Análisis Viruta-Seq: Modificaciones de la histona

La inmunoprecipitación Seqencing de la cromatina (Viruta-Seq) es una herramienta potente que permite a investigadores investigar y entender acciones recíprocas del protein−DNA y la influencia éstos tiene en la expresión génica y la función de la célula.

Haber de imagen: YuriiHrb/Shutterstock

El análisis Viruta-Seq combina los análisis de la inmunoprecipitación (ChIP) de la cromatina y la generación siguiente que ordenan (Seq) para determinar los puntos de enlace de la DNA para los factores de la transcripción y otras proteínas a través del genoma. La técnica ha ofrecido a investigadores gran discernimiento en las acciones de regla del gen que ocurren en el estado de la salud y en diversas enfermedades.

Histonas

Las histonas son las proteínas pequeñas, simples, ocurriendo generalmente en el núcleo de célula, que ordenan cabos de la DNA en nucleosomes. Cualquier cambio que ocurra en estos nucleosomes probablemente se asocia a cambios en el estado y la función de la cromatina durante la división celular y la transcripción.

Modificación de la histona

Las histonas experimentan una amplia gama de modificaciones poste-de translación. Éstos ocurren principal en la cola de la amino-terminal de la histona, que extiende de la superficie nucleosome. Por lo menos dos mecanismos se piensan para explicar cómo estas modificaciones median la función de cromosomas.

El primer es que las modificaciones alteran la carga electroestática de una histona, causando su cambio estructural o alterando cómo ata a la DNA. El segundo sugiere que las modificaciones creen los sitios a los cuales los módulos del reconocimiento de la proteína pueden atar. La modificación de la histona ofrece un mecanismo epigenético que habilite un alcance de los procesos sanos y enfermedad-relacionados esenciales que se regularán.

Las modificaciones epigenéticas son factores cruciales en la regla de la expresión génica y de la función del genoma. Entre los diversos tipos de modificaciones epigenéticas, la modificación de la histona está de interés importante a los investigadores que quieren entender la regla de epigenético y de la expresión génica en diversos tipos de células, de escenarios celulares y de ambientes celulares.

Las modificaciones poste-de translación de la histona afectan a muchas reacciones cromatina-basadas y las que influencian la expresión génica son determinado importantes puesto que pueden afectar a programas enteros de la transcripción. Las anormalidades en el metabolismo de modificaciones poste-de translación se han asociado al misregulation de la expresión génica en varios estudios ines vitro.

También se han correlacionado con enfermedades humanas, incluyendo desordenes del cáncer y de la inmunodeficiencia. Por lo tanto, la regla de los marcadores de la histona y del efecto que tienen en la asociación de proteínas obligatorias modificación-específicas es un área en curso del interés importante.

El establecimiento del papel de las modificaciones de la histona implica a menudo el analizar de la abundancia de la modificación y de los socios obligatorios que obran recíprocamente con.

Identificación Viruta-Seq de la modificación de la histona

Viruta-Seq ha llegado a ser una técnica robusta, rutinaria y completa para investigar y medir diversas modificaciones poste-de translación de la histona a través del genoma entero. Estas modificaciones, incluyendo la metilación, acetilación, fosforilación y ubiquitination, son toda la llave a la función del genoma y la preservación de su integridad.

Contribuyen a imponer silencio de elementos transposable y desempeñan un papel en la regulación de ciertos genes durante el revelado. La colocación incorrecta de una modificación puede dar lugar a fenotipos malsanos de la célula incluyendo ésos considerados durante el proceso del envejecimiento, en casos de cáncer y en respuesta a desafiar estados alimenticios o ambientales.

Una aproximación común en análisis Viruta-Seq es obtener los perfiles Viruta-Seq para una muestra experimental (muestra de la enfermedad) y una muestra de referencia (muestra sana) y compararlas para determinar diferencias en las configuraciones de la modificación de la histona. Éstos se pueden entonces utilizar para establecer los genes o los mecanismos de la regla que están implicados en los diversos procesos que ocurren en el revelado o la enfermedad.

Fuentes:

Further Reading

Last Updated: Feb 26, 2019

Sally Robertson

Written by

Sally Robertson

Sally has a Bachelor's Degree in Biomedical Sciences (B.Sc.). She is a specialist in reviewing and summarising the latest findings across all areas of medicine covered in major, high-impact, world-leading international medical journals, international press conferences and bulletins from governmental agencies and regulatory bodies. At News-Medical, Sally generates daily news features, life science articles and interview coverage.

Citations

Please use one of the following formats to cite this article in your essay, paper or report:

  • APA

    Robertson, Sally. (2019, February 26). Análisis Viruta-Seq: Modificaciones de la histona. News-Medical. Retrieved on October 14, 2019 from https://www.news-medical.net/life-sciences/ChIP-Seq-Analysis-Histone-Modifications.aspx.

  • MLA

    Robertson, Sally. "Análisis Viruta-Seq: Modificaciones de la histona". News-Medical. 14 October 2019. <https://www.news-medical.net/life-sciences/ChIP-Seq-Analysis-Histone-Modifications.aspx>.

  • Chicago

    Robertson, Sally. "Análisis Viruta-Seq: Modificaciones de la histona". News-Medical. https://www.news-medical.net/life-sciences/ChIP-Seq-Analysis-Histone-Modifications.aspx. (accessed October 14, 2019).

  • Harvard

    Robertson, Sally. 2019. Análisis Viruta-Seq: Modificaciones de la histona. News-Medical, viewed 14 October 2019, https://www.news-medical.net/life-sciences/ChIP-Seq-Analysis-Histone-Modifications.aspx.

Comments

The opinions expressed here are the views of the writer and do not necessarily reflect the views and opinions of News-Medical.Net.
Post a new comment
Post