Analyse Frite-Seq : Modifications d'histone

L'immunoprécipitation Seqencing de chromatine (Frite-Seq) est un puissant outil qui permet à des chercheurs de vérifier et comprendre des interactions de protein−DNA et l'influence ceux-ci ont sur l'expression du gène et le fonctionnement de cellules.

Crédit d'image : YuriiHrb/Shutterstock

L'analyse Frite-Seq combine les analyses d'immunoprécipitation (ChIP) de chromatine et le prochain rétablissement ordonnançant (Seq) pour recenser les accepteurs d'ADN pour des facteurs de transcription et d'autres protéines en travers du génome. La technique a offert à des chercheurs l'analyse grande dans les événements réglementaires de gène qui se produisent dans l'état de santé et dans maladies variées.

Histones

Les histones sont de petites, simples protéines, se produisant habituellement au noyau de cellules, qui dispensent des brins d'ADN en nucleosomes. Tous les changements qui se produisent dans ces nucleosomes vraisemblablement sont associés à l'altération de la condition et du fonctionnement de la chromatine pendant la division cellulaire et la transcription.

Modification d'histone

Les histones subissent un large éventail de modifications goujon-de translation. Celles-ci se produisent principalement dans l'arrière d'aminé-borne de l'histone, qui s'étend de la surface nucleosome. Au moins deux mécanismes sont pensés pour expliquer comment ces modifications négocient le fonctionnement des chromosomes.

Le premier est que les modifications modifient la charge électrostatique d'une histone, entraînant sa modification de structure ou modifiant comment elle grippe à l'ADN. Le deuxième propose que les modifications produisent les sites aux lesquels les modules de reconnaissance de protéine peuvent gripper. La modification d'histone fournit un mécanisme épigénétique qui active une gamme des procédés sains et liés à la maladie essentiels à régler.

Les modifications épigénétiques sont des facteurs essentiels dans la régulation de l'expression des gènes et le fonctionnement du génome. Parmi les types variés de modifications épigénétiques, la modification d'histone est d'intérêt significatif aux chercheurs qui veulent comprendre le règlement d'épigénétique et de l'expression du gène dans différents types des cellules, des étapes cellulaires et d'environnements cellulaires.

Les modifications goujon-de translation d'histone affectent beaucoup de réactions basées sur chromatine et ceux qui influencent l'expression du gène sont particulièrement importantes puisqu'elles peuvent affecter des programmes entiers de transcription. Des anomalies dans le métabolisme des modifications goujon-de translation ont été associées au misregulation de l'expression du gène dans un certain nombre d'études in vitro.

Elles ont été également marquées avec les maladies humaines, y compris des troubles de cancer et d'immunodéficience. Par conséquent, le règlement des bornes d'histone et l'effet qu'elles ont sur l'association du modification-détail les protéines obligatoires est un endroit actuel d'intérêt significatif.

Déterminer le rôle des modifications d'histone concerne souvent analyser l'abondance de la modification et des associés obligatoires qu'elles agissent l'un sur l'autre avec.

Identification Frite-Seq de modification d'histone

Frite-Seq est devenue une technique robuste, courante et complète pour vérifier et mesurer des modifications goujon-de translation variées d'histone en travers du génome entier. Ces modifications, y compris la méthylation, acétylation, phosphorylation et ubiquitination, sont toute la clavette au fonctionnement du génome et la conservation de son intégrité.

Elles contribuent à l'amortissement des éléments transposables et jouent un rôle en réglant certains gènes pendant le développement. L'emplacement incorrect d'une modification peut avoir comme conséquence des phénotypes malsains de cellules comprenant ceux vus pendant le processus de vieillissement, en cas de cancer et en réponse à contester les conditions nutritionnelles ou environnementales.

Une approche courante dans l'analyse Frite-Seq est d'obtenir des profils Frite-Seq pour un échantillon expérimental (échantillon de la maladie) et un échantillon de référence (échantillon sain) et de les comparer pour recenser des différences dans les configurations de modification d'histone. Celles-ci peuvent alors être employées pour déterminer les gènes ou les mécanismes du règlement qui sont impliqués dans les procédés variés qui se produisent à l'étude ou la maladie.

Last Updated: Feb 26, 2019

Sally Robertson

Written by

Sally Robertson

Sally has a Bachelor's Degree in Biomedical Sciences (B.Sc.). She is a specialist in reviewing and summarising the latest findings across all areas of medicine covered in major, high-impact, world-leading international medical journals, international press conferences and bulletins from governmental agencies and regulatory bodies. At News-Medical, Sally generates daily news features, life science articles and interview coverage.

Citations

Please use one of the following formats to cite this article in your essay, paper or report:

  • APA

    Robertson, Sally. (2019, February 26). Analyse Frite-Seq : Modifications d'histone. News-Medical. Retrieved on June 26, 2019 from https://www.news-medical.net/life-sciences/ChIP-Seq-Analysis-Histone-Modifications.aspx.

  • MLA

    Robertson, Sally. "Analyse Frite-Seq : Modifications d'histone". News-Medical. 26 June 2019. <https://www.news-medical.net/life-sciences/ChIP-Seq-Analysis-Histone-Modifications.aspx>.

  • Chicago

    Robertson, Sally. "Analyse Frite-Seq : Modifications d'histone". News-Medical. https://www.news-medical.net/life-sciences/ChIP-Seq-Analysis-Histone-Modifications.aspx. (accessed June 26, 2019).

  • Harvard

    Robertson, Sally. 2019. Analyse Frite-Seq : Modifications d'histone. News-Medical, viewed 26 June 2019, https://www.news-medical.net/life-sciences/ChIP-Seq-Analysis-Histone-Modifications.aspx.

Comments

The opinions expressed here are the views of the writer and do not necessarily reflect the views and opinions of News-Medical.Net.
Post a new comment
Post