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Diferenciação entre a espécie microbiana

Diferenciar tensões bacterianas dentro de uma única amostra pode ser um desafio desanimado. Os estudos microscópicos da amostra podem ser usados para tarefas simples da identificação e da diferenciação.

Os microbiologista podem identificar o micróbio por suas características morfológicas e documentar todos os organismos na amostra.

Manchando, cultivando, e os testes bioquímicos simples são outros métodos tradicionais para distinguir entre a espécie microbiana.

Os marcescens do Serratia são umas espécies de bactérias relvado-negativas haste-dadas forma nos Enterobacteriaceae da família para a microbiologia do laboratório. Crédito de imagem: Rattiya Thongdumhyu/Shutterstock
Os marcescens do Serratia são umas espécies de bactérias relvado-negativas haste-dadas forma nos Enterobacteriaceae da família para a microbiologia do laboratório. Crédito de imagem: Rattiya Thongdumhyu/Shutterstock

Métodos tradicionais

As características microscópicas que podem ser usadas para identificar as bactérias incluem a forma total do micróbio. Os micróbios podem ser dados forma como as hastes, as esferas, ou as espirais, ou as outras formas.

A mancha do relvado é um teste muito comum usado para determinar o tipo de bactérias em uma cultura. Foi nomeada após o bacteriologista dinamarquês Hans Christian Gram.

Espécie que inclui roxo da volta do bacilo, do estafilococo, do estreptococo, e do clostridium com mancha do relvado.

Outras espécies gostam de Escherichia, Helicobacter, e as salmonelas são relvado-negativas, significando elas não mudam a cor com mancha do relvado.

Alguns exemplos do teste bioquímico incluem o teste do catalase, o teste da oxidase, e os testes da utilização da carcaça.

Métodos modernos

Contudo, porque algumas aplicações os números de bactérias são demasiado grandes, ou há um grande muitas espécies desconhecidas e outro os métodos são necessários para diferenciá-las.

Alguns métodos mais novos, mais sofisticados para diferenciar-se entre micróbios incluem a identificação PCR-baseada, a identificação microarray-baseada, e a identificação imunológica.

Na identificação PCR-baseada, o PCR do tempo real é usado para amplificar determinados genes que são arranjados em seqüência então para confirmar a identidade do micróbio.

Na identificação microarray-baseada, as seqüências microbianas do ADN são cruzadas às pontas de prova espécie-específicas do oligonucleotide em um formato da grade.

A identidade do micróbio pode então ser determinada encontrando o “endereço” na grade de um resultado positivo.

Um ensaio imunológico pode detectar a espécie de micróbios ligando anticorpos para proteínas espécie-específicas a um método de detecção tal como uma tintura.

Os métodos como o ácido gordo que perfila e queperfila podem igualmente distinguir micróbios diferentes de se.

As espécies microbianas têm frequentemente combinações originais de ácidos gordos ou de metabolitos que podem os distinguir de se.

Metagenomics

Em estudos do metagenomics, os pesquisadores tiveram o sucesso usando o genoma que arranja em seqüência para identificar micróbios em uma amostra.

Por exemplo, em um estudo da doença de Crohn, os pesquisadores estão usando arranjar em seqüência a explorar se determinadas espécies de bactérias influenciam a função do microbiota gastrintestinal nos pacientes com a doença de Crohn comparada com os indivíduos saudáveis, e que as assinaturas microbianas correlacionam com a ocorrência e a progressão da doença.

Em alguns casos, a diferenciação do espécie-nível não pôde ser bastante, e os cientistas podem precisar de identificar tensões individuais.

Em um caso, os oficiais dos E.U. encontraram que isso Shiga-toxina-produzir Escherichia Coli era a fonte de uma manifestação da intoxicação alimentar em Alemanha em 2005 e em 2006.

Os pesquisadores usaram o PCR e o nucleotide que arranjam em seqüência para identificar os subtipos de genes variantes específicos entre as tensões para identificar a tensão responsável para a manifestação.

Espectroscopia em massa

Os métodos instrumentais podem igualmente ser usados para diferenciar as bactérias. Por exemplo, os pesquisadores usaram a espectroscopia em massa do postionization da dessorção do laser para diferenciar a espécie e tensões microbianas em um biofilm da co-cultura.

Usaram cocultures de Escherichia Coli e de Saccharomyces Cerevisiae para imitar um sistema ecológico do biofilm do produtor-consumidor natural.

Outros métodos da espectroscopia em massa que foram usados para diferenciar a espécie de bactérias são os espectros em massa do íon secundário (SIMS) e a espectroscopia em massa ajudada matriz da ionização da dessorção do laser (MALDI-MS).

Revisto pelo cavaleiro de Megan, BSc

Referências

  1. Microbiologia: a identificação do tensão-nível da estrada, https://www.nature.com/articles/nmeth.3837
  2. Análise de Metagenomic da estrutura e da função do microbiota humano na doença de Crohn, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000257.v2.p1 do intestino
  3. Identificação de tensões humano-patogénicos de Shiga Escherichia Coli deprodução do alimento por uma combinação de serotyping e da datilografar molecular de genes da toxina de Shiga, http://aem.asm.org/content/73/15/4769.full
  4. Diferenciação da espécie e de tensões microbianas em biofilms do coculture pela análise múltipla de espectros em massa do postionization da dessorção do laser, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3833099/
  5. Curso intensivo na identificação microbiana, https://bitesizebio.com/36644/methods-microbial-identification/

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Last Updated: Aug 23, 2018

Dr. Catherine Shaffer

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Dr. Catherine Shaffer

Catherine Shaffer is a freelance science and health writer from Michigan. She has written for a wide variety of trade and consumer publications on life sciences topics, particularly in the area of drug discovery and development. She holds a Ph.D. in Biological Chemistry and began her career as a laboratory researcher before transitioning to science writing. She also writes and publishes fiction, and in her free time enjoys yoga, biking, and taking care of her pets.

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