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Que é um vírus Único-Encalhado Positivo-Sentido do RNA (+ssRNA)?

Os vírus podem ser diferenciados basearam em como armazenam sua informação genomic, como pelo ADN ou o RNA dobro-encalhado. os vírus único-encalhados Positivo-sentido do RNA (+ssRNA) são uma tal maneira e é um aspecto fulcral do ciclo infeccioso do vírus. Dois exemplos importantes dos vírus de +ssRNA são o coronavirus 2 da Síndrome Respiratória Aguda Grave (SARS-CoV-2) e o Hepatovirus A, que causam o coronavirus e a hepatite A, respectivamente.

RNACrédito de imagem: nobeastsofierce/Shutterstock.com

Réplica de vírus de +ssRNA

A réplica de genomas de +ssRNA ocorre no citoplasma da pilha de anfitrião e ocorre frequentemente com o conjunto do nucleocapsid em que o material genético é empacotado. Contudo, há algumas exceções a este, tal como o enterovírus. Isto difere da réplica dos vírus dobro-encalhados do ADN e do RNA, onde os capsids vazios são feitos primeiramente e enchidos mais tarde pelo genoma.

A relação estreita entre a réplica do genoma viral e a formação do nucleocapsid significa que esse RNA genomic e a proteína do capsid seja altamente específico para se. Apesar disto, os vírus de +ssRNA são uma categoria diversa de vírus, e a réplica do RNA e a especificidade de empacotamento podem diferir entre vírus estreitamente relacionados.

Em muitos casos, a réplica de vírus de +ssRNA ocorre espontâneamente, sem ATP e assim nenhum custo energético. In vitro as experiências igualmente mostraram que o conjunto viral de +ssRNA depende das interacções entre proteínas e entre proteínas e RNA. Os genomas são os moldes para a tradução e a réplica, que é o que promove interacções entre os factores de réplica do anfitrião e a réplica do RNA a diversos níveis.

Importância de vírus de +ssRNA

os vírus do RNA do Positivo-sentido compo mais de um terço de todos os géneros conhecidos do vírus. Isto inclui os micróbios patogénicos importantes, mas igualmente os muitos vírus em lista oficiais de agentes potenciais do bioterrorismo. Estes tipos de vírus usam factores do anfitrião em todas as etapas da infecção viral, tais como a entrada e a réplica. Talvez mais importante, os vírus de +ssRNA podem modular a expressão genética e as defesas do anfitrião cooptando factores do anfitrião.

O RNA do genoma de um vírus de +ssRNA contem somente os genes necessários para o ciclo infeccioso e é simultaneamente um RNA de mensageiro. Seu empacotamento depende de diversos segmentos diferentes, que é acreditado para ser uma adaptação para suportar mutações. Dado a relação estreita entre o RNA e as proteínas, uma mutação poderia interromper o ciclo infeccioso se o empacotamento confiou em um número limitado de genes.

Os anfitriões têm tipicamente determinadas defesas contra estes tipos de vírus. Os deaminases endógenos foram sabidos para editar o RNA ou o ADN dos micróbios patogénicos para defender o anfitrião contra o micróbio patogénico. Nos mamíferos, os deaminases da adenosina actuando em RNAs (igualmente chamado ADARs) e o apolipoprotein B mRNA editando enzimas (APOBECs) existem.

Estes actuam em RNAs e em DNAs, onde eles adenines do deaminate em inosines e cytosines em uracils para ADARs e APOBECs, respectivamente. ADARs pode actuar directamente no +ssRNA viral ou indirectamente editando os transcritos do anfitrião, que altera por sua vez a resposta celular. De APOBECs intermediários do ADN do alvo tipicamente directamente ou interferindo com a transcrição reversa do RNA ao ADN.

COVID-19Crédito de imagem: GÊMEOS PRO STUDIO/Shutterstock.com

COVID-19 como um vírus de +ssRNA

Como outros coronaviruses, SARS-CoV-2 é um vírus de +ssRNA. Quando muito estudo permanecer ser feito em COVID-19, há alguns sinais que as moléculas humanas do anfitrião tentam restringir a propagação do vírus editando seu RNA com o uso de ADARs e de APOBECs.

Poucos estudos feitos encontraram baixos níveis de edição, mas alguns encontraram que as partes dos transcritos celulares estiveram editadas altamente por ADARs. A edição de APOBEC foi observada, que é impressionante dada que a edição de APOBEC está detectada raramente. Há uma polarização para que APOBEC edite as costas de sentido positivas, que podem então afectar o genoma viral inteiro.

O efeito completo da edição isto e da natureza do genoma do vírus de +ssRNA é ainda obscuro. Como mencionado, os vírus de +ssRNA são estojo compacto e comparam somente a informação genética necessária, que pode ser prejudicial para o vírus se lá está editando a ocorrência. Contudo, quando editar puder causar a cessão de um vírus, pode igualmente ajudar em sua evolução.

O efeito destas enzimas pode ser da importância clínica enorme para COVID-19. Para um, uma quantidade importante da população do chinês tem uma mutação em determinadas enzimas de APOBEC, que podem influenciar a propagação do vírus.

Contudo, compreender como estas enzimas se estão transformando o genoma viral de +ssRNA de COVID-19 pode igualmente potencial expr regiões do vírus que pode ser usado para alvos terapêuticos.

Referências

  • Ahlquist, P., Noueiry, A., Lee, W., Kushner, D., e tintura, B., 2003. Factores do anfitrião na réplica do genoma do vírus do RNA da Positivo-Costa. Jornal da virologia, 77(15), pp. 8181-8186.
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  • Di Giorgio, S., Martignano, F., Torcia, M., Mattiuz, G. e Conticello, S., 2020. Evidência para o RNA anfitrião-dependente que edita no transcriptome de SARS-CoV-2. Avanços da ciência, 6(25), p.eabb5813.
  • Mourier, T. e outros, 2021. edição Anfitrião-dirigida do genoma SARS-CoV-2. Biochem Biophys Res Commun, 538, 35-39.

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Last Updated: Mar 9, 2021

Sara Ryding

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Sara Ryding

Sara is a passionate life sciences writer who specializes in zoology and ornithology. She is currently completing a Ph.D. at Deakin University in Australia which focuses on how the beaks of birds change with global warming.

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