Frazione del DNA del DNA del ciarpame

Soltanto 2% della sequenza del DNA nel genoma umano è usato per fare le proteine, mentre il resto noncoding le sequenze del DNA senza funzione completamente spiegata, colloquialmente anche conosciuta come il DNA del ciarpame. In tutto evoluzione, il segmento di non codifica dei genoma eucariotici è stato ampliato dai vari meccanismi quali le eliminazioni o le inserzioni delle sequenze del DNA come pure tramite l'intero trattamento della duplicazione del genoma.

A differenza della parte di codifica, la regione di non codifica può variare immensamente nella dimensione - anche fra le specie strettamente connesse. Se confrontiamo la quantità di sequenza di DNA genomico di non codifica che allinea fra l'essere umano ed il mouse, la variabilità significativa nelle regioni differenti dei genoma può essere osservata e la frazione di DNA ripetitivo egualmente varia. La proporzione di funzionalità all'interno di tali regioni abbondanti di non codifica rimane una domanda polemica.

Frazione funzionale del genoma

Una massa delle sequenze del DNA può avere ruoli funzionali importanti, malgrado il fatto che non codifichino le proteine. La ricerca recente condotta tramite l'approccio evolutivo di alta risoluzione indica che complessivamente 8,2% (7.1-9.2%) del genoma umano possono essere reputati funzionali, che rappresenta tre volte più funzionalità una volta confrontato all'le controparti genetiche di un mouse.

Tantissime sequenze di non codifica producono le molecole del RNA che possono regolamentare l'espressione genica girandole in funzione e a riposo. Il DNA da cui tale RNA regolatore è trascritto può essere molto isolato dai geni che gestiscono, a volte anche situato sui cromosomi differenti. Altre sequenze del DNA contengono il rinforzatore o gli elementi inibitori.

La proporzione significativa del genoma mammifero (13,6%) può funzionare via formazione di strutture secondarie del RNA altamente conservato e specifico. Poiché una miriade di loro funge da elementi di una struttura secondaria di importanza funzionale, sono usati spesso mentre uno strumento studiare la selezione evolutiva in più alti eucarioti.

Tre frazioni importanti di DNA eucariotico

Una grande frazione del DNA di non codifica in cella eucariotica sta formando le copie multiple delle sequenze del DNA nel genoma, citate generalmente come DNA ripetitivo. Mentre alcune di queste sequenze sono abbastanza brevi, altre possono essere significativamente più lunghe e sparpagliate alle varie posizioni all'interno del genoma. L'esistenza di queste sequenze ripetitive inizialmente è stata riconosciuta negli esperimenti dove il DNA eucariotico denaturato è stato osservato al renature nonuniformly; cioè alcuno di ha dimostrato una riassociazione più rapida una volta confrontato alla massa di DNA cellulare.

Circa 50-60% di DNA mammifero si riassocia ad una tariffa lenta, indicante che è fatto di soprattutto un DNA della unico copia. Poiché soltanto una copia di ogni gene è contenuta in tale insieme aploide del DNA, la frazione del DNA della unico copia contiene praticamente tutti geni che codificano il mRNA (e finalmente le proteine).

Per altri 25-40% per cento di DNA mammifero una tariffa intermedia della riassociazione è stata indicata. Questo DNA soprattutto è composto di tantissime copie, caratteristico per un numero relativamente piccolo delle famiglie di sequenza in un organismo specifico. Poiché queste sequenze possono a volte essere copiate e reinserite in un nuovo posto all'interno di un genoma, egualmente sono conosciute come elementi mobili del DNA.

Infine, circa 10-15% di DNA mammifero si riassocia ad una tariffa molto rapida. Questa riassociazione rapida del DNA ripetitivo egualmente si riferisce a come DNA di semplice-sequenza; è composta principalmente di vari insiemi di brevi (sequenze di fino a 10 coppie di basi) nelle schiere lunghe del tandem, ripetizioni adiacenti.

Sorgenti

  1. http://arxiv.org/ftp/q-bio/papers/0611/0611047.pdf
  2. http://www.pnas.org/content/111/17/6131.full
  3. http://www.plosgenetics.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pgen.1004525
  4. http://nar.oxfordjournals.org/content/41/17/8220.full
  5. http://www.yourgenome.org/dgg/general/genes/genes_1.shtml
  6. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK21571/

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Last Updated: Aug 23, 2018

Dr. Tomislav Meštrović

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Dr. Tomislav Meštrović

Dr. Tomislav Meštrović is a medical doctor (MD) with a Ph.D. in biomedical and health sciences, specialist in the field of clinical microbiology, and an Assistant Professor at Croatia's youngest university - University North. In addition to his interest in clinical, research and lecturing activities, his immense passion for medical writing and scientific communication goes back to his student days. He enjoys contributing back to the community. In his spare time, Tomislav is a movie buff and an avid traveler.

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