Applicazioni di ordinamento di Microfluidic Sanger

L'ordinamento di Microfluidic Sanger è l'entrata in vigore del metodo di Sanger di DNA che ordina su un chip; quindi, questo tiene conto la manipolazione dei liquidi alla dimensione di submicron. Richiedendo i volumi di campione molto più piccoli, l'ordinamento microfluidic di Sanger automatizza i trattamenti della reazione, della separazione e di rilevazione. La più piccola operazione di disgaggio fornisce il vantaggio di diminuzione dei tempi della diffusione ed il rapporto del superficie-area--volume significa che la transferenza del calore è migliorata mentre la dimensione è diminuita.

Credito: ktdesign/Shutterstock.com

Ancora, i sistemi microfluidic al micro- e al nano-disgaggio riflettono più esattamente l'ambiente cellulare, poichè i trattamenti di trasporto fisico-chimici della maggior parte della funzione di sistemi biologica agli stessi sottopongono a operazioni di disgaggio. Mentre i chip possono essere fabbricati economico in grandi numeri, i vantaggi di questa tecnologia stanno applicando ai laboratori nei campi biomolecolari quale l'analisi genetica.

DNA che ordina via l'ordinamento microfluidic di Sanger

Sebbene ci siano altri alti metodi di capacità di lavorazione di ordinamento del DNA, l'ordinamento microfluidic di Sanger è un metodo robusto, con una tariffa di errore bassa e le lunghezze lungamente colte (700-800 coppie di basi). Ciò rende il metodo particolarmente adatto ad ordinare i grandi nuovi genoma o i segmenti del genoma che altamente sono riorganizzati. Sanger che ordina gli impianti incorporando un deoxynucleotide fluorescente contrassegnato all'estremità terminale di una sequenza di DNA. Una sequenza può poi essere formata con le sequenze di DNA collocate nell'ordine dal contrassegno fluorescente base-specifico.

Il chip microfluidic comprende tutti i trattamenti importanti di Sanger che ordinano, compreso la depurazione del campione e del riciclaggio termico prima della separazione tramite l'elettroforesi. Le unità microfluidic completamente integrate tengono conto le connessioni efficienti fra i trattamenti del laboratorio, la perdita di minimizzazione e la diluizione di campioni. Ulteriori sviluppi del su chip trattato hanno formato la capacità di ordinare da denaturazione. I frammenti fluorescente contrassegnati di Sanger, che sono specifico basso di conclusione, denaturano in sequenza riscaldando. Mentre la temperatura di denaturazione correla con il numero delle basi, la diminuzione nel segnale fluorescente fornisce la sequenza bassa.

Unità e sequenziamento del genoma microfluidic completamente integrati

C'è una domanda espandentesi delle applicazioni mediche e personali di sequenziamento del genoma, con la ricerca per medicina personale in corso. Le varianti genetiche trovate in un genoma determinato hanno la capacità di essere usato come indicatori per:

  1. Diagnosi.
  2. Prognosi.
  3. Prevenzione di disordine.
  4. Obiettivi di trattamento.

Gli avanzamenti futuri in materia richiederanno il punto basilare di ordinamento del DNA. Mentre l'altro DNA che ordina i metodi ha un'più alta capacità di lavorazione, l'ordinamento microfluidic di Sanger raggiunge il DNA rapido ed a basso costo che ordina dalle singole copie del modello del DNA, che fa la tecnica adatta specialmente ad ordinare i grandi genoma dagli unicellulari.

Il DNA integrato microperla che ordina il bioprocessor (di MENTI) integra le tecnologie richieste per ampliare un singolo modello e poi realizzare l'ordinamento di Sanger. il modello del DNA della Unico copia è ampliato con le microperle functionalized mano di fondo in una soluzione del nanoliter. Le barbe clonali prodotte poi sono presentate al bioprocessor di MENTI che realizza l'ordinamento integrato di Sanger. Il nanoliter-volume integrato ordinando il sistema è stato indicato a per comprimere il costo, tempo e spazio rispetto all'intero ordinamento convenzionale di Sanger del genoma. L'unità microfluidic fornisce il potenziale per l'organizzazione del sistema realizzabile che può essere usato per l'ordinamento personale di capacità di lavorazione media.

Unità di Microfluidic e delineamento legale del DNA

L'ordinamento del DNA egualmente è richiesto per l'esame di brevi ripetizioni in tandem (STRs). STRs è brevi sequenze della variazione genetica chiamate polimorfismi che possono variare da personale. Lo STRs più variabile è utile per gli scopi umani dell'identificazione ed ordinariamente è utilizzato nei casi legali. dovuto questo, le unità microfluidic hanno la capacità di accelerare il DNA legale che profila dalle scene del crimine. Le tecniche di laboratorio multiple integrate in un chip forniscono una durata dell'analisi veloce. I chip tengono il campione in un ambiente microfluidic chiuso che diminuisce il rischio di contaminazione trasversale. Le unità di Microfluidic sono sia portatile che progettato frequentemente per monouso, significando essi forniscono la possibilità dell'analisi alla scena del crimine il rischio diminuito di contaminazione. Tuttavia, la maggior parte dei tipi dell'input per le unità microfluidic sono lysate o materiale genomica già depurativo, richiedente il pre-preparato. Alcune unità commerciali sono state sviluppate che utilizzano i tamponi orali come input, ma richiederanno la standardizzazione per la convalida di prova.

Sorgenti

  1. Yeo, L.Y. et al. 2011. Unità di Microfluidic per i bioapplications. Piccolo, 3, pp. 12-48. http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/smll.201000946/abstract
  2. Offit, K. 2011. Medicina personale: nuova genomica, vecchie lezioni. La genetica umana, 130, pp. 3-14. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3128266/
  3. Bruijns, B. et al. 2016. Unità per analisi legale del DNA, biosensori, 6, e41 di Microfluidic. http://www.mdpi.com/2079-6374/6/3/41
  4. Liu, P. & Mathies, R.A. 2009. Sistemi microfluidic integrati per analisi genetica ad alto rendimento, tendenze relative alla biotecnologia, 27, pp. 572-581. http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0167779909001206

Further Reading

Last Updated: Feb 26, 2019

Shelley Farrar Stoakes

Written by

Shelley Farrar Stoakes

Shelley has a Master's degree in Human Evolution from the University of Liverpool and is currently working on her Ph.D, researching comparative primate and human skeletal anatomy. She is passionate about science communication with a particular focus on reporting the latest science news and discoveries to a broad audience. Outside of her research and science writing, Shelley enjoys reading, discovering new bands in her home city and going on long dog walks.

Citations

Please use one of the following formats to cite this article in your essay, paper or report:

  • APA

    Stoakes, Shelley Farrar. (2019, February 26). Applicazioni di ordinamento di Microfluidic Sanger. News-Medical. Retrieved on November 21, 2019 from https://www.news-medical.net/life-sciences/Applications-of-Microfluidic-Sanger-Sequencing.aspx.

  • MLA

    Stoakes, Shelley Farrar. "Applicazioni di ordinamento di Microfluidic Sanger". News-Medical. 21 November 2019. <https://www.news-medical.net/life-sciences/Applications-of-Microfluidic-Sanger-Sequencing.aspx>.

  • Chicago

    Stoakes, Shelley Farrar. "Applicazioni di ordinamento di Microfluidic Sanger". News-Medical. https://www.news-medical.net/life-sciences/Applications-of-Microfluidic-Sanger-Sequencing.aspx. (accessed November 21, 2019).

  • Harvard

    Stoakes, Shelley Farrar. 2019. Applicazioni di ordinamento di Microfluidic Sanger. News-Medical, viewed 21 November 2019, https://www.news-medical.net/life-sciences/Applications-of-Microfluidic-Sanger-Sequencing.aspx.

Comments

The opinions expressed here are the views of the writer and do not necessarily reflect the views and opinions of News-Medical.Net.
Post a new comment
Post