CRISPR-Cas14 : Découverte, fonctionnement, avantages

CRISPR-Cas14 est une variation du système de retouche de gène de CRISPR-CAS qui tire bénéfice d'être plus simple et plus petit que les autres versions. Le système neuf découvert actuel est appliqué à l'inducteur grand de la diagnose de CRISPR - les deux pour les maladies infectieuses et non contagieuses.

Saut à :

CRISPR-Cas14 est une variation du système de retouche de gène de CRISPR-CAS qui tire bénéfice dmolekuul_be | Shutterstock

CRISPR-CAS

Le système de CRISPR-CAS est une partie intégrante du système immunitaire procaryotique qui aide à fournir la résistance aux éléments génétiques actuels dans les plasmides et les bactériophages. CRISPR est abréviation des répétitions palindromiques courtes régulièrement interspaced groupées et Cas9 se rapporte à la protéine CRISPR-associée 9.

Ce système est présent dans les bactéries où il capte des segments d'ADN des virus qui les envahissent et produisent des choix de CRISPR. Ce choix aide les bactéries à rappeler la séquence virale et au cas où réattaqueriez du virus, les bactéries peut produire ces segments d'ARN à partir du choix de CRISPR et viser l'ADN viral. D'une certaine manière, il peut considérer un système immunitaire bactérien.

La découverte de CRISPR-Cas14

Bien que plusieurs enzymes derrière le mécanisme de défense de CRISPR-CAS aient été découvertes, on le réalise qu'il y a plusieurs variations de la protéine. Ainsi, laboratoire de Jennifer Doudna vérifié si autre et des formes plus simples des systèmes de Cas étaient présentes. Ils ont vérifié ceci en produisant une base de données de génome microbien et de metagenome pour rechercher les gènes non caractérisés de cas.

Par la suite, ils ont trouvé plusieurs gènes de Cas, tels que cas1, cas2, cas4, et cas14. Les indicatifs cas14 pour une plus petite protéine de Cas a un grammage de 40-70 kilodaltons. Ils ont environ 400-700 acides aminés et sont moitié de la taille d'autres protéines de Cas.

Quel est Cas14 ?

Il y a 24 variantes du gène cas14, qui sont groupées dans trois sous-groupes : cas14a.c. Toutes les protéines de Cas contiennent économisé un domaine de nucléase de RuvC indépendamment de la diversité de séquence. Cependant, cas14 est seulement présent dans les archéobactéries, pas bactéries. Ainsi, ce gène peut être plus primitif que l'autre version des protéines de Cas : cas9 et cas12. La petite taille du gène cas14 propose qu'elle pourrait agir en tant qu'effecteur autonome de CRISPR.

Cas14 comparé aux autres enzymes de Cas

Dans une étude, le gène cas14 a été copié avec le choix de CRISPR et exprimé en Escherichia coli. Dans les bactéries, Cas14 a pu gripper et par la suite fendre un ADN monocatenaire spécifique, assimilé à cas13 et à cas12. Cependant, ce clivage était plus spécifique que cas12 ou cas13, comme il exige d'une séquence spécifique de gRNA afin de fonctionner.

On lui a également montré que tandis que Cas9 exige une séquence de PAM, il n'y a aucune une telle condition pour Cas14.

La découverte que Cas14 vise l'ADN monocatenaire propose qu'elle puisse évolué pour défendre contre les virus monocatenaires d'ADN ou les éléments génétiques mobiles qui peuvent propager par les structures intermédiaires monocatenaires.

Avantages de Cas14

L'ajout de Cas14 permet l'ADN bicaténaire, l'ADN monocatenaire et l'ARN à trouver. De plus, la spécificité de la protéine Cas14 augmente la fidélité du polymorphisme unique de nucléotide (SNP).

C'est susceptible que CRISPR-Cas14 sera éventuellement employé pour aider à plusieurs domaines de la recherche, tels que le diagnostic des infections virales et microbiennes, ainsi que le dépistage et la modification des cellules cancéreuses. La recherche propose que ce système ait pu avoir été particulièrement efficace dans les écosystèmes qui est abondant dans les virus monocatenaires d'ADN.

Further Reading

Last Updated: Jun 20, 2019

Dr. Surat P

Written by

Dr. Surat P

Dr. Surat graduated with a Ph.D. in Cell Biology and Mechanobiology from the Tata Institute of Fundamental Research (Mumbai, India) in 2016. Prior to her Ph.D., Surat studied for a Bachelor of Science (B.Sc.) degree in Zoology, during which she was the recipient of an Indian Academy of Sciences Summer Fellowship to study the proteins involved in AIDs. She produces feature articles on a wide range of topics, such as medical ethics, data manipulation, pseudoscience and superstition, education, and human evolution. She is passionate about science communication and writes articles covering all areas of the life sciences.  

Citations

Please use one of the following formats to cite this article in your essay, paper or report:

  • APA

    P, Surat. (2019, June 20). CRISPR-Cas14 : Découverte, fonctionnement, avantages. News-Medical. Retrieved on October 18, 2019 from https://www.news-medical.net/life-sciences/CRISPR-Cas14-Discovery-Function-Advantages.aspx.

  • MLA

    P, Surat. "CRISPR-Cas14 : Découverte, fonctionnement, avantages". News-Medical. 18 October 2019. <https://www.news-medical.net/life-sciences/CRISPR-Cas14-Discovery-Function-Advantages.aspx>.

  • Chicago

    P, Surat. "CRISPR-Cas14 : Découverte, fonctionnement, avantages". News-Medical. https://www.news-medical.net/life-sciences/CRISPR-Cas14-Discovery-Function-Advantages.aspx. (accessed October 18, 2019).

  • Harvard

    P, Surat. 2019. CRISPR-Cas14 : Découverte, fonctionnement, avantages. News-Medical, viewed 18 October 2019, https://www.news-medical.net/life-sciences/CRISPR-Cas14-Discovery-Function-Advantages.aspx.

Comments

The opinions expressed here are the views of the writer and do not necessarily reflect the views and opinions of News-Medical.Net.
Post a new comment
Post