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Profilage de MicroRNA

Profilage de MicroRNA

MicroRNAs, ou miRNA, sont petit RNAs qui règlent l'expression du gène après que la transcription ait eu lieu. Ceci se produit dans les conditions physiologiques saines et les conditions malades dans beaucoup d'organismes. En raison de la gamme des procédés qu'ils aident à régler, miRNA peut fournir des biomarqueurs précieux dans des contextes de la maladie ; c'est pourquoi le profilage de l'expression de miRNA est un domaine d'études croissant.

Le miRNA d'Interestin

le miRNA sont court, les éclats d'ARN de non-codage qui aident à régler l'expression du gène. Après la transcription de l'ADN originel, l'ARN messager (ARNm) est relâché et le miRNA peut gripper à lui. Ce grippement introduit la dégradation de l'ARNm ou l'inhibition de la traduction, gênant de ce fait la formation de protéine. Le miRNA sont comparé inférieur en nombre aux objectifs d'ARNm, avec approximativement 1 miRNA pour chaque 30 ARNm. Cependant, ces quelque miRNA peut régler beaucoup d'ARNm et pour cette raison pour exercer un effet profond sur l'expression.

Vu qu'un miRNA peut potentiellement régler des centaines d'ARNm, on l'a impliqué que la configuration d'expression de ces centaines d'ARNm peut être captée dans un miRNA unique. Cette richesse d'information biologique fait appel aux chercheurs dans les domaines tels que la biologie du développement, la différenciation de tissu, et la maladie. le profilage de miRNA concerne l'analyse de l'expression du miRNA s'échelonnant de la substance à niveau à de plus petits groupes d'intérêt biologique.

Applications du profilage

le miRNA peut régler que les ARNm obtiennent traduits en protéines, et peut pour cette raison supprimer l'expression du gène inadéquate. En biologie du développement, la comparaison des profils de miRNA peut aider à montrer quel miRNA sont impliqué dans certains procédés de développement. Une telle recherche a prouvé que les profils de miRNA, ou l'expression crépite, peut être spécifique à certains types de cellules. De plus, le miRNA peut arrêter des passages de développement et aider à mettre à jour la condition de cellules une fois qu'elle a différencié. Ceci a abouti des chercheurs à croire que le miRNA peut avoir des applications précieuses en cellules souche de compréhension.

Dans des contextes de la maladie, le miRNA sont explorés comme sources des biomarqueurs de certaines maladies. les profils de miRNA des tissus sains et malades sont comparés pour recenser les biomarqueurs de la maladie et les objectifs thérapeutiques potentiels. Cette tactique a été utilisée dans les maladies de cancer, auto-immune, et neurologiques.

En particulier, le miRNA anormal sont d'intérêt thérapeutiquement et en étudiant la progression tumorale dans le cancer. La cause sous-jacente pour les différences dans l'expression de miRNA entre les tissus sains et malades peut être due aux mutations ponctuelles d'ADN, à la variation épigénétique, ou aux modifications chromosomiques aux gènes de miRNA. Dans le cancer, le profilage de miRNA a été également employé pour diagnostiquer cliniquement l'origine de cancer quand l'autre identification est difficile. le miRNA même a été utilisé dans les médecines légales pour des raisons similaires, car les profils de miRNA peuvent aider à discerner les types de liquide organique trouvés dans les scènes du crime.

Méthodes de profilage de miRNA

le profilage de miRNA peut être fait utilisant une gamme des méthodes, telles que l'amplification en chaîne par polymérase quantitative de transcription inverse (qRT-ACP), la puce ADN de miRNA, et l'ordonnancement d'ARN. QRT-ACP comporte la transcription inverse du miRNA dans l'ADNc, et l'ordonnancement suivant du produit.

Cette méthode est couramment appliquée à l'autre étude génétique et fait pour cette raison appel aux laboratoires déjà au courant de la méthode. Pour profiler le miRNA utilisant qRT-ACP, plusieurs miRNA s'analysent en parallèle dans les mêmes conditions de réaction. Cependant, le miRNA peut différer rigoureusement en leurs conditions optimales qui les moyens analysant le miRNA en parallèle peuvent être difficiles. Pour surmonter ceci, les chercheurs peuvent employer les acides nucléiques verrouillés (LNAs) dans les amorces eux-mêmes.

Les puces ADN analysent également plusieurs miRNA en parallèle pendant le profilage. Dans la puce ADN, le miRNA sont fluorescent étiquetés. des sondes basées sur ADN de saisie sont alors employées pour hybrider le miRNA étiqueté. Ces sondes peuvent ou peuvent ne pas contenir LNAs, juste comme dans qRT-ACP. Le choix est alors balayé, et la fluorescence est mesurée pour profiler le miRNA. Des puces ADN permettent à beaucoup plus d'échantillons d'être profilés en tandem, toutefois cette méthode est habituellement plus chère.

Une approche plus nouvelle au profilage de miRNA est l'ordonnancement de la deuxième génération. L'ARN ordonnançant (ARN-seq) est une telle méthode et est souvent considéré la technique neuve la plus puissante pour le profilage de miRNA. Comme qRT-ACP, dans ARN-seq l'échantillon subit la transcription inverse pour produire d'une bibliothèque d'ADNc. Des adaptateurs sont insérés en circuit aux extrémités des boucles d'ADNc et les échantillons sont amplifiés utilisant l'ACP. La caractéristique brute de séquence s'analyse utilisant la bio-informatique pour indiquer le miRNA connu. La prévision du miRNA neuf est également possible.

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Last Updated: Feb 26, 2019

Sara Ryding

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Sara Ryding

Sara is a passionate life sciences writer who specializes in zoology and ornithology. She is currently completing a Ph.D. at Deakin University in Australia which focuses on how the beaks of birds change with global warming.

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