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Como importante é a variação de Intronic?

Que é variação intronic?

A maioria de genomas humanos tem uma variedade de introns que devem ser removidos um que um gene foi transcrito do ADN ao RNA, porque não codificam a informação para traduzir o RNA em proteínas. Porque as mutações intronic não afectam nenhuma seqüências proteína-baseada, são ignoradas geralmente ao tentar localizar variações genéticas normais ou patogénicos. Todavia, os introns compo ao redor 50% do genoma humano da não-codificação: podem ter alguns papéis administrativos importantes dentro do corpo.

Os Introns podem ser excepcionalmente grandes, e esclarecem a maioria da seqüência do ADN em genes humanos. Contudo, pouco é compreendido muito sobre seus implicações e testes padrões funcionais da variação estrutural. A perda de introns ocorre freqüentemente em genes evolutionarily antigos - que contrasta com perdas previamente descobertas de exons de sobreposição, observado menos frequentemente, e afecta geralmente somente genes primata-específicos.

Os supressões de Intronic, tendem conseqüentemente a ocorrer mais freqüentemente do que esperado, apesar de uma proporção significativa destes genes que têm funções evolucionárias essenciais e antigas. Esta descoberta era surpreendente, tantos como estudos mostrou a conservação relativamente alta das seqüências que codificam genes evolucionários.

Estava mais atrasada mostrada que estes supressões podem mostrar mudanças consideráveis do comprimento do locus do gene. Igualmente mostrou-se que um grande número estes supressões estão associados com sobre ou sob-expressão dos genes afetados.

A variação de Intronic pode afectar o risco da doença.Rost9 | Shutterstock

Que efeito a variação intronic tem na expressão genética?

A desordem recessivo autosomal do sistema múltiplo: A síndrome de Cockayne, é identificada por uma variedade de sintomas: microcefalia, inabilidade intelectual, prejuízo sensorial, falha severa do crescimento, sensibilidade cutâneo, e neuropatia periférica. Esta doença genética rara é ligada às variações os genes em ERCC8 e em ERCC6. As várias extensões da severidade foram caracterizadas de acordo com a idade do início e a sobrevivência de paciente - sem nenhuma correlação óbvia do fenótipo-genótipo.

Um estudo precedente detalhou o exemplo de dois irmãos que apresentam uma sobrevivência a longo prazo, contudo o fenótipo severo da síndrome de Cockayne. Uma variação intronic profunda homozygous do nucleotide, que causasse a inserção de um exon complexo dentro do transcrito ERCC8, foi identificada nos pacientes alterando os elementos regulamentares intronic mostrados para ser significativa para a definição do exon.

Outros estudam desde 2004 detalhes o aumento dos resultados clínicos e biológicos que provam possivelmente uma relação entre o retorno do colesterol do cérebro e a doença de Alzheimer, com os níveis cerebrais altos de colesterol que aumentam possivelmente a carga de Aβ.

A eliminação do colesterol cerebral exige dois mecanismos que são dependentes de Apolipoprotein E, assim como enzima do hydroxylase do colesterol 24. O objetivo deste estudo particular era observar e determinar uma variação significativa dentro do intron CYP46, junto com o genótipo de Apolipoprotein E como factores de risco para a doença de Alzheimer, assim como estabelecer uma correlação possível entre o polimorfismo Apolipoprotein/CYP46, e a taxa/extensão da progressão da doença.

A distribuição do genótipo CYP46 era maciça diferente nos pacientes com a doença de Alzheimer comparada ao controle. O genótipo de Apolipoprotein E ε4 foi encontrado para ser mais freqüente na doença de Alzheimer (41%) do que nos pacientes do controle (16%).

A relação das probabilidades para o risco da doença de Alzheimer em levar dos pacientes foi encontrada para ser 2,8; com os portadores de Apolipoprotein E ε4 que têm uma relação 4,05 das probabilidades. A relação das probabilidades para os pacientes que tiveram Apolipoprotein E ε4 e o CYP46 em seu genótipo era 17,75 - que demonstrou o efeito sinérgico no risco de contratar a doença de Alzheimer.

Nos pacientes com doença de Alzheimer confirmada, se o paciente teve um genótipo que contem CYP46 ao lado de Apolipoprotein E ε4 foi encontrado para ser mais provável experimentar uma diminuição cognitiva mais intensa quando observado em uma nomeação de uma continuação de 1 ano. Estes resultados, dão conseqüentemente a evidência directa que o Apolipoprotein E e os polimorfismo CYP46 aumenta synergistically o risco desenvolvendo a doença de Alzheimer, e igualmente influenciam a velocidade da diminuição cognitiva.

Em conclusão, onde era primeiro pensamento que as variações do intron não afectam o fenótipo nos seres humanos, os estudos recentes confirmaram que os efeitos destas variações intronic poderiam ser a causa atrás de uma variedade de doenças genéticas que eram uma vez provavelmente indescritíveis.

Fontes

  • Rigau M. e outros (2019). Intronic CNVs e variação da expressão genética em populações humanas. doi: 10.1371/journal.pgen.1007902
  • Schalk A. e outros (2018). Variação intronic profunda em emendar o elemento regulador do gene ERCC8 associado com a síndrome severa mas a longo prazo de Cockayne da sobrevivência. doi: 10.1038/s41431-017-0009-y
  • Borroni B. e outros (2004). Polimorfismo de Intronic CYP46 junto com o genótipo de ApoE na doença de Alzheimer esporádica: dos factores de risco aos moduladores da doença. https://doi.org/10.1016/j.neurobiolaging.2003.08.004

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Last Updated: Jul 15, 2019

Written by

Phoebe Hinton-Sheley

Phoebe Hinton-Sheley has a B.Sc. (Class I Hons) in Microbiology from the University of Wolverhampton. Due to her background and interests, Phoebe mostly writes for the Life Sciences side of News-Medical, focussing on Microbiology and related techniques and diseases. However, she also enjoys writing about topics along the lines of Genetics, Molecular Biology, and Biochemistry.

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