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Importancia de estudiar el Interactome

Interactome refiere a todos los equipos de acciones recíprocas moleculares dentro de una célula. Aunque un interactome usado generalmente para las acciones recíprocas de la proteína-proteína, ellas pueda también referir a redes metabólicas o a redes reguladoras del gen.

Papel de Interactome en remedio

Las proteínas actúan raramente en el aislamiento en enfermedades. Un estado enfermo se asocia generalmente a la cohorte creciente de las proteínas de la transmisión de señales, de los factores metabólicos, y de la expresión génica. Así, analizar el interactome de las acciones recíprocas de la proteína-proteína usando enfermedad puede revelar todas las acciones recíprocas que upregulated o downregulated durante una enfermedad. Esto puede ofrecer pistas o ayudar en determinar que las moléculas o los equipos de moléculas necesiten ser apuntados para controlar o para curar la enfermedad.

Determinar genes de la enfermedad usando Interactome

Analizar el interactome de las acciones recíprocas de la proteína-proteína durante una enfermedad puede ayudar a destapar la expresión cuyo se aumentan los genes. Aunque el gen de la alto-producción que perfila técnicas esté también actualmente disponible, las aproximaciones red-basadas pueden destacar los procesos enfermedad-relacionados que pueden determinar más lejos genes enfermedad-relacionados. El estudio de tales redes ha llevado al descubrimiento de los genes enfermedad-relacionados de la novela.

Caracterización de la proteína desconocida

El interactome también se ha utilizado para caracterizar las funciones de proteínas desconocidas. Generalmente proteínas que obran recíprocamente juntas son también probable implicadas en similar o los mismos procesos biológicos. Así, encontrar a los socios que obran recíprocamente de una proteína o de un metabilito desconocida puede dar la indicación en cuanto a su función. Varios algoritmos se están utilizando para deducir las funciones de la proteína, incluyendo métodos directos e indirectos. Los métodos directos incluyen contar de la vecindad, integrando la información de diverso obrar recíprocamente partners para caracterizar la función de una proteína. En métodos directos, las propiedades topológicas de una red se determinan para reconocer el módulo de las proteínas cuyas acciones recíprocas se pueden atribuir a los procesos específicos.

Acciones recíprocas del Dominio-Dominio que predicen

Las proteínas consisten en generalmente dos o más dominios. En prokaryotes, dos tercios de proteína contienen multidomains, mientras que en eucariotas, los cuatro-quintos de proteínas contienen dominios múltiples. Las acciones recíprocas entre dos proteínas consisten en acciones recíprocas entre dos dominios específicos. La identificación de estos dominios es crítica a las acciones recíprocas de comprensión de la proteína-proteína. Uno de los métodos de rayar cada par del dominio está calculando la índice del número de acontecimientos de un par del dominio al número de acontecimientos independientes de esos dominios. Esta muesca determina la probabilidad de la acción recíproca entre dos dominios.

Determinar la red Motiffs

Las redes de Interactome pueden tener tallas y conectividades específicas. Sin embargo, diversas redes pueden mostrar semejanzas en su estructura local o global. Fue mostrado recientemente que diversas redes visualizan una frecuencia mucho más alta de configuraciones en su organización que qué sería preveída de red aleatoriamente ordenada. Ciertos adornos fueron encontrados para repetirse en una mayor frecuencia. La identificación de tales adornos puede ayudar en la deducción de señales de la tratamiento de la información dominante.

Comparación entre los organismos y los seres humanos modelo

Recientemente, interactomes comparados estudio diversos de una proteína entre los seres humanos y levadura, tornillo sin fin, mosca. Tales comparaciones de interactomes pueden determinar el grado de semejanza o de desemejanza entre las redes de diversas especies que contribuyan a la salud y a las enfermedades. El estudio observaba las acciones recíprocas >70,000 y encontró que un 42 de ellas eran comunes entre el ser humano, el tornillo sin fin y la mosca. Dieciséis de tal acción recíproca eran comunes a los cuatro conjuntos de datos.

Determinación de la localización subcelular de una proteína

La determinación de dónde una proteína localiza puede ser dominante entender cómo funciona. Actualmente, los métodos microscopia-basados se utilizan lo más extensamente posible para determinar dónde una proteína localiza. Sin embargo, dos proteínas que obran recíprocamente juntas también tienen una tendencia de tener mismo o situaciones subcelulares similares. Así, el interactome y la deducción de las acciones recíprocas de la proteína-proteína se pueden también utilizar para determinar la situación de una proteína. Diversos algoritmos se han desarrollado para que una aproximación red-basada prediga la situación de una proteína usando su red de la acción recíproca de la proteína-proteína.

Determinar Lejos-Objetivos de una droga

Las drogas obran recíprocamente con diversos objetivos moleculares para ejercer su efecto. Aunque obren recíprocamente principal con los objetivos específicos, también atan a menudo a las proteínas no específicas que se llaman los lejos-objetivos del `'. Usando un interactome de la substancia-proteína, los lejos-objetivos de una droga pueden ser predichos. Esta comprensión es crítica analizar la farmacología de una droga y reducir sus efectos secundarios.

Fuentes

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Last Updated: Aug 24, 2018

Dr. Surat P

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Dr. Surat P

Dr. Surat graduated with a Ph.D. in Cell Biology and Mechanobiology from the Tata Institute of Fundamental Research (Mumbai, India) in 2016. Prior to her Ph.D., Surat studied for a Bachelor of Science (B.Sc.) degree in Zoology, during which she was the recipient of an Indian Academy of Sciences Summer Fellowship to study the proteins involved in AIDs. She produces feature articles on a wide range of topics, such as medical ethics, data manipulation, pseudoscience and superstition, education, and human evolution. She is passionate about science communication and writes articles covering all areas of the life sciences.  

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