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Comment présenter des caractéristiques de cytométrie de flux dans une publication

La cytométrie de flux est une technique basée sur le laser très utilisée qui peut être employée pour mesurer et mesurer la taille de cellules, la granularité de cellules, les marqueurs cellulaires, et les composantes intracellulaires telles que des protéines et des nucléotides. Cette technique analytique fournit l'analyse simultanée de multiparamètre qui peut être employée pour supporter des conclusions en publications scientifiques.

cellules pour lPeeradach R | Shutterstock

Facteurs essentiels à considérer avant de publier des caractéristiques de cytométrie de flux

Installation et préparation des échantillons expérimentales

Avant de soumettre une publication, il est essentiel que les auteurs incluent une description détaillée du plan d'expérience. Cette description devrait comprendre le nombre d'expériences indépendantes qui ont été effectuées pendant l'étude et le nombre d'échantillons analysés pendant chaque expérience. La préparation des suspensions témoins ou de cellules analysées par cytométrie de flux doit également être expliquée.

Les méthodes de préparation de cytométrie de flux comprennent l'utilisation des protéases spécifiques pour l'isolement, filtration et lysis de n'importe quel type particulier de cellules, ainsi que réactifs de permeabilization et de fixation. Cette information assure la reproductibilité et aide d'autres chercheurs dans de futures expériences.

Acquisition de données

La méthodologie et les paramètres utilisés pour l'acquisition de données de cytométrie de flux devraient comprendre le constructeur de matériel, modèle, logiciel, lasers et puissances de laser, ainsi que les filtres d'émission optique qui ont été utilisés pour chaque réactif fluorescent.

La compensation ou les procédés mathématiques de rectification pour éliminer la superposition spectrale entre les fluorochromes doit également être décrite. En outre, les stratégies de masquage exactes, telles que l'utilisation de certaines caractéristiques de logiciel améliorent également la reproductibilité des expériences.

La taille de l'échantillon ou le numéro des cellules comptées dans la population d'intérêt et le nombre minimal d'événements pour une population cible doit également être indiquée.

Analyse des caractéristiques obtenues et d'exposé

L'analyse de caractéristiques attentive de l'immense quantité d'information obtenue à partir de la cytométrie de flux est une partie essentielle de n'importe quelle publication.

Plans de déclenchement

Quand la description déclenchant les plans, aspects tels que les grilles légères de dispersion, grilles sous tension-mortes, grilles de doublet et fluorescence-trouvant des grilles doit être adressée.

Définition des seuils

Il est critique que les auteurs incluent toute l'information concernant les contrôles qui ont été employés. Ceux-ci comprennent non souillé, biologique, l'isotype, la fluorescence sans-un ou les contrôles négatifs actuels dans la suspension de cellules.

Analyse statistique

L'analyse statistique, comprenant si la caractéristique représente une comparaison parmi un moyen, une médiane ou un pourcentage, devrait également être incluse.

Présentation des caractéristiques

Les auteurs peuvent choisir des types variés d'exposé, tels que le point ou les plots de densité, de mettre en valeur la population cellulaire d'intérêt. Quand considérer le point trace, il est important de marquer les deux haches et de les comprendre si une écaille linéaire ou logarithmique est employée.

Il a également recommandé que les anticorps ou les fluorophores sont directement marqués dans le plot. Des pourcentages devraient être indiqués dans des grilles, alors que le nombre d'événements totaux dans un plot devrait être indiqué dans le plot ou le chiffre légende.

Standardisation dans des caractéristiques de cytométrie de flux

En dépit de la large gamme d'applications de cytométrie de flux, cette technique a été contrôlée sur sa reproductibilité due au manque de méthodes normales pour comparer exactement des caractéristiques de cytométrie de flux.

La complexité des caractéristiques justifie le besoin de normes minimum. Les chercheurs de cytométrie de flux également tireraient bénéfice d'un cadre plus formalisé pour cette technique, y compris des directives sur expérimental et échantillonnent l'information, l'acquisition, l'analyse, et l'exposé des caractéristiques.

Conclusion

Pour améliorer la reproductibilité des caractéristiques obtenues à partir de l'analyse de cytométrique de flux et la rendre facile à comprendre pour des lecteurs, il est essentiel de comprendre des explications détaillées de la façon dont l'analyse a été exécutée. En incluant cette information, les chercheurs peuvent facilement valider la qualité des caractéristiques et de la conclusion tirées.

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Last Updated: Apr 3, 2019

Benedette Cuffari

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Benedette Cuffari

After completing her Bachelor of Science in Toxicology with two minors in Spanish and Chemistry in 2016, Benedette continued her studies to complete her Master of Science in Toxicology in May of 2018. During graduate school, Benedette investigated the dermatotoxicity of mechlorethamine and bendamustine; two nitrogen mustard alkylating agents that are used in anticancer therapy.

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