Ribozimi artificiali

I ribozimi esistono in natura come molecole catalitiche del RNA che qualsiasi aiuto l'idrolisi delle loro proprie obbligazioni di phosphodiester o causa all'idrolisi delle obbligazioni nell'altro RNAs. Egualmente catalizzano l'attività dell'amminotransferasi del ribosoma. La ricerca sulla funzione e sulla struttura di queste molecole naturali piombo allo sviluppo dei ribozimi sintetici che sono fatti in laboratorio.

Per esempio, Tang ed il frangente hanno usato la selezione in vitro di RNAs dalla sequenza casuale RNAs per isolare la auto-fenditura del RNAs. Questi sintetici, auto-fendendo RNAs possiedono una buona attività enzimatica che le rende utili in parecchie aree della genetica, della genomica e della biologia molecolare. Alcuni dei ribozimi sintetici che sono stati preparati hanno strutture uniche, mentre altri somigliano al ribozima naturale della testa di martello. Ulteriori esempi dei ribozimi includono il ribozima della forcella, il Leadzyme e CONTRO il ribozima.

I metodi impiegati per scoprire i ribozimi artificiali sono basati su evoluzione darwiniana. L'approccio usa il fatto che il RNA ha la capacità di fungere da sia molecola catalitica come pure sorgente di informazioni genetiche (come DNA). Questa natura doppia di RNA fornisce un vantaggio enorme al ricercatore, che lo trova facile produrre le grandi popolazioni dei catalizzatori del RNA facendo uso degli enzimi della polimerasi.

Il transcriptase inverso è usato per subire una mutazione questi ribozimi dall'inverso che li trascrive nel vario cDNA che può poi essere ampliato con la PCR mutagena. I parametri di selezione possono variare in questi esperimenti. I tag della biotina in covalenza collegati al substrato sono usati per selezionare un ribozima della ligasi. Se una molecola dimostra l'attività richiesta della ligasi, la molecola attiva può essere recuperata facendo uso di una matrice dello streptaidin.

Lincoln e Joyce hanno continuato a creare un sistema del ribozima che potrebbe replica di auto dentro intorno un'ora. Questo sistema usa la concorrenza molecolare o l'evoluzione in vitro stabilire un paio del ribozima da una miscela degli enzimi del candidato. Ciascuno dei ribozimi sintetizza l'altro dagli oligonucleotidi sintetici, in assenza di tutta la proteina.

Sorgenti

  1. http://www.pharmacophorejournal.com/May-June2012-article2.pdf
  2. http://chemistry.osu.edu/~foster.281/biochem766/download/PDF_files/Lilley_TIBS03.pdf
  3. http://scottlab.ucsc.edu/scottlab/reprints/1996_Scott_TIBS.pdf
  4. http://www.scs.illinois.edu/silverman/docs/SilvermanPub52.pdf
  5. http://www.annualreviews.org/doi/abs/10.1146/annurev.biophys.30.1.457?journalCode=biophys.3

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Last Updated: Feb 26, 2019

Dr. Ananya Mandal

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Dr. Ananya Mandal

Dr. Ananya Mandal is a doctor by profession, lecturer by vocation and a medical writer by passion. She specialized in Clinical Pharmacology after her bachelor's (MBBS). For her, health communication is not just writing complicated reviews for professionals but making medical knowledge understandable and available to the general public as well.

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Comments

  1. sanjeev nirala sanjeev nirala India says:

    Absolutely brilliant

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