A rilevazione umana Basata a bloccaggio ibrida del papillomavirus contro la PCR

I tipi ad alto rischio di virus di papilloma umano (HPV) sono uno del fattore di rischio più importante per i carcinoma cervicali in donne. Convenzionalmente, la citologia del pap test e la PCR sono state usate per schermare per la presenza di HPV. Recentemente, una nuova prova dell'annuncio pubblicitario HPV è stata proposta per la diagnosi dell'analisi di bloccaggio dell'HPV-Ibrido.

Sfondo con il virus. Papillomavirus umano sulla superficie di una cella. Un modello è sviluppato facendo uso dei dati della struttura macromolecolare virale dalla banca dati della proteina (PDB 3J6R). Credito di immagine: Kateryna Kon/Shutterstock
Sfondo con il virus. Papillomavirus umano sulla superficie di una cella. Un modello è sviluppato facendo uso dei dati della struttura macromolecolare virale dalla banca dati della proteina (PDB 3J6R). Credito di immagine: Kateryna Kon/Shutterstock

Principio di rilevazione ibrida (HC) di bloccaggio HPV

Questa analisi usa un'analisi di ibridazione dell'acido nucleico dove i campioni con il DNA dell'obiettivo ibridano con una sonda del RNA di HPV. Gli ibridi di RNA-DNA poi sono catturati facendo uso di un microplate che è ricoperto d'anticorpi per gli ibridi di DNA-RNA. Questi poi sono individuati facendo uso di chemiluminescenza. Gli anticorpi hanno coniugato con fosfato alcalino e specifico per gli ibridi di DNA-RNA reagisca con gli ibridi che poi successivamente sono individuati facendo uso di un substrato chemiluminescente. L'amplificazione del segnale accade mentre parecchi anticorpi coniugati legano ad ogni ibrido. Il fosfato alcalino fende il substrato chemiluminescente, piombo all'emissione di indicatore luminoso che è catturato facendo uso di un luminometer. Se il DNA dell'obiettivo è presente, può essere individuato facendo uso della presenza di indicatore luminoso.

Misurazione del livello di sequenze ad alto rischio

Là due tipi di HPV: ad alto rischio ed a basso rischio. I tipi ad alto rischio includono: 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59 e 68, mentre i tipi a basso rischio includono: 6, 11, 42, 43 e 44. L'indicatore luminoso dal luminometer è misurato come unità luminose relative (RLU). Quando il RLU è maggior del valore di taglio, la presenza di tipi ad alto rischio è alta; considerando che, un valore basso di RLU ha indicato la presenza bassa di sequenze ad alto rischio.

Sensibilità e specificità della PCR contro HC

La sensibilità di una prova è la sua capacità di individuare correttamente un campione (o la vera tariffa positiva), mentre la specificità è la capacità di una prova di identificare correttamente un campione negativo (o la vera tariffa negativa). Le sensibilità e le specificità del metodo di HC e di PCR sono state determinate nei casi differenti. Nel caso delle lesioni intraepiteliali di prima scelta, la sensibilità dell'analisi di HC e la PCR erano 85,2 e 74,0%. In un altro studio sui neoplasma intraepiteliali cervicali, la specificità era 83,5% per la PCR e 85,4% per HC. La specificità delle entrambe prove era 80% in questo studio.

Tariffa premonitrice positiva e negativa della PCR contro HC

Il valore predittivo positivo è la probabilità che gli oggetti che hanno verificato il positivo in una prova sono effettivamente positivi per una circostanza, mentre il valore predittivo negativo è la probabilità che un campione che ha verificato la quantità negativa sia effettivamente negativo per una circostanza. In uno studio delle lesioni cervicali, i valori predittivi positivi e negativi della PCR erano 27% e 97%, mentre i valori predittivi positivi e negativi di HC erano 50% e 97%. Tuttavia, gli studi differenti riferiscono i risultati variabili. In un altro studio, i valori predittivi positivi di HC e la PCR per individuare le lesioni intraepiteliali erano 4,5% e 3,6%. I valori predittivi negativi di HC e della PCR sono stati riferiti per essere 99,6% e 99,5%.

Agreeability della Inter Prova (valore delle kappe di Cohen)

Gli studi egualmente hanno provato a misurare la tariffa di agreeability fra i metodi di HC e di PCR. Ciò è fatta facendo uso di una statistica chiamata il valore delle kappe di Cohen. Questa statistica misura l'inter accordo fra due parametri che misurano la stessa cosa. Gli studi differenti mostrano un valore delle kappe di circa 0,7, che mostra un accordo sostanziale fra la PCR e HC.

Vantaggi dell'analisi di HC sopra la PCR

Sebbene le entrambe prove abbiano simili livelli di valore predittivo negativo, la sensibilità e la specificità sono più alte per l'analisi di HC confrontata alla PCR. Inoltre, i punti nell'analisi di HC facilmente sono gestiti e possono essere eseguiti da un tecnico. Tuttavia, i punti nella PCR hanno richiesto parecchi punti che devono essere ottimizzati ad ogni punto.

Svantaggi dell'analisi di HC sopra la PCR

La prova ad alto rischio di HC HPV dovrebbe essere eseguita sui campioni che sono stati raccolti facendo uso dell'unità della raccolta del DNA di HC.  Inoltre, i campioni dovrebbero immediatamente essere collocati nel media del trasporto dell'esemplare ed essere memorizzati a -20°. Questa unità della raccolta non dovrebbe essere utilizzata per raccogliere i campioni dalle donne incinte. Determinati fattori, quale presenza di crema antifungosa, gelatina contraccettiva, irrigazione possono piombo ai risultati del falso negativo.
Sulla base di tutti questi fattori, i diversi laboratori devono decidere che il protocollo e l'analisi da seguire hanno basato sui requisiti specifici.

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Last Updated: Sep 19, 2018

Dr. Surat P

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Dr. Surat P

Dr. Surat graduated with a Ph.D. in Cell Biology and Mechanobiology from the Tata Institute of Fundamental Research (Mumbai, India) in 2016. Prior to her Ph.D., Surat studied for a Bachelor of Science (B.Sc.) degree in Zoology, during which she was the recipient of an Indian Academy of Sciences Summer Fellowship to study the proteins involved in AIDs. She produces feature articles on a wide range of topics, such as medical ethics, data manipulation, pseudoscience and superstition, education, and human evolution. She is passionate about science communication and writes articles covering all areas of the life sciences.  

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