traduzione e la replica, che è che cosa promuove le interazioni fra i fattori di replica di ospite e la replica del RNA a parecchi livelli.

Importanza dei virus di +ssRNA

i virus a RNA di Positivo-senso compongono più di un terzo di tutti i generi conosciuti del virus. Ciò include gli agenti patogeni importanti, ma anche molti virus sui listini ufficiali degli agenti potenziali di bioterrorismo. Questi tipi di usi dei virus ospitano i fattori a tutti i punti dell'infezione virale, quali l'entrata e la replica. Forse più d'importanza, i virus di +ssRNA possono modulare l'espressione genica e le difese del host cooptando i fattori ospite.

Il RNA del genoma di un virus di +ssRNA contiene soltanto i geni stati necessari per il ciclo contagioso ed è simultaneamente RNA messaggero. Il suo imballaggio dipende da vari segmenti, che è creduto per essere un adattamento per resistere alle mutazioni. Dato lo stretto rapporto fra il RNA e le proteine, una mutazione potrebbe interrompere il ciclo contagioso se l'imballaggio contasse su un numero limitato dei geni.

I host hanno tipicamente determinate difese contro questi tipi di virus. I deaminases endogeni sono stati conosciuti per modificare il RNA o il DNA degli agenti patogeni per difendere il host contro l'agente patogeno. In mammiferi, i deaminases dell'adenosina agenti su RNAs (anche chiamato ADARs) e il apolipoprotein la B mRNA modificare gli enzimi (APOBECs) esistono.

Questi agiscono su RNAs e su DNAs, in cui essi adenines del deaminate nei inosines e cytosines nei uracils per ADARs e APOBECs, rispettivamente. ADARs può agire direttamente sul +ssRNA virale o indirettamente modificando le trascrizioni di ospite, che a sua volta modifica la risposta cellulare. Di APOBECs composti intermedi del DNA dell'obiettivo tipicamente direttamente o interferendo con la trascrizione inversa da RNA a DNA.

COVID-19Credito di immagine: GEMELLI PRO STUDIO/Shutterstock.com

COVID-19 come virus di +ssRNA

Come altri coronaviruses, SARS-CoV-2 è un virus di +ssRNA. Mentre molto studio resta fare su COVID-19, ci sono alcuni segni che le molecole umane ospite tentano di limitare la diffusione del virus modificando il loro RNA con l'uso di ADARs e di APOBECs.

I pochi studi fatti hanno trovato i bassi livelli di modificare, ma alcuni hanno trovato che le parti delle trascrizioni cellulari altamente sono state modificate da ADARs. Modificare di APOBEC è stato osservato, che è impressionante poichè modificare di APOBEC è individuato raramente. C'è una tendenziosità affinchè APOBEC modifichi i fili di senso positivi, che possono poi pregiudicare l'intero genoma virale.

L'effetto completo modificare questo e della natura del genoma del virus di +ssRNA è ancora poco chiaro. Come citato, i virus di +ssRNA sono compatto e confrontano soltanto le informazioni genetiche necessarie, che possono essere nocive per il virus se là sta modificando l'avvenimento. Tuttavia, mentre modificare può causare il crollo di un virus, può anche aiutare nella sua evoluzione.

L'effetto di questi enzimi può essere di importanza clinica enorme per COVID-19. Per uno, una quantità importante della popolazione di cinese ha una mutazione in determinati enzimi di APOBEC, che possono influenzare la diffusione del virus.

Tuttavia, capire come questi enzimi stanno subendo una mutazione il genoma virale di +ssRNA di COVID-19 può anche potenzialmente esporre le regioni del virus che può essere usato per gli obiettivi terapeutici.

Riferimenti

  • Ahlquist, P., Noueiry, A., Lee, W., Kushner, D. e tintura, B., 2003. Fattori ospite nella replica del genoma del virus a RNA del Positivo-Filo. Giornale di virologia, 77(15), pp. 8181-8186.
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  • Di Giorgio, S., Martignano, F., Torcia, M., Mattiuz, G. e Conticello, S., 2020. Prova per RNA host-dipendente che modifica nel transcriptome di SARS-CoV-2. Avanzamenti di scienza, 6(25), p.eabb5813.
  • Mourier, T. et al., 2021. modificare Host-diretto del genoma SARS-CoV-2. Ricerca Commun, 538, 35-39 di biochimica Biophys.

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Last Updated: Mar 9, 2021

Sara Ryding

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Sara Ryding

Sara is a passionate life sciences writer who specializes in zoology and ornithology. She is currently completing a Ph.D. at Deakin University in Australia which focuses on how the beaks of birds change with global warming.

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